Секвенирование полного митохондриального генома древнего человека, представителя новосвободненской культуры, указывает на ее возможную связь с культурой воронковидных кубков

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Методом широкомасштабного секвенирования впервые в России проанализирована полная последовательность митохондриального генома древнего человека - представителя новосвободненской археологической культуры. История изучения памятников эпохи ранней бронзы на Северном Кавказе насчитывает более 110 лет. Большинство археологов выделяют здесь единственную майкопскую культуру с двумя этапами развития, сформированную выходцами из Передней Азии в 3700-3600 годах до н. э. Однако характер ряда археологических находок, сделанных в 1979-1991 годах в станице Новосвободная (Республика Адыгея), и их сходство с артефактами культуры воронковидных кубков позволили предположить происхождение, отличное от майкопской культуры. В представленной работе с помощью методов геномного анализа изучены костные останки человека, найденные в районе станицы Новосвободной, возраст которых превышает 5500 лет. Однонуклеотидные полиморфизмы, обнаруженные в митохондриальном геноме этого человека, позволили отнести исследуемый образец к митохондриальной гаплогруппе V7. Таким образом, анализ полной нуклеотидной последовательности митохондриальной ДНК из костных останков, публикуемый в данной работе, в сочетании с результатами изучения археологических артефактов позволяет рассматривать найденные в станице Новосвободная артефакты как самостоятельное явление (археологическую культуру), тесно связанное с культурой воронковидных кубков.

Об авторах

А. В. Недолужко

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Автор, ответственный за переписку.
Email: nedoluzhko@gmail.com
Россия

Е. С. Булыгина

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: nedoluzhko@gmail.com
Россия

А. С. Соколов

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: nedoluzhko@gmail.com
Россия

С. В. Цыганкова

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: nedoluzhko@gmail.com
Россия

Н. М. Груздева

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: nedoluzhko@gmail.com
Россия

А. Д. Резепкин

Институт истории материальной культуры РАН

Email: nedoluzhko@gmail.com
Россия

Е. Б. Прохорчук

Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»; Центр «Биоинженерия» РАН

Email: prokhortchouk@biengi.ac.ru
Россия

Список литературы

  1. Yessen A.A. // M.: Soviet Archaeology // The chronology of “huge Kuban burial mounds” 1950, V.12
  2. Munchaev P.M. // The Caucasus in early Bronze Age. M.: Nauka 1975, P.416
  3. Munchaev P.M. // Maykop culture. Archaeology: Bronze Age of Caucasus and Central Asia. Early and middle Bronze Age of Caucasus. M.: Nauka 1994, P.158-225
  4. Rezepkin A.D. // Das frühbronzezeitliche Gräberfeld von Klady und die Majkop-Kultur in Nordwestkaukasien. Archäologie in Eurasien. M.: Leidorf 2000, V.10, P.74
  5. Rezepkin A.D. // Novosvobodnenskaya culture (on basis of “Klady” excavations). St.-Peterburg 2012, P.343
  6. Paabo S. // Nature 1985, V.314, №6012, P.644-645
  7. Haak W., Balanovsky O., Sanchez J., Koshel S., Zaporozhchenko V., Adler C., der Sarkissian C., Brandt G., Schwarz C., Nicklisch N. // PLoS Biol. 2010, V.8, №11, P.e1000536
  8. Green R.E., Krause J., Briggs A.W., Maricic T., Stenzel U., Kircher M. // Science. 2010, V.328, №5979, P.710-722
  9. Lorenzen E.D., Nogues-Bravo D., Orlando L., Weinstock J., Binladen J., Marske K.A., Ugan A., Borregaard M.K., Gilbert M.T., Nielsen R. // Nature 2011, V.479, №7373, P.359-364
  10. Rasmussen M., Guo X., Wang Y., Lohmueller K.E., Rasmussen S., Albrechtsen A., Skotte L., Lindgreen S., Metspalu M., Jombart T. // Science. 2011, V.334, №6025, P.94-98
  11. Ozawa T., Hayashi S., Mikhelson V.M. // J. Mol. Evol. 1997, V.44, №4, P.406-413
  12. Poinar H., Kuch M., McDonald G., Martin P., Paabo S. // Curr. Biol. 2013, V.13, №13, P.1150-1152
  13. Barnes I., Shapiro B., Lister A., Kuznetsova T., Sher A., Guthrie D., Thomas M.G. // Curr. Biol. 2007, V.17, №12, P.1072-1075
  14. Vilstrup J.T., Seguin-Orlando A., Stiller M., Ginolhac A., Raghavan M., Nielsen S.C., Weinstock J., Froese D., Vasiliev S.K., Ovodov N.D. // PLoS One. 2013. V. 8. № 2. e55950. 2013, V.8, №2, P.e55950
  15. Orlando L., Ginolhac A., Zhang G., Froese D., Albrechtsen A., Stiller M., Schubert M., Cappellini E., Petersen B., Moltke I. // Nature 2013, V.499, №7456, P.74-78
  16. Pakendorf B., Stoneking M. // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2005, V.6, P.165-183
  17. Allentoft M.E., Collins M., Harker D., Haile J., Oskam C.L., Hale M.L., Campos P.F., Samaniego J.A., Gilbert M.T., Willerslev E. // Proc. Biol. Sci. 2012, V.279, №1748, P.4724-4733
  18. Orlando L., Metcalf J.L., Alberdi M.T., Telles-Antunes M., Bonjean D., Otte M., Martin F., Eisenmann V., Mashkour M., Morello F. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009, V.106, №51, P.21754-21759
  19. Langmead B., Salzberg S.L. // Nat. Methods. 2012, V.9, №4, P.357-359
  20. Jonsson H., Ginolhac A., Schubert M., Johnson P.L., Orlando L. // Bioinformatics.` 2013, V.29, №13, P.1682-1684
  21. Koboldt D.C., Larson D.E., Chen K., Ding L., Wilson R.K. // Genome Res 2012, V.22, №3, P.568-576
  22. Kloss-Brandstatter A., Pacher D., Schonherr S., Weissensteiner H., Binna R., Specht G., Kronenberg F. // Hum. Mutat 2011, V.32, №1, P.25-32
  23. Simpson J.T., Wong K., Jackman S.D., Schein J.E., Jones S.J., Birol I. // Genome Res 2009, V.19, №6, P.1117-1123
  24. Garcia-Garcera M., Gigli E., Sanchez-Quinto F., Ramirez O., Calafell F., Civit S., Lalueza-Fox C. // PLoS One. 2011, V.6, №8, P.e24161
  25. Hofreiter M., Jaenicke V., Serre D., Haeseler A., Paabo S. // Nucleic Acids Research 2001, V.29, №23, P.4793-4799
  26. Dabney J., Knapp M., Glocke I., Gansauge M.T., Weihmann A., Nickel B., Valdiosera C., Garcia N., Paabo S., Arsuaga J.L. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013, V.110, №39, P.15758-15763
  27. Sykes B. // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 1999, V.354, №1397, P.131-139
  28. Haak W., Forster P., Bramanti B., Matsumura S., Brandt G., Tanzer M., Villems R., Renfrew C., Gronenborn D., Alt K.W. // Science. 2005, V.310, №5750, P.1016-1018
  29. Kittles R. A., Bergen A. W., Urbanek M., Virkkunen M., Linnoila M., Goldman D., Long J.C. // Am. J. Phys. Anthropol. 1999, V.108, №4, P.381-399
  30. Achilli A., Rengo C., Magri C., Battaglia V., Olivieri A., Scozzari R., Cruciani F., Zeviani M., Briem E., Carelli V. // Am. J. Hum. Genet. 2004, V.75, №5, P.910-918
  31. Malmstrom H., Gilbert M.T., Thomas M.G., Brandstrom M., Stora J., Molnar P., Andersen P.K., Bendixen C., Holmlund G., Gotherstrom A. // Curr. Biol 2009, V.19, №20, P.1758-1762
  32. Willerslev E., Gilbert M.T., Gotherstrom A., Jakobsson M. // Science. 2012, V.336, №6080, P.466-469

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Недолужко А.В., Булыгина Е.С., Соколов А.С., Цыганкова С.В., Груздева Н.М., Резепкин А.Д., Прохорчук Е.Б., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах