Снижение риска инфицирования ВИЧ и летальности у гетерозигот по делеционному аллелю CCR5del32 гена хемокинового рецептора: исследование случая фокусной нозокомиальной ВИЧ-инфекции и мета-анализ

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Делеционный аллель CCR5del32 гена хемокинового рецептора R5 в гомозиготном состоянии почти полностью предотвращает инфицирование его носителей вирусом иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1). Однако данные о влиянии гетерозиготного носительства этого аллеля на риск инфицирования противоречивы. Мы исследовали влияние гетерозиготного носительства аллеля CCR5del32 на риск инфицирования, сравнивая частоты этого аллеля в группе детей (27 калмыков, 50 русских) с нозокомиальной ВИЧ-инфекцией (G-подтип ВИЧ-1) и в популяционных контрольных группах. В группе ВИЧ-инфицированных частота аллеля CCR5del32 оказалась ниже, чем в контрольной группе, но полученные различия были незначимыми. Аналогичные результаты приведены и в ряде ранее опубликованных статей. Незначимость различий может быть обусловлена либо случайным варьированием частот аллеля в отсутствие протективного эффекта, тогда при увеличении размера выборки различия частот останутся незначимыми, либо недостаточным размером выборки при наличии протективного эффекта. Поэтому, чтобы различить эти две возможности, мы провели мета-анализ опубликованных результатов 25 исследований (всего 5963 ВИЧ-инфицированных и 5048 индивидов в контрольных группах), включая наши собственные экспериментальные данные. Анализ показал, что аллель CCR5del32 в гетерозиготном состоянии препятствует инфицированию его носителей ВИЧ-1 (OR = 1.22, CI = 1.10-1.36). Риск инфицирования гетерозигот CCR5wt/del32 не менее чем на 13% ниже по сравнению с гомозиготами CCR5wt/wt. Подобные оценки для европеоидных групп получены впервые. В исследованной нами группе уровень смертности у гетерозиготных носителей аллеля CCR5del32 через 15 лет после инфицирования был на 40.9% ниже, чем в группе лиц, не имеющих этого аллеля. Размер изученной выборки был небольшим, а различия в уровне смертности в зависимости от генотипа по полиморфизму CCR5del32 статистически незначимыми (OR = 2.0; p = 0.705), однако полученные нами оценки качественно и количественно совпадают с ранее опубликованными данными. Обсуждаются особенности проведения мета-анализа, влияющие на пороговую величину выявляемых эффектов и их статистическую значимость. Оценено влияние частот аллеля CCR5del32 на межэтнические различия в инфицируемости ВИЧ и смертности от СПИДа.

Об авторах

С. A. Боринская

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

Ж. M. Кожекбаева

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Университет Майами

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

A. В. Залесов

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Московский физико-технический институт

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

E. В. Ользеева

Министерство здравоохранения и социального развития Республики Калмыкия

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

A. Р. Максимов

ГУ «Центр крови Республики Калмыкия»

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

С. И. Куцев

Ростовский государственный медицинский университет

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

M. M. Гараев

НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

A. В. Рубанович

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Российский национальный исследовательский медицинский университет

Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

Н. K. Янковский

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН; Московский физико-технический институт; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Автор, ответственный за переписку.
Email: yankovsky@vigg.ru
Россия

Список литературы

  1. Bridge J., Lazarus J.V., Atun R. // AIDS. 2010. V. 24. Suppl 3. P. S86-S94.
  2. Pokrovskiĭ V.V., Eramova I.Iu., Deulina M.O., Lipetikov VV., Iashkulov K.B., Sliusareva L.A., Chemizova N.M., Savchenko S.P. // Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. 1990. № 4. P 17-23.
  3. Pokrovskiĭ VV. Epidemiologiya i profilaktika VICh-infektsii i SPIDa (Epidemiology and prophylactics of HIV infection and AIDS). M: Meditsina. 1996. 275 p.
  4. Restrepo C., Rallon N.I., Carrillo J., Soriano V., Blanco J., Benito J.M. // AIDS Rev. 2011. V. 13. № 1. P. 30-40.
  5. Martinson J.J., Chapman N.H., Rees D.C., Liu Y.T., Clegg J.B. // Nat. Genet. 1997. V. 16. № 1. P. 100-103.
  6. Novembre J., Galvani A.P., Slatkin M. // PLoS Biol. 2005. V. 3. № 11. P. e339.
  7. Balanovsky O., Pocheshkhova E., Pshenichnov A., Solovieva D., Kuznetsova M., Voronko O., Churnosov M., Tegako O., Atramentova L., Lavryashina M., et al. // J. Physiol. Anthropol. Appl. Human Sci. 2005. V. 24. № 4. P. 375-382.
  8. Huang Y., Paxton W.A., Wolinsky S.M., Neumann A.U., Zhang L., He T., Kang S., Ceradini D., Jin Z., et al. // Nat. Med. 1996. V. 2. P. 1240-1243.
  9. Liu R., Paxton W.A., Choe S., Ceradini D., Martin S.R. // Cell. 1996. V. 86. P. 367-377.
  10. Samson M., Libert F., Doranz B.J., Rucker J., Liesnard C., Farber C.M., Saragosti S., Lapoumeroulie C., Cognaux J., Forceille C. // Nature. 1996. V. 382. P. 722-725.
  11. Dean M., Carrington M., Winkler C., Huttley G.A., Smith M.W., Allikmets R., Goedert J., Buchbinder S.P., Vittinghoff E., Gomperts E., et al. // Science. 1996. V. 273. P. 1856-1862.
  12. Marmor M., Sheppard H.W., Donnell D., Bozeman S., Celum C., Buchbinder S., Koblin B., Seage G.R., HIV Network for Prevention Trials Vaccine Preparedness Protocol Team. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2001. V. 27. № 5. P. 472-481.
  13. Agrawal L., Lu X., Qingwen J., VanHorn-Ali Z., Nicolescu I.V., McDermott D.H., Murphy P.M., Alkhatib G. // J. Virol. 2004. V. 78. P. 2277-2287.
  14. Oh D.Y., Jessen H., Kücherer C., Neumann K., Oh N., Poggensee G., Bartmeyer B., Jessen A., Pruss A., Schumann R.R., et al. // PloS One. 2008. V. 3. № 7. P. e2747.
  15. Hendel H., Hénon N., Lebuanec H., Lachgar A., Poncelet H., Caillat-Zucman S., Winkler C.A., Smith M.W., Kenefic L., O'Brien S., et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol. 1998. V. 19. P. 381-386.
  16. Misrahi M., Teglas J.P., N'Go N., Burgard M., Mayaux M.J., Rouzioux C., Delfraissy J.F., Blanche S. // JAMA. 1998. V. 279. P. 277-280.
  17. Ioannidis J.P., Contopoulos-Ioannidis D.G., Rosenberg P.S., Goedert J.J., De Rossi A., Espanol T., Frenkel L., Mayaux M.J., Newell M.L., Pahwa S.G., et al. // AIDS. 2003. V. 17. P. 1631-1638.
  18. Mulherin S.A., O'Brien T.R., Ioannidis J.P., Goedert J. J., Buchbinder S.P., Coutinho R.A., Jamieson B.D., Meyer L., Michael N.L., Pantaleo G., et al. // AIDS. 2003. V. 17. P. 377-387.
  19. Barroga C.F., Raskino C., Fangon M.C., Palumbo P.E., Baker C.J., Englund J.A., Spector S.A. // J. Infect Dis. 2000. V. 182. № 2. P. 413-419.
  20. Kazennova E.V., Aarons E., Selimova L.M., Ladnaia N.N., Kravchenko A.V., Zhemchugov V.E., Chaingon-Popov R., Weber J., Pokrovski! V.V., Bobkov A.F. // Vopr Virusol. 1998. V. 43 (1). P. 30-32.
  21. Shadrina M.I., Kapylov V.M., Miloserdova O.V., Slominskiĭ P. A., Limborskaia S.A. // Genetika. 2000. V. 36 (5). P. 718-720.
  22. Adojaan M., Mölder T., Männik A., Kivisild T., Villems R., Krispin T., Ustav M. // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2007. V. 23. № 2. P. 193-197.
  23. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Garaev M., Rzhaninova A., Kaleebu P., Beddows S., Bachmann M.H., Mullins J.I., Louwagie J., Janssens W., et al. // AIDS. 1994. V. 8. № 12. P. 1649-1655.
  24. Gafarova I.E., Shideeva Zh.A., Sandzhieva D.B., Garaev M.M. // Vopr Virusol. 2010. V. 55 (1). P. 16-22.
  25. Slominskiĭ P. A., Shadrina M.I., Spitsyn V.A., Mikulich V.A., Khusnutdinova E.K., Limborskaia S.A. // Genetika. 1997. V. 33 (11). P. 1596-1598.
  26. Abramson J.H. // Epidemiol. Perspectives & Innovations. 2004. V. 1. P. 6.
  27. Du Q., Wang F., Hong W., Liu M., Jin L., Shi H., Lei Z., E.E. // Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. 2000. V. 6. P. 413-416.
  28. Magierowska M., Lepage V., Boubnova L., Carcassi C., de Juan D., Djoulah S., El Chenawi F., Grunnet N., Hallo L., Ivanova R., et al. // Immunogenetics. 1998. V. 48. P. 417-419.
  29. Kozhekbaeva G.M., Borodina T.A., Borinskaia S.A., Gusar V.A., Feshchenko S.P., Akhmetova V.L., Khusainova R.I., Gupalo E.Iu., Spitsyn V.A., Grechanina E.Ia., Khusnutdinova E.K., Iankovskiĭ N.K. // Genetika. 2004. V. 40 (10). P. 1394-1401.
  30. Aseev M.V., Shaui A., Baranov V.S. // Russ J. Genet. 1997. V. 33 (12). P. 1724-1726.
  31. Libert F., Cochaux P., Beckman G., Samson M., Aksenova M., Cao A., Czeizel A., Claustres M., de la Rúa C., Ferrari M., et al. // Hum. Mol. Genet. 1998. V. 7. № 3. P. 399-406.
  32. Voevodin A., Samilchuk E., Dashti S. // J. Med. Virol. 1998. V. 55. P. 147-151.
  33. Limborska S.A., Balanovsky O.P., Balanovskaya E.V., Slominsky P. A., Schadrina M.I., Livshits L.A., Kravchenko S.A., Pampuha V.M., Khusnutdinova E.K., Spitsyn V.A. // Hum. Hered. 2002. V. 53. № 1. P. 49-54.
  34. Yudin N.S., Vinogradov S.V., Potapova T.A., Naykova T.M., Sitnikova V.V., Kulikov I.V., Khasnulin V.I., Konchuk C., Vloschinskii P.E., Ivanov S.V., et al. // Hum. Genet. 1998. V. 102. P. 695-698.
  35. Riabov G.S., Kazennova E.V., Korepanova L.B., Mal'tseva E.A., Zhalnin V.V., Krasnikova L.A., Zverev S.Ia., Pokrovskiĭ V.V., Bobkov A.F., Weber J.N. // Vopr Virusol. 2002. V. 47 (4). P. 13-16.
  36. Ryabov G.S., Kazennova E.V., Bobkova M.R., Bobkov A.F. // Genet. Test. 2004. V. 8. № 1. P. 73-76.
  37. Morawetz R.A., Rizzardi G.P., Glauser D., Rutschmann O., Hirschel B., Perrin L., Opravil M., Flepp M., von Overbeck J., Glauser M.P., et al. // Eur. J. Immunol. 1997. V. 27. № 12. P. 3223-3227.
  38. Lucotte G. // Hum. Immunol. 2001. V. 62. № 9. P. 933-936.
  39. Zimmerman P. A., Buckler-White A., Alkhatib G., Spalding T., Kubofcik J., Combadiere C., Weissman D., Cohen O., Rubbert A., Lam G., et al. // Mol. Med. 1997. V. 3. P. 23-36.
  40. Eugen-Olsen J., Iversen A.K., Garred P., Koppelhus U., Pedersen C., Benfield T.L., Sorensen A.M., Katzenstein T., Dickmeiss E., Gerstoft J., et al. // AIDS. 1997. V. 11. P. 305-310.
  41. Balotta C., Bagnarelli P., Violin M., Ridolfo A.L., Zhou D., Berlusconi A., Corvasce S., Corbellino M., Clementi M., Clerici M., et al. // AIDS. 1997. V. 11. № 10. P. 67-71.
  42. Stewart G.J., Ashton L.J., Biti R.A., Ffrench R.A., Bennetts B.H., Newcombe N.R., Benson E.M., Carr A., Cooper D.A., Kaldor J.M. // AIDS. 1997. V. 11. № 15. P.1833-1838.
  43. Pastinen T., Liitsola K., Niini P., Salminen M., Syvänen A.C. // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. V. 14. № 8. P. 695-698.
  44. Poljak M., Tomazic J., Seme K., Maticic M., Vidmar L. // Acta Virol. 1998. V. 42. № 1. P. 23-26.
  45. Alvarez V., López-Larrea C., Coto E. // Hum. Genet. 1998. V. 102. № 4. P. 483-486.
  46. Ruiz A., Royo J.L., Rubio A., Borrego S., Leal M., Sánchez B., Nuñez-Roldán A., Antiñolo G. // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2001. V. 17. № 2. P. 191-193.
  47. Barber Y., Rubio C., Fernández E., Rubio M., Fibla J. // J. Infect Dis. 2001. V. 184. № 10. P. 1279-1288.
  48. Barabás E., Kemény B., González R., Várkonyi V., Nagy K., Horváth A. // Int. J. STD AIDS. 2002. V. 13. № 10. P. 691-697.
  49. Philpott S., Burger H., Charbonneau T., Grimson R., Vermund S.H., Visosky A., Nachman S., Kovacs A., Tropper P., Frey H., et al. // J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 1999. V. 21. № 3. P. 189-193.
  50. Bogner J.R., Lutz B., Klein H.G., Pollerer C., Troendle U., Goebel F.D. // HIV Med. 2004. V. 5. № 4. P. 64-72.
  51. Liu H., Hwangbo Y., Holte S., Lee J., Wang C., Kaupp N., Zhu H., Celum C., Corey L., McElrath M.J. // J. Infect. Dis. 2004. V. 190. № 6. P. 1055-1058.
  52. Wasik T.J., Smoleń J., Kruszyński P., Bratosiewicz-Wasik J., Beniowski M. // Wiad Lek. 2005. V. 58. № 9-10. P. 500-507.
  53. Trecarichi E.M., Tumbarello M., de Gaetano Donati K., Tamburrini E., Cauda R., Brahe C., Tiziano F.D. // AIDS Res Ther. 2006. V. 25. P. 3-22.
  54. Takácová M., Nogová P., Hábeková M., Staneková D. // AIDS. 2008. V. 11. № 15. P. 1833-1838.
  55. Parczewski M., Leszczyszyn-Pynka M., Kaczmarczyk M., Adler G., Binczak-Kuleta A., Loniewska B., Boron-Kaczmarska A., Ciechanowicz A. // J. Appl. Genet. 2009. V. 50. № 2. P. 159-166.
  56. Egger M., Smith G.D., Schneider M., Minder C. // Br. Med. J. 1997. V. 315. P. 629-634.
  57. Viera A.J. // South Med. J. 2008. V. 101. № 7. P. 730-734.
  58. Salkowitz J.R., Purvis S.F., Meyerson H., Zimmerman P., O'Brien T.R., Aledort L., Eyster M.E., Hilgartner M., Kessler C., Konkle B.A., et al. // Clin. Immunol. 2001. V. 98. № 2. P. 200-211.
  59. Lederman M.M., Alter G., Daskalakis D.C., Rodriguez B., Sieg S.F., Hardy G., Cho M., Anthony D., Harding C., Weinberg A., et al. // J. Infect. Dis. 2010. V. 202. Suppl. 3. P. S333-S338.
  60. Parczewski M., Bander D., Leszczyszyn-Pynka M., Urbanska A., Kaczmarczyk M., Ciechanowicz A., Boron-Kaczmarska A. // PLoS One. 2011. V. 6. № 7. P. e22215 (1-11).
  61. He X.F., Jia Y. J., Su J., Chen Q., Zhu W.C., Yu S.Y. // Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao. 2011. V. 31. № 5. P. 791-795.
  62. Piacentini L., Biasin M., Fenizia C., Clerici M. // J. Intern. Med. 2009. V. 265. № 1. P. 110-124.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Боринская С.A., Кожекбаева Ж.M., Залесов A.В., Ользеева E.В., Максимов A.Р., Куцев С.И., Гараев M.M., Рубанович A.В., Янковский Н.K., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах