Роль проходящей транскрипции в активности PRE у Drosophila melanogaster

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Поддержание индивидуальных профилей экспрессии генов в клетках разного типа необходимо для дифференцировки и развития многоклеточных организмов. Экспрессия многих генов контролируется белками групп Polycomb (PcG) и Trithorax (TrxG), которые действуют посредством ассоциации с хроматином. Мишенями PcG/TrxG-факторов являются ДНК-элементы, названные PRE (Polycomb Response Elements), активность которых можно модулировать, переключая их с репрессии на активацию. В данной работе проанализировано влияние проходящей транскрипции на переключение активности PRE, опосредованное дрожжевым активатором транскрипции GAL4. Показано, что терминатор транскрипции, встроенный между промотором и PRE-элементом, не препятствует переключению PRE с репрессии на активацию. Вне зависимости от ориентации PRE сильная транскрипция в отсутствие терминатора не приводит к удалению белков PcG/TrxG с PRE. Таким образом, транскрипция не имеет определяющего значения в переключении активности PRE.

Ключевые слова

Полный текст

ВВЕДЕНИЕ В процессе развития многоклеточных организмов паттерн экспрессии генов в клетках разного типа устанавливается на ранних стадиях развития и за тем поддерживается на протяжении многих кле точных делений. За стабильное наследование пра вильного паттерна отвечают белки групп Polycomb (PcG) и Trithorax (TrxG). Белки PcG обуславливают репрессию, а TrxG - активацию транскрипции [1- 4]. У дрозофилы эти факторы связываются с ДНК элементами, называемыми PRE (Polycomb Response Elements). Элементы PRE содержат сайты различ ных ДНК-связывающих факторов, привлечение которых приводит к ассоциации комплексов PcG/ TrxG с PRE [5, 6]. Белки группы Polycomb представ лены тремя основными комплексами: PRC1, PRC2 и PhoRC [2, 3]. Коровыми субъединицами комплекса PRC1 являются факторы PC, PH, dRing и Psc [7-9]. Комплекс PRC2 содержит коровые компоненты E(z), Esc, Su(z)12 и Caf1 [10-13]. В состав комплекса PhoRC входят dSfmbt и ДНК-связывающий фактор Pho [14]. Комплекс PRC2 триметилирует лизин 27 в составе гистона H3 (H3K27me3) за счет SET-домена катали тической субъединицы E(z) [10-13]. Модификация H3K27me3 маркирует участки хроматина, репрес сированного PcG [15, 16]. Факторы группы TrxG представляют собой гетерогенную группу, в кото рую входят белки Trx, Trr, dCBP, Ash1, UTX и ДНК связывающий фактор GAF, известный также как Trl (Trithorax-like) [17]. PRE - это модулируемые элементы, репрессорную активность которых в трансгенных системах можно выключить либо энхансерами, либо экзогенным ак тиватором GAL4 дрожжей [18-24]. Ранее было вы двинуто предположение, что инактивация репрес сии обеспечивается за счет индукции активатором GAL4 транскрипции через PRE, что, в свою очередь, приводит к «сбрасыванию» PRE-ассоциированных репрессорных факторов с ДНК за счет прохождения РНК-полимеразы II и факторов транскрипции [24]. Однако недавно нами было показано, что даже сильная проходящая транскрипция не приво дит к полной элиминации белков с PRE-элемента bxd размером 660 п.н. в трансгенных конструкциях Drosophila [21]. Установлено, что проходящая транс крипция начиналась с минимального промотора гена hsp70, находящегося под контролем пяти сай тов связывания белка GAL4. При этом инактивация опосредованной PRE репрессии не зависела от того, направлена ли индуцируемая GAL4 транскрипция в сторону bxdPRE или нет. В представленной работе показано, что блокиро вание проходящей через bxdPRE транскрипции тер минатором SV40 не препятствует инактивации PRE. Также протестировано значение ориентации bxdPRE при проходящей транскрипции. Установлено, что и в обратной ориентации bxdPRE проходящая через него транскрипция не приводит к элиминации факторов PcG/TrxG. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ Создание плазмидных конструкций Все конструкции созданы на основе вектора CaSpeR, содержащего ген white c неполной делецией первого интрона (кодирует полноценный продукт гена white) [25]. Энхансер гена white (Ee), находящийся в геноме в положении -1180…-1849 п.н. относительно старта транскрипции гена white [26], был вырезан из плаз миды Ee-pBluescript SK+ [27] и встроен в прямой ориентации в вектор CaSpeR4 по NotI-сайту [Enwhite]. Фрагмент SmaI-SalI длиной 4324 п.н. плазмид ного вектора CaSpeR-hs43-lacZ, содержащий ген lacZ с лидерной областью adh и терминатор транс крипции SV40 на 3'-конце (GenBank: X81643.1), был встроен в вектор pBluescript SK+ по SmaI- и SalI сайтам [LacZ-SV40-pSK]. Промотор гена hsp26 длиной 472 п.н. амплифици ровали с помощью ПЦР (праймеры 5'-ctagaaacttcggctctctca- 3' и 5'-gttgaatgaacttgtttgacttgt-3') и встро или в вектор pBluescript SK+ по сайту эндонуклеазы рестрикции EcoRV [hsp26-pSK]. Фрагмент HindIII- PstI вектора hsp26-pSK встраивали в вектор LacZSV40 pSK по SmaI-сайту [hsp26-LacZ-SV40-pSK]. Фрагмент NotI-SalI вектора hsp26-LacZ-SV40 pSK встраивали в вектор En-white по BamHI-сайту [hsp26-LacZ-SV40-En-white]. Фрагмент HindIII-EcoRI, содержащий минималь ный промотор гена hsp70 и пять сайтов GAL4 с 5'-сто роны, вырезали из вектора pUAST [28] и встраива ли в вектор pBluescript SK+-sce2 по EcoRV-сайту [sce(UAS)]. Кодирующую область гена eGFP длиной 717 п.н. амплифицировали с помощью ПЦР (прайме ры 5'-atggtgagcaagggcgaggagct-3' и 5'-cttgtacagctcgtccatgccga- 3') и клонировали в вектор pBluescript SK+ по EcoRV-сайту [eGFP-pSK]. Фрагмент HindIII-EcoRI вектора eGFP-pSK встраивали в прямой ориентации в вектор sce(UAS) по HincII-сайту [(UAS)sce-eGFP]. Фрагмент XbaI-BamHI длиной 702 п.н. вектора pUAST, содержащего терминатор транскрипции, был встроен в вектор pBluescript SK+-lox2 по сай ту эндонуклеазы рестрикции EcoRV [lox(SV40)]. Фрагмент XbaI-XbaI вектора lox(SV40) встроен в вектор (UAS)sce-eGFP по XhoI-сайту [(UAS)sceeGFP lox(SV40)]. Фрагмент HincII-HincII длиной 1828 п.н. вектора LacZ-SV40-pSK был встроен в вектор pBluescript SK+ по сайту эндонуклеазы рестрикции EcoRV [linker1828bp-pSK]. Фрагмент XbaI-BamHI дли ной 222 п.н. вектора pGL3basic, содержащего тер минатор транскрипции SV40, встраивали в вектор linker1828bp-pSK по SmaI-сайту [linker1828-SV40spSK]. Фрагмент NotI-BamHI вектора (UAS)sce-eGFPlox( SV40) был встроен в вектор linker1828-SV40spSK по EcoRV-сайту [(UAS)sce-eGFP-lox(SV40) linker1828-SV40s-pSK]. Фрагмент HincII-XbaI, содержащий bxdPRE длиной 656 п.н. (3R:16764122..16764777), был вырезан из вектора frt(PRE) [29] и встро ен в вектор (UAS)sce-eGFP-lox(SV40)-linker1828- SV40s-pSK по AorI-сайту в прямой [(UAS)sce eGFP-lox(SV40)-linker785frt(PREdir)linker1043- SV40s-pSK] или обратной [(UAS)sce-eGFPlox( SV40)-linker785frt(PRErev)linker1043-SV40spSK] ориентации. Конструкция UDTPD. Фрагмент XbaI-XbaI векто ра (UAS)sce-eGFP-lox(SV40)-linker785frt(PREdir)linker1043- SV40s-pSK был встроен в вектор hsp26- LacZ-SV40-En-white по BamHI-сайту. Конструкция UDTPR. Фрагмент XbaI-XbaI векто ра (UAS)sce-eGFP-lox(SV40)-linker785frt(PRErev)linker1043- SV40s-pSK встраивали в вектор hsp26- LacZ-SV40-En-white по BamHI-сайту. Все детали создания конструкций могут быть пре доставлены по запросу. Трансформация эмбрионов Drosophila melanogaster и фенотипический анализ экспрессии генов yellow и white в трансгенных линиях ДНК-конструкции и Р-элемент с дефектными инвер тированными повторами P25.7wc, использованный как источник транспозазы [30], инъецировали в линию y1w1118 на стадии пребластодермального эмбриона со гласно [31, 32]. Выживших мух скрещивали с линией y1w1118. Трансгенных мух отбирали по фенотипическо му проявлению экспрессии гена white. Количество ко пий определяли методом Саузерн-блот-гибридизации с фрагментом гена white. Отбирали линии, содержа щие одну копию конструкции на геном. Для in vivo делеции фрагмента ДНК мух, содер жащих конструкцию, скрещивали с трансгенными мухами, экспрессирующими Flp (w1118; S2CyO, hs- FLP, ISA/Sco; +) или рекомбиназу Cre (y1w1; Cyo, P[w+,cre]/Sco; +) [33, 34]. Правильность удаления фрагмента подтверждали с помощью ПЦР. Для экспрессии GAL4 под контролем тубулиново го промотора использовали линию yw1118; P[w¯, tub- GAL4]117/TM3,Sb, производную Bloomington Stock Center #5138, из которой удален маркерный ген mini-white [35]. Экспрессию гена white определяли путем визуаль ной оценки пигментации глаз по стандартной шкале: красная окраска - пигментация глаз мух дикого типа (экспрессия гена white при полной стимуляции тка неспецифичным энхансером), белая окраска глаз на блюдается в отсутствие пигментации (полная инак тивация гена white). Разная степень мозаичности проявляется при репрессии. Для анализа фенотипов трансгенных мух исполь зовали самцов в возрасте 3-5 дней после вылупле ния, развившихся при температуре 25°C. Все детали скрещиваний, использованных для генетического анализа и вырезаний функциональных элементов, могут быть предоставлены по запросу. Иммунопреципитация хроматина (X-ChIP) Для каждого эксперимента было отобрано 150-200 мг взрослых мух. Иммунопреципитацию хроматина проводили в соответствии с методикой, описанной ранее [21]. Антитела Антитела к белкам PH [к фрагменту 86-520 а.о., ph-p-PA]; dSfmbt [1-348 а.о., Sfmbt-PB] [27]; PC [к фрагменту 191-354 а.о., Pc-PA]; TRX-N [к фрагменту 8-351 а.о., trx-PA]; GAF [к фрагменту 1-519 а.о., Trl- PB] [21] получены в кроликах. Антитела к H3K27me3: Abcam (ab6002, ChIP Grade). ПЦР в реальном времени с использованием Hot-Start Taq-ДНК-полимеразы ПЦР в реальном времени проводили на приборе С1000tm ThermalCycler (Bio-Rad) в объеме 25 мкл по следующему протоколу (на одну реакцию): 2.5 мкл 10 × буфера (0.5 M Tris-HCl pH 8.8, 0.5 M KCl, 15 мM MgCl2, 1% Tween 20), 2 мкл 25 мМ MgCl2, 0.5 мкл 10 мМ dNTP, 1.5 мкл каждого праймера (в концен трации 5 пмоль/мкл), 0.25 мкл SYBR Green100× (Sigma), 0.3 мкл Hot-Start Taq-ДНК-полимеразы («СибЭнзим»), 11.45 мкл mQ, 5 мкл пробы. Данные обсчитывали с использованием программы в прило жении к прибору Bio-Rad CFX Manager и Microsoft Excel. В качестве известных стандартов использова ли десятикратные разведения геномной ДНК дрозо филы в концентрации от 0.1 до 100 нг. Праймеры, ис пользованные для анализа материала, полученного при иммунопреципитации хроматина, методом ПЦР в реальном времени, указаны в таблице. РЕЗУЛЬТАТЫ Модельная система для изучения влияния транскрипции на рекрутирование белков групп Polycomb и Trithorax на PRE Влияние проходящей транскрипции на активность PRE изучали в составе трансгенных конструкций, интегрированных в геном D. melanogaster путем ми кроинъекции плазмидной ДНК в эмбрионы, за счет фланкирующих трансген 5’- и 3’-концов P-элемента. Использовали элемент bxdPRE размером 660 п.н. из регуляторной области гена Ubx [36, 37]. Этот PRE элемент хорошо изучен и имеет четкие сайты связы вания различных белков группы Polycomb/Trithorax (PcG/TrxG) [15, 21, 36, 37]. Созданы две конструкции, в которых bxdPRE встроен между UAS-промотором и репортерными ге нами: lacZ под контролем промотора гена hsp26 и ген white. Маркерный ген white отвечает за пигментацию глаз. Транскрипцию данного гена усиливали, встра ивая непосредственно перед ним тканеспецифичный энхансер, обеспечивающий повышенный уровень экспрессии гена white в глазах мух. Для блокирова ния внутренних транскриптов трансгена использова ли два терминатора: перед геном hsp26-lacZ и перед энхансером гена white. Для того чтобы заблокиро вать возможную транскрипцию в месте интеграции конструкции в геноме до индукции UAS, с 5’-сторо ны от bxdPRE встраивали дополнительный терми натор транскрипции SV40. В обеих конструкциях UAS-промотор направлен в сторону bxdPRE, однако в первой конструкции (UDTPD) bxdPRE находится в прямой ориентации, а во второй (UDTPR) - в об ратной ориентации по отношению к UAS-промотору (рис. 1). UAS-промотор, применяемый для направ ленной транскрипции через bxdPRE, представляет собой минимальный промотор гена hsp70, перед кото рым расположены пять сайтов связывания дрожже вого активатора GAL4. Этот промотор является ин дуцибельным. При индукции UAS-промотора (путем скрещивания трансгенных линий с линией, несущей ген GAL4 под контролем тубулинового промотора) достигается высокий уровень транскрипции. Ключевые элементы - терминатор SV40 и bxdPRE - в обеих конструкциях фланкированы сайтом LOX или FRT для сайт-специфических ре комбиназ Cre или Flp соответственно. Такой под ход позволяет in vivo удалять выбранные фрагмен ты ДНК и сравнивать экспрессию маркерного гена и функциональные изменения системы в присут ствии и в отсутствие ключевых элементов в одном и том же месте инсерции трансгена в геном. В результате трансформации конструкций по лучены четыре независимые трансгенные линии c bxdPRE в статусе репрессии для UDTPD (рис. 1A) и три - для UDTPR (рис. 1Б). Репрессия гена white усиливалась в гомозиготе. Этот эффект ха рактерен для PRE-элементов и называется PSS (Pairing Sensitive Silencing) [38]. Фенотипы транс генов UDTPD и UDTPR не отличались, т.е. эффек ты не зависели от ориентации bxdPRE. Делеция терминатора транскрипции, находящегося между UAS-промотором и PRE, не привела к изменению фенотипов. Вместе с тем, индукция UAS-промотора с помощью GAL4 привела к дерепрессии гена white как и при делеции терминатора, так и в исходных ли ниях. Таким образом, в исследуемой системе GAL4 инактивирует bxdPRE вне зависимости от ориен тации и присутствия терминатора между UAS промотором и bxdPRE. Транскрипция, проходящая через bxdPRE, не приводит к элиминированию факторов групп Polycomb и Trithorax с bxdPRE Ранее мы показали, что даже сильная транскрип ция не приводит к полной элиминации комплексов PcG/TrxG с bxdPRE, если в трансгене он находится в прямой ориентации. Нами протестировано влия ние проходящей транскрипции при противополож ной ориентации bxdPRE. С этой целью применили метод иммунопреципитации хроматина, выделенно го из взрослых мух, гомозиготных по конструкции, в присутствии и в отсутствие GAL4 (рис. 2). В ПЦР анализе использовали шесть участков конструкции: 1- UAS-промотор, 2 - кодирующая область гена eGFP, 3 - bxdPRE, 4 - кодирующая область гена LacZ, 5 - энхансер гена white, 6 - промотор гена white. В качестве положительного контроля взяли геномную область bxdPRE, расположенную рядом с элементом, использованным в трансгенных кон струкциях, а в качестве отрицательного - кодиру ющую область гена Ras64B. Иммунопреципитацию проводили с материала, полученного из трансгенной линии UDTPR (№ 2), в которой делетирован терми натор транскрипции SV40 (рис. 2). Показано, что пик связывания факторов PH (PRC1-комплекс, рис. 2А) и dSfmbt (PhoRC комплекс, рис. 2Б) приходится на bxdPRE в составе трансгена. Локализация данных факторов согласу ется с данными, согласно которым PH и dSfmbt обна руживаются преимущественно на PRE-элементах, но не в других районах домена, подверженного ре прессии [14, 15, 21, 39, 40]. При индукции транскрипции через bxdPRE уро вень связывания данных факторов падает, однако не исчезает полностью. Аналогичный результат по лучен при анализе влияния транскрипции на ре крутирование факторов PH и dSfmbt на bxdPRE, расположенный в трансгене в прямой ориентации относительно UAS-промотора [21]. Фактор PC комплекса PRC1 специфически взаи модействует с гистоном 3, триметилированным по ли зину в позиции 27 (H3K27me3) [41, 42]: модифика цией, характерной для хроматина, репрессируемого белками PcG [16, 40]. Связывание фактора PC, так же как и H3K27me3, в отличие от остальных коровых компонентов PcG не ограничивается PRE и покрыва ет более широкую область, подверженную репрессии [16, 21, 40, 43]. В согласии, в производной трансгена UDTPR выявлен более широкий профиль распределе ния фактора PС (рис. 2В) и модификации H3K27me3 (рис. 2Г). Введение активатора GAL4 не привело к полному элиминированию PC и H3K27me3, однако наблюдалось значимое снижение уровня их рекрути рования на bxdPRE и окружающие области трансгена. Дополнительно проанализировано связыва ние TrxG-факторов Trx (рис. 2Д) и GAF (рис. 2Е). Установлено, что индукция транскрипции через bxdPRE приводит к усилению связывания обоих факторов с bxdPRE примерно в 2 раза. Таким образом, прохождение транскрипции через PRE приводит к изменению соотношения в связыва нии PcG/TrxG-факторов, но не к полному «сбрасы ванию» этих белков с ДНК. ЗАКЛЮЧЕНИЕ За репрессию/активацию множества генов Drosophila отвечают белки группы PcG/TrxG [1-4], которые связываются с так называемыми PRE-элементами ДНК [5, 6]. В ряде работ показа но, что отсутствие PRE-опосредованной репрессии коррелирует с присутствием некодирующих транс криптов, проходящих через PRE [24, 44]. На осно вании этого предложена модель, согласно которой проходящая транскрипция физически «сбрасывает» PRE-ассоциированные факторы и замещает репрес сионные модификации гистонов на активные [24]. Несмотря на кажущуюся ясность, данная гипотеза не подвергалась прямой проверке. Однако согласно другим данным, некодирующие РНК локуса Ubx (lncRNA-bxd и lncRNA iab-8) свя заны с доменом, подверженным репрессии [45, 46]. Более того, несмотря на тщательные исследования, некодирующие РНК не обнаружены в районах PRE элементов некоторых локусов (invected, engrailed), что свидетельствует об отсутствии ключевой роли транскрипции, по крайней мере, в функционирова нии некоторых PRE [47]. Ранее мы проверили эффект транскрипции в опос редованном GAL4 переключении PRE-элемента [21]. В результате выяснилось, что даже сильная проходя щая через bxdPRE транскрипция не приводит к пол ной элиминации PcG/TrxG-факторов, но изменяет со отношение связывания данных белков - связывание PcG уменьшается, а TrxG - растет. Эффект транс крипции подробно проанализирован для bxdPRE, встроенного в трансген в прямой ориентации [21]. В то же время активное и неактивное состояния PRE из локуса vg коррелируют с проходящей некодирую щей транскрипцией с разных цепей ДНК [48]. Таким образом, направление транскрипции, проходящей через PRE, потенциально может быть решающим для активности этого элемента. Мы проверили эту возможность и выяснили, что изменение ориентации bxdPRE не приводит к изменению эффекта проходя щей транскрипции. Связывание факторов PcG/TrxG при транскрипции не исчезает, однако привлечение TrxG-белков Trx и GAF растет, а PcG-белков (PH, dSfmbt, Pc) снижается. Присутствие сильного терминатора SV40 между UAS-промотором и bxdPRE также не препятствует блокированию репрессии. Вероятно, сайты связы вания GAL4 сами по себе способны нейтрализовать PRE-зависимый сайленсинг, и проходящая через PRE транскрипция не играет определяющей роли в данном процессе. PRE-элементы регулируют гены, экспрессия которых должна меняться в ходе развития орга низма. Так, определенный ген должен экспресси роваться в определенных клетках на определенной стадии развития, а затем его экспрессия должна быть заблокирована. По всей видимости, связыва ние репрессорных факторов с PRE в его неактив ном состоянии необходимо для того, чтобы в опре деленный момент времени PRE мог быстро перейти в активное состояние и прекратить экспрессию ге на-мишени. Похожий по логике механизм описан для многих промоторов эукариот - это задержка РНК-полимеразы II. В этом случае с транскрипци онно неактивным промотором связывается РНК полимераза II и при необходимости быстро запу скает транскрипцию. Механизм связывания белков с PRE-элементом при активной проходящей транскрипции также не ясен. Известно, что с PRE ассоциирован ряд ДНК связывающих факторов с мотивом «цинковые паль цы». Возможно, транскрипция не препятствует пря мым ДНК-белковым контактам. С другой стороны, существует возможность того, что сохранение ком плексов на PRE при проходящей транскрипции об условлено контактами между PcG/TrxG-факторами и гистоновыми белками. Так, в составе белков PcG имеются домены, способные прямо взаимодей ствовать с нуклеосомами (например, MBT-домены dSfmbt и Scm) [14, 49, 50], а транскрипция не при водит к полной диссоциации нуклеосом [51]. Однако детали этих процессов в настоящее время не ясны и требуют дополнительных исследований.

×

Об авторах

П. В. Елизарьев

Институт биологии гена PAH

Email: yermaxbio@yandex.ru
Россия

Д. В. Ломаев

Институт биологии гена PAH

Email: yermaxbio@yandex.ru
Россия

Д. A. Четверина

Институт биологии гена PAH

Email: yermaxbio@yandex.ru
Россия

П. Г. Георгиев

Институт биологии гена PAH

Email: yermaxbio@yandex.ru
Россия

M. M. Ерохин

Институт биологии гена PAH

Автор, ответственный за переписку.
Email: yermaxbio@yandex.ru
Россия

Список литературы

  1. Beisel C., Paro R. // Nat. Rev. Genet. 2011, V.12, №2, P.123-135
  2. Muller J., Verrijzer P. // Curr. Opin. Genet. Dev. 2009, V.19, №2, P.150-158
  3. Schwartz Y.B., Pirrotta V. // Nat. Rev. Genet. 2013, V.14, №12, P.853-864
  4. Steffen P.A., Ringrose L. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2014, V.15, №5, P.340-356
  5. Kassis J.A., Brown J.L. // Adv. Genet. 2013, V.81, P.83-118
  6. McElroy K.A., Kang H., Kuroda M.I. // Open. Biol. 2014, V.4, P.140006
  7. Francis N.J., Saurin A.J., Shao Z., Kingston R.E. // Molecular Cell 2001, V.8, №3, P.545-556
  8. Saurin A.J., Shao Z., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Kingston R.E. // Nature 2001, V.412, №6847, P.655-660
  9. Shao Z., Raible F., Mollaaghababa R., Guyon J.R., Wu C.T., Bender W., Kingston R.E. // Cell. 1999, V.98, №1, P.37-46
  10. Cao R., Wang L., Wang H., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Jones R.S., Zhang Y. // Science. 2002, V.298, №5595, P.1039-1043
  11. Czermin B., Melfi R., McCabe D., Seitz V., Imhof A., Pirrotta V. // Cell. 2002, V.111, №2, P.185-196
  12. Kuzmichev A., Nishioka K., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. // Genes Dev. 2002, V.16, №22, P.2893-2905
  13. Muller J., Hart C.M., Francis N.J., Vargas M.L., Sengupta A., Wild B., Miller E.L., O’Connor M.B., Kingston R.E., Simon J.A. // Cell. 2002, V.111, №2, P.197-208
  14. Klymenko T., Papp B., Fischle W., Kocher T., Schelder M., Fritsch C., Wild B., Wilm M., Muller J. // Genes Dev. 2006, V.20, №9, P.1110-1122
  15. Papp B., Muller J. // Genes Dev. 2006, V.20, №15, P.2041-2054
  16. Schwartz Y.B., Kahn T.G., Nix D.A., Li X.Y., Bourgon R., Biggin M., Pirrotta V. // Nature Genetics. 2006, V.38, №6, P.700-705
  17. Schuettengruber B., Martinez A.M., Iovino N., Cavalli G. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2011, V.12, №12, P.799-814
  18. Cavalli G., Paro R. // Cell. 1998, V.93, №4, P.505-518
  19. Cavalli G., Paro R. // Science. 1999, V.286, №5441, P.955-958
  20. Dejardin J., Cavalli G. // EMBO J. 2004, V.23, №4, P.857-868
  21. Erokhin M., Elizar’ev P., Parshikov A., Schedl P., Georgiev P., Chetverina D. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015, V.112, №48, P.14930-14935
  22. Maurange C., Paro R. // Genes Dev. 2002, V.16, №20, P.2672-2683
  23. Perez L., Barrio L., Cano D., Fiuza U.M., Muzzopappa M., Milan M. // Development. 2011, V.138, №15, P.3125-3134
  24. Rank G., Prestel M., Paro R. // Mol. Cell. Biol. 2002, V.22, №22, P.8026-8034
  25. Pirrotta V. // Biotechnology. 1988, V.10, P.437-456
  26. Qian S., Varjavand B., Pirrotta V. // Genetics. 1992, V.131, №1, P.79-90
  27. Erokhin M., Davydova A., Parshikov A., Studitsky V.M., Georgiev P., Chetverina D. // Epigenet. Chromatin. 2013, V.6, №1, P.31
  28. Brand A.H., Perrimon N. // Development. 1993, V.118, №2, P.401-415
  29. Erokhin M., Parshikov A., Georgiev P., Chetverina D. // Chromosoma. 2010, V.119, №3, P.243-253
  30. Karess R.E., Rubin G.M. // Cell. 1984, V.38, №1, P.135-146
  31. Rubin G.M., Spradling A.C. // Science. 1982, V.218, №4570, P.348-353
  32. Spradling A.C., Rubin G.M. // Science. 1982, V.218, №4570, P.341-347
  33. Golic K.G., Lindquist S. // Cell. 1989, V.59, №3, P.499-509
  34. Siegal M.L., Hartl D.L. // Meth. Mol. Biol. 2000, V.136, P.487-495
  35. Kyrchanova O., Toshchakov S., Parshikov A., Georgiev P. // Mol. Cell. Biol. 2007, V.27, №8, P.3035-3043
  36. Comet I., Savitskaya E., Schuettengruber B., Negre N., Lavrov S., Parshikov A., Juge F., Gracheva E., Georgiev P., Cavalli G. // Dev. Cell. 2006, V.11, №1, P.117-124
  37. Orlando V., Jane E.P., Chinwalla V., Harte P.J., Paro R. // EMBO J. 1998, V.17, №17, P.5141-5150
  38. Kassis J.A. // Genetics. 1994, V.136, №3, P.1025-1038
  39. Beisel C., Buness A., Roustan-Espinosa I.M., Koch B., Schmitt S., Haas S.A., Hild M., Katsuyama T., Paro R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007, V.104, №42, P.16615-16620
  40. Schuettengruber B., Ganapathi M., Leblanc B., Portoso M., Jaschek R., Tolhuis B., van Lohuizen M., Tanay A., Cavalli G. // PLoS Biol. 2009, V.7, №1, e13
  41. Fischle W., Wang Y., Jacobs S.A., Kim Y., Allis C.D., Khorasanizadeh S. // Genes Dev. 2003, V.17, №15, P.1870-1881
  42. Min J., Zhang Y., Xu R.M. // Genes Dev. 2003, V.17, №15, P.1823-1828
  43. Bowman S.K., Deaton A.M., Domingues H., Wang P.I., Sadreyev R.I., Kingston R.E., Bender W. // Elife. 2014, V.3, P.e02833
  44. Bae E., Calhoun V.C., Levine M., Lewis E.B., Drewell R.A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002, V.99, №26, P.16847-16852
  45. Petruk S., Sedkov Y., Riley K.M., Hodgson J., Schweisguth F., Hirose S., Jaynes J.B., Brock H.W., Mazo A. // Cell. 2006, V.127, №6, P.1209-1221
  46. Gummalla M., Maeda R.K., Castro Alvarez J.J., Gyurkovics H., Singari S., Edwards K.A., Karch F., Bender W. // PLoS Genetics. 2012, V.8, №5, P.e1002720
  47. Langlais K.K., Brown J.L., Kassis J.A. // PloS One. 2012, V.7, №11, e48765
  48. Herzog V.A., Lempradl A., Trupke J., Okulski H., Altmutter C., Ruge F., Boidol B., Kubicek S., Schmauss G., Aumayr K. // Nat. Genet. 2014, V.46, №9, P.973-981
  49. Grimm C., de Ayala Alonso A.G., Rybin V., Steuerwald U., Ly-Hartig N., Fischle W., Muller J., Muller C.W. // EMBO Repts. 2007, V.8, №11, P.1031-1037
  50. Grimm C., Matos R., Ly-Hartig N., Steuerwald U., Lindner D., Rybin V., Muller J., Muller C.W. // EMBO J. 2009, V.28, №13, P.1965-1977
  51. Kulaeva O.I., Hsieh F.K., Chang H.W., Luse D.S., Studitsky V.M. // Biochim. Biophys. Acta. 2013, V.1829, №1, P.76-83

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Елизарьев П.В., Ломаев Д.В., Четверина Д.A., Георгиев П.Г., Ерохин M.M., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах