Мультилокусный анализ генетической предрасположенности к инфаркту миокарда у русских: репликационное исследование

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

В поисках генетических маркеров риска инфаркта миокарда (ИМ), обладающих прогностической значимостью для русского этноса, провели репликационное исследование ассоциации с ИМ вариантов генов PCSK9 (rs562556), APOE (эпсилон-полиморфизм, rs7412 и rs429358), LPL (rs320), MTHFR (rs1801133), eNOS (rs2070744) и области 9p21 (rs1333049) у 405 пациентов, перенесших ИМ, в сравнении с 198 индивидами контрольной группы. Наблюдали значимую ассоциацию вариантов генов липидного обмена PCSK9, APOE и LPL, а также гена eNOS с ИМ. Варианты гена MTHFR и rs1333049 области 9p21 оказались незначимыми поодиночке, но входили в состав нескольких различных ИМ-ассоциированных аллельных сочетаний, обнаруженных с помощью мультилокусного анализа. Нелинейных эпистатических взаимодействий между компонентами найденных сочетаний не обнаружено. Сделано заключение, что кумулятивный эффект генов в составе сочетания возникает в результате суммирования их малых независимых вкладов. С помощью ROC-анализа оценивали прогностическую значимость аддитивной композитной модели, построенной с использованием генов PCSK9, APOE, LPL и eNOS как генетических маркеров. После включения этих маркеров в ранее опубликованную нами композитную модель индивидуального генетического риска ИМ предсказательная эффективность достигла значения AUC = 0.676. Однако результаты, полученные в настоящем исследовании, безусловно, нуждаются в воспроизведении на независимой выборке русских.

Полный текст

ВВЕДЕНИЕ Инфаркт миокарда (ИМ) - наиболее тяжелая форма ишемической болезни сердца (ИБС). Несмотря на значительный прогресс в предотвращении и лечении сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ), достигнутый за последние десятилетия в ведущих странах мира, ИМ остается наиболее частой причиной смерти населения в мировом масштабе. Как ИМ, так и ИБС представляют собой мультифакториальные полигенные заболевания, и присущий им не-Менделевский характер наследования является следствием взаимодействия вариантов ряда генов. Генетическая предрасположенность к ИБС хорошо изучена с помощью полногеномных ассоциативных исследований (GWAS), тогда как для ИМ как отдельного фенотипа проведено относительно немного полногеномных исследований [1, 2]. Наблюдается довольно плохая воспроизводимость немногочисленных ИМ-ассоциированных локусов, выявленных в отдельных работах, что может быть связано с этническими различиями между выборками. Хотя GWASs направлены на поиск генетических вариантов, которые позволили бы оценивать риск ИМ, отмечается, что пока они не привели к прогрессу в прогнозировании риска этого заболевания [3]. Не удивительно, что традиционный подход «ген- кандидат» сохраняет свою значимость. Накоплены обширные данные по ассоциации отдельных генов- кандидатов с ИМ у жителей России, многие из которых получены российскими участниками международных проектов MONICA [4] и HAPIEE [5]. Особое значение при выявлении факторов генетической предрасположенности придается воспроизведению (репликации) полученных результатов как на независимых выборках представителей того же этноса, так и в других этнических группах. Ранее мы наблюдали, что варианты генов FGB, TGFB1, CRP, IFNG и PTGS1, продукты которых вовлечены в системы воспаления и коагуляции, ассоциированы с риском развития ИМ у этнических русских, и реплицировали эти результаты на независимой выборке русских [6]. Показана прогностическая значимость найденных маркеров, причем эффективность прогноза существенно повышается при суммировании вкладов отдельных генов. Однако идентифицированные локусы объясняют только незначительную долю риска ИМ. В поисках других генетических маркеров риска ИМ, имеющих прогностическую значимость для русских, в настоящей работе мы расширили круг исследуемых нами генов-кандидатов, включив в него гены системы липидного обмена (PCSK9, LPL и APOE), гены MTHFR и eNOS, а также локус в области 9p21. Известно, что продукты выбранных генов липидного обмена вовлечены в развитие ССЗ. Показано, что белок PCSK9 (пропротеин-конвертаза субтилизин-кексинового типа 9), кодируемый геном PCSK9, участвует в деградации рецепторов липопротеинов низкой плотности и служит мишенью при терапии дислипидемией и связанных с ней ССЗ [7]. Продукт гена APOE, аполипопротеин E, участвует в транспорте липидов и играет важную роль в развитии ССЗ [8]. Кодируемая геном LPL липопротеинлипаза является ключевым ферментом метаболизма и транспорта липидов и участвует в патогенезе атеросклероза [9]. Хорошо известна также роль продуктов генов MTHFR и eNOS в патогенезе ССЗ. MTHFR кодирует фермент метилентетрагидрофолатредуктазу, участвующую в превращении гомоцистеина в метионин. Гомоцистеинемия может приводить к дисфункции эндотелия, что является фактором риска атеросклероза и связанных с ним ССЗ. [10]. Кодируемая геном eNOS эндотелиальная синтаза оксида азота (NO) катализирует образование NO, участвующего в регуляции тонуса и проницаемости сосудистой стенки; нарушения в системе NO могут приводить к атеросклерозу, гипертонии и тромбозу [11]. Ассоциацию rs1333049 в области 9p21 с ИМ наблюдали в нескольких GWAS и валидировали в ряде этносов. В этом локусе находится ген некодирующей регуляторной РНК ANRIL. Эта РНК может влиять на экспрессию ингибиторов циклинзависимых киназ p15INK4a и p16INK4b, которые кодируются генами CDKN2A и CDKN2B, расположенными в той же области. Предполагают, что область 9p21 может участвовать в патогенезе атеросклероза через регуляцию пролиферации и апоптоза гладкомышечных клеток [12]. Целью нашей работы было репликационное исследование ассоциации вариантов генов PCSK9, APOE, LPL, MTHFR, eNOS и области 9p21 с риском развития ИМ у русских. В табл. 1 представлены характеристики выбранных генов и однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Мы провели также мультилокусный анализ ассоциации сочетаний вариантов этих генов/локусов с ИМ, поскольку такой подход создает возможность выявления кумулятивного эффекта генов [13], и исследовали природу этого эффекта. Мы оценили прогностическую эффективность найденных маркеров как по отдельности, так и совместно с ранее найденными маркерами [6]. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ В исследовании методом «случай-контроль» использовали образцы геномной ДНК больных ИМ, которые проходили лечение в отделе неотложной кардиологии Национального медицинского исследовательского центра кардиологии Минздрава РФ. Группа больных включала 405 человек, этнических русских, средний возраст (ср. в.) ± стандартное отклонение 57.5 ± 12.8 лет. Из них 271 мужчина (ср. в. 53.4 ± 11.9 лет) и 134 женщины (ср. в. 65.6 ± 10.3 лет). Диагноз ИМ ставился согласно критериям [14]. Контрольная группа состояла из 198 лиц, русских, без ССЗ в анамнезе, ср. в. 59.8 ± 13.3 лет. Из них 112 мужчин (ср. в. 57.1 ± 11.9 лет) и 86 женщин (ср. в. 63.2 ± 14.2 лет). От всех индивидов получено информированное согласие на проведение исследования. Геномное типирование проводили методами, основанными на полимеразной цепной реакции (ПЦР). Для эпсилон-полиморфизма гена APOE (rs7412, rs429358) [15], 495T > G гена LPL (rs320) [16], 677C > T MTHFR (rs1801133) [17] и -786T>C гена eNOS (rs2070744) [18] проводили анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов продуктов ПЦР. Геномное типирование rs562556 PCSK9, rs1333049 в области 9р21.3 осуществляли методом ПЦР в режиме реального времени с применением набора TaqMan® SNP Genotyping Assay (Applied Biosystems). Статистический анализ Анализ отклонения наблюдаемых частот генотипов от равновесия Харди-Вайнберга проводили с использованием программы Haploview 4.2 [19]. Поиск ассоциаций носительства аллелей и генотипов отдельных SNP и их сочетаний с развитием ИМ проводили с помощью программного обеспечения (ПО) APSampler [20]. Значимость найденных ассоциаций оценивали с помощью точного критерия Фишера и по значениям отношения шансов (ОШ). Для величин p по Фишеру вводили поправку на число тестов (множественных сравнений) в соответствии с методом Бонферрони (pcorr). Величиы р и pcorr считали значимыми при уровне < 0.05 при условии, что значения 95% доверительного интервала (ДИ) для ОШ не пересекали 1. Считали SNP ассоциированным с ИМ, если ассоциация была значимой либо в рецессивной, либо в доминантной модели. Для выявления возможного нелинейного взаимодействия (эпистаза) между аллелями в найденных биаллельных сочетаниях использовали подход, предложенный нами ранее [6], определяя величины р в точном трехфакторном тесте [21] и фактор синергии (SF) [22]. Взаимодействие между аллелями в сочетании рассматривали как эпистатическое, если величина p была менее 0.05, а значение 95% ДИ для SF не пересекало 1. Для построения предиктивных моделей использовали метод логистической регрессии с пошаговым включением переменных (пакет stats v.3.3.1 for R). Прогностическую эффективность оценивали по площади под кривой (AUC) при ROC (receiver operating characteristic) анализе с использованием пакета pROC v.1.8 for R; парные сравнения проводили по методу [23]. Для оценки чувствительности и специфичности предиктивных моделей рассчитывали пороговый уровень вероятности по методу [24]. РЕЗУЛЬТАТЫ Равновесие Харди-Вайнберга соблюдалось для исследованных полиморфных участков в контрольной группе (p > 0.05). На рис. 1 представлены частоты аллелей всех исследованных локусов в контрольной группе в сравнении с частотами минорных аллелей (global MAF) из базы данных SNP [25] по данным проекта «1000 геномов», фаза 3. Абсолютные различия наблюдаемых частот аллелей от данных базы SNP составляют до 10%. Данные о носительстве аллелей и генотипов генов PCSK9 (rs562556), APOE (эпсилон-полиморфизм, rs7412 и rs429358), LPL (rs320), MTHFR (rs1801133), eNOS (rs2070744) и области 9p21 (rs1333049) у 405 пациентов, перенесших ИМ, и 198 индивидов контрольной группы представлены в табл. 2. Наблюдали значимые различия в частотах носительства аллелей и генотипов полиморфных участков всех трех генов липидного обмена: PCSK9, APOE и LPL. Значимые различия выявлены также для гена eNOS, но не MTHFR и области 9p21. Факторами риска развития ИМ оказались генотипы PCSK9*A/A (р = 0.013, OШ = 1.45), APOE*ε3/ε3 (р = 0.017, OШ = 1.52) и LPL*G/G (р = 0.032, OШ = 1.96), а также носительство аллеля eNOS*С (р = 0.0034, OШ = 1.63). Следует отметить, однако, что величина рcorr, полученная с поправкой Бонферрони на число тестов (множественных сравнений), была значимой только в случае вариантов генов APOE и eNOS. метод Монте-Карло, мы провели мультилокусный анализ, направленный на выявление совместного вклада в предрасположенность к ИМ сочетаний аллелей и генотипов исследуемых генов. Обнаружены ассоциированные с риском ИМ би- и триаллельные сочетания, характеризующиеся бóльшим размером эффекта и бóльшим уровнем значимости ассоциации с ИМ, чем компоненты этих сочетаний. В состав сочетаний входят не только варианты генов PCSK9, APOE, LPL и eNOS, значимо ассоциированные с ИМ поодиночке, но и аллели/генотипы MTHFR и rs1333049 в области 9p21. На рис. 2 (А-В) приведены значения ОШ и 95% ДИ для сочетаний, содержащих варианты двух последних локусов: MTHFR*С, rs1333049*С и rs1333049*С/G. Видно, что во всех случаях перечисленные варианты, представленные в нижней части каждого рисунка, не значимы. Однако сочетание аллеля MTHFR*С с аллелем eNOS*С оказывается значимым (р = 0.0006; OШ = 1.80), причем более значимым, чем носительство одного аллеля eNOS*С (рис. 2А). С риском ИМ ассоциировано также триаллельное сочетание (LPL*G/G + MTHFR*С + rs1333049*С) (р = 0.018; OШ = 2.83) и входящее в его состав биаллельное сочетание (LPL*G/G + MTHFR*С) (р = 0.021; OШ = 2.30), которое ассоциировано слабее, чем это триаллельное сочетание, но более значимо, чем один генотип LPL*G/G (рис. 2Б). Еще одно триаллельное сочетание (APOE*ε4 + eNOS*Т + rs1333049*С/G) негативно ассоциировано с риском ИМ (р = 0.00041; OШ = 0.30) (рис. 2В). Слабее с риском ИМ ассоциированы входящие в его состав биаллельные сочетания (APOE*ε4 + rs1333049*С/G) и (APOE*ε4 + eNOS*Т). Однако эта ассоциация сильнее, чем у единственного значимого поодиночке компонента сочетания - носительства аллеля APOE*ε4. Таким образом, с помощью мультилокусного анализа удалось выявить участие в формировании предрасположенности к ИМ в составе нескольких аллельных сочетаний вариантов гена MTHFR (rs1801133) и локуса 9p21 (rs1333049), которые не были значимо ассоциированы с ИМ поодиночке. Для выяснения вопроса о том, чем объясняется наблюдаемый кумулятивный эффект аллелей разных генов - суммированием малых взаимно независимых вкладов отдельных аллелей или же эпистатическими взаимодействиями между этими аллелями - мы провели анализ трехфакторных взаимодействий с помощью статистического подхода, описанного нами ранее [6]. Полученные при этом значения фактора синергии (SF) с 95% ДИ и величины р в точном трехфакторном тесте, аналогичные ОШ с 95% ДИ и величине р в тесте Фишера при стандартной оценке ассоциаций между фенотипом и генотипом (т.е. в двухфакторном тесте), оказались незначимыми. Таким образом, мы не выявили значимых эпистатических взаимодействий между компонентами всех найденных сочетаний. Для оценки прогностической значимости обнаруженных генетических факторов риска с помощью метода логистической регрессии была рассчитана индивидуальная вероятность возникновения ИМ у каждого индивида в зависимости от носительства вариантов генов PCSK9, APOE, LPL и eNOS. Оценивали вклад совместного носительства аллелей/ генотипов риска этих генов с помощью ROC-анализа (рис. 3А), исходя из эффективности классификации индивидов на больных и здоровых. Видно, что рассматриваемые генетические факторы поодиночке являются плохими классификаторами риска возникновения ИМ (AUC < 0.60). Однако при совместном учете данных о носительстве аллелей/генотипов PCSK9, APOE, LPL и eNOS достигается удовлетворительная прогностическая эффективность (AUC = 0.604). Надо отметить, что добавление в модель незначимых поодиночке аллелей гена MTHFR и области 9p21, входящих в состав выявленных с помощью APSampler сочетаний, не делает ее более эффективной. Эти данные использованы для улучшения полученной нами ранее композитной генетической модели риска ИМ, включающей в качестве предикторов варианты генов TGFB1, FGB и CRP, а также эпистатическое сочетание IFNG с PTGS1 [6]. На рис. 3Б показаны три ROC-кривые: ROC-кривая, полученная в исследованной выборке для композитной модели, описанной в [6], ROC-кривая для совместного носительства найденных новых маркеров, представленная на рис. 3А, и ROC- кривая для обобщенной композитной модели, включающей как маркеры из предыдущей, так и из настоящей работы. Видно значимое (p = 0.014) повышение прогностической эффективности модели от AUC 0.641 в модели без новых маркеров до 0.676 в обобщенной композитной модели. ОБСУЖДЕНИЕ Проведенный методом «случай-контроль» мультилокусный анализ ассоциации полиморфных вариантов PCSK9 (rs562556), APOE (эпсилон-полиморфизм, rs7412 и rs429358), LPL (rs320), MTHFR (rs1801133), eNOS (rs2070744) и области 9p21 (rs1333049) с риском развития ИМ позволил выявить значимо ассоциированные с ИМ аллели/генотипы PCSK9, APOE, LPL и NOS, а также би- и триаллельные сочетания, несущие, помимо вариантов перечисленных генов, еще и аллели/генотипы MTHFR и области 9p21. Каждый из исследованных нами генов системы липидного обмена - PCSK9, LPL и APOE - оказался ассоциированным с риском ИМ; ОШ для генотипов риска лежит в пределах от 1.45 до 1.96, однако уровень значимости невелик (от 0.013 до 0.032). Вовлечение генов системы липидного обмена в развитие ИМ хорошо согласуется с общеизвестным фактом, что нарушения обмена липидов и повышение уровня холестерина и индекса атерогенности приводят к атеросклеротическим поражениям интимы артерий. Однако опубликованные данные об участии изученных нами вариантов генов системы липидного обмена в формировании ССЗ противоречивы. rs562556 в гене PCSK9 определяет замену Ile на Val в положении 474 кодируемого белка, что, по всей видимости, не влияет на уровень его продукции [26]. Мы наблюдали ассоциацию генотипа А/A этого SNP с ИМ у русских. Однако у японцев не наблюдали различий в распределении вариантов rs562556 у больных с ИМ и в контрольной группе, хотя этот SNP был ассоциирован с уровнем холестерина [27]. Выявлена связь между полиморфизмом rs562556, присутствием антифосфолипидных антител и развитием у носителей этих антител тромбоза - фактора риска ИМ [28]. Ассоциация с ИМ других вариантов гена PCSK9, а именно rs11206510 [29] и rs11591147 [30], показана в различных популяциях. Таким образом, полученные нами данные об ассоциации гена PCSK9 с возникновением ИМ находятся в соответствии с опубликованными данными. Отдельные аллельные варианты включенного в наше исследование эпсилон-полиморфизма гена APOE практически во всех популяциях ассоциированы с ССЗ и, в частности, с ИМ. Согласно проведенным метаанализам, с риском развития ИМ ассоциирован аллель ε4, а ε2 является протективным [31, 32]. Однако выводы, полученные при метаанализе, включающем различные этносы, нельзя автоматически распространять на отдельные популяции, в которых наблюдается большой разброс в оценке роли отдельных аллелей в предрасположенности к ИМ. Вероятно, основной причиной плохой сходимости результатов отдельных исследований является существенная разница в частотах аллелей в различных популяциях и даже в одной и той же популяции, проживающей на разных территориях [33]. В частности, в нашем исследовании, выполненном для русских из Центральной России, генотипом риска оказался ε3/ε3, а в выборке мужчин из сибирской популяции - генотип ε2/ε3 [34]. rs320, известный также как HindIII-полиморфизм, определяет замену T на G в интроне 8 гена LPL. Предполагают, что он находится в регуляторной области и влияет на экспрессию LPL [35]. Мы наблюдали ассоциацию rs320 с ИМ в нашей выборке. Связь этого полиморфизма с развитием ИМ показана и в ряде других исследований [36, 37], в том числе и у русских [38]. Описаны и другие полиморфизмы этого гена, ассоциированные с ИМ в японской популяции [39]. Однако данные об ассоциации отдельных аллелей с ИМ не всегда совпадают. Еще один локус, вариант которого значимо ассоциирован с ИМ в нашей работе - это rs2070744 гена eNOS. Этот полиморфный участок находится в промоторной области гена. Аллель C, ассоциированный с риском ИМ в нашем исследовании, связан с уменьшением экспрессии мРНК и соответственно уровня белка eNOS [40]. Наши данные совпадают с результатами других исследований [41]. Замена C на T в rs1801133 гена MTHFR приводит к замещению Ala в положении 222 белка на Val [42] и к почти к 50% снижению ферментативной активности метилентетрагидрофолатредуктазы [43]. В большинстве исследований не наблюдали ассоциации rs1801133 с риском развития ИМ в различных этносах, включая европеоидов [44] и русских [45]. Мы также не выявили ассоциации rs1801133 с риском развития ИМ у русских, однако носительство аллеля С оказалось значимо ассоциированным с риском ИМ в сочетании с носительством аллеля С гена eNOS (см. рис. 2А) или с носительством генотипа G/G гена LPL (см. рис. 2Б). Мы полагаем, что эти данные могут быть интерпретированы как аргумент в пользу вовлечения гена MTHFR в формирование предрасположенности к ИМ. Область 9p21 - единственная область генома, вовлеченность которой в формирование ИМ воспроизведена в нескольких GWASs с полногеномным уровнем значимости (p < 5 × 10-8) [2]. Эти данные подтверждены в ряде валидационных исследований, в том числе для rs10757278 и rs1333049 на выборке больных ИМ и контрольных групп из сибирской популяции (без указания этнической принадлежности) [46]. Мы не наблюдали значимой ассоциации rs1333049 с ИМ у русских, однако мультилокусный анализ позволил выявить ряд сочетаний, содержащих этот SNP. Носительство аллеля rs1333049*С в составе триаллельного сочетания ассоциировано с риском ИМ (см. рис. 2Б), а генотип rs1333049*С/G в составе би- и триаллельного сочетаний оказался протективным (см. рис. 2В), в хорошем соответствии с результатами работы [46]. Проведенный статистический анализ трехфакторных взаимодействий свидетельствует об отсутствии эпистатических взаимодействий между компонентами всех найденных сочетаний. В то же время все биаллельные сочетания, ассоциированные с риском ИМ (ОШ > 1), имеют по сравнению с входящими в них отдельными аллелями/генотипами бóльший уровень значимости и бóльшие значения ОШ (соответственно для протективных сочетаний с ОШ < 1 - меньшие значения ОШ). Аналогичная закономерность проявляется для триаллельных сочетаний при сравнении с биаллельными. Мы приходим к заключению, что наблюдаемые в настоящей работе кумулятивные эффекты возникают в результате аддитивности вкладов отдельных генов. Аддитивность эффекта при этом обусловлена тем, что в сравнительно небольшой выборке статистическая значимость наблюдения ассоциации заболевания с сочетанием слабых генетических факторов, действующих в одном направлении, выше, чем при наблюдении каждого из этих факторов. Следовательно, есть все основания предположить, что локусы MTHFR (rs1801133) и 9p21 (rs1333049) являются самостоятельными факторами риска ИМ с малыми эффектами, для выявления значимых ассоциаций с которыми в исследуемой нами выборке оказалось недостаточно статистической мощности, а использование мультилокусного анализа позволило восполнить этот недостаток. Аналогичным образом, вследствие малых эффектов локусов MTHFR (rs1801133) и 9p21 (rs1333049), их добавление в композитную генетическую модель риска ИМ не повышало ее прогностической эффективности. Здесь следует отметить преимущество эпистатических сочетаний перед сочетаниями аддитивными в качестве классификаторов риска. Действительно, в работе [6] одним из предикторов риска ИМ оказалось эпистатическое сочетание IFNG с PTGS1, оба компонента которого поодиночке не были ассоциированы с заболеванием. В то же время выявление генетических вариантов, входящих в состав аддитивных сочетаний, открывает возможность обнаружить их ассоциацию с заболеванием поодиночке на выборках большего объема. Прогностическая эффективность композитной генетической модели риска ИМ, построенной на основании результатов настоящего исследования, хотя и значима, но невелика. Это справедливо и для модели, полученной нами ранее [6]. При объединении двух моделей удалось достичь величины AUC 0.676, что при пороге вероятности (cut-off) 0.74 соответствует чувствительности 0.80 и специфичности 0.45. В целом, на сегодняшний день ни результаты GWAS, ни данные, полученные с использованием подхода «ген-кандидат», не позволяют эффективно использовать данные генетического анализа для предсказания возникновения ИМ. ЗАКЛЮЧЕНИЕ Таким образом, проведенный анализ ассоциации полиморфных участков шести генов-кандидатов показал их значимую ассоциацию с ИМ или поодиночке, или в составе сочетаний. В целом, мы реплицировали на независимых выборках русских из Центральной России ассоциацию с ИМ полиморфных вариантов генов PCSK9, APOE, LPL, MTHFR, eNOS и области 9p21. Поскольку варианты одних и тех же генов (rs1801133 гена MTHFR или rs1333049 области 9p21), не значимые поодиночке, входили в состав нескольких различных сочетаний, между компонентами которых не выявлено эпистатических взаимодействий, можно заключить, что обнаруженный с помощью мультилокусного анализа кумулятивный эффект генов в составе сочетания возникает в результате суммирования их малых независимых вкладов. Включение найденных маркеров в ранее опубликованную нами модель индивидуального генетического риска ИМ [6] значимо повышает ее предсказательную эффективность, хотя полученные нами результаты, безусловно, нуждаются в воспроизведении на независимой выборке русских. Для дальнейшего повышения предсказательной способности композитной модели необходимо улучшать ее путем включения других генетических предикторов риска и уточнения значений коэффициентов уравнения регрессии на расширенных выборках.

×

Об авторах

Н. Г. Кукава

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

Б. В. Титов

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

Г. Ж. Осьмак

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

Н. A. Матвеева

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

O. Г. Кулакова

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

A. В. Фаворов

Oncology Biostatistics and Bioinformatics, Johns Hopkins School of Medicine

Email: olga.favorova@gmail.com
США

Р. M. Шахнович

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

M. Я. Руда

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ

Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

O. O. Фаворова

Национальный медицинский исследовательский центр кардиологии Минздрава РФ; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Минздрава РФ

Автор, ответственный за переписку.
Email: olga.favorova@gmail.com
Россия

Список литературы

  1. Dai X., Wiernek S., Evans J.P., Runge M.S. // World J. Cardiol. 2016, V.8, №1, P.1-23
  2. // url www.ebi.ac.uk/gwas
  3. Dehghan A., Bis J.C., White C.C., Smith A.V., Morrison A.C., Cupples L.A., Trompet S., Chasman D.I., Lumley T., Völker U. // PLoS One. 2016, V.11, №3, e0144997
  4. // url www.thl.fi/monica/
  5. // url www.ucl.ac.uk/easteurope/hapiee.html
  6. Barsova R.M., Lvovs D., Titov B.V., Matveeva N.A., Shakhnovich R.M., Sukhinina T.S., Kukava N.G., Ruda M.Y., Karamova I.M., Nasibullin T.R. // PLoS One. 2015, V.10, №12, e0144190
  7. Catapano A.L., Papadopoulos N. // Atherosclerosis. 2013, V.228, №1, P.18-28
  8. Mahley R.W. // J. Mol. Med. (Berlin). 2016, V.94, №7, P.9-46
  9. Li Y., He P.P., Zhang D.W., Zheng X.L., Cayabyab F.S., Yin W.D., Tang C.K. // Atherosclerosis. 2014, V.237, №2, P.597-608
  10. Ueland P.M., Refsum H. // J. Lab. Clin. Med. 1989, V.114, №5, P.473-501
  11. Liu D., Jiang Z., Dai L., Zhang X., Yan C., Han Y. // Gene. 2014, V.545, №1, P.175-183
  12. Holdt L.M., Teupser D. // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2012, V.32, №2, P.196-206
  13. Lvovs D., Favorova O.O., Favov A.V. // Acta Naturae. 2012, V.4, №3, P.62-75
  14. // Third Universal definition of myocardial infarction // Eur.Heart J. 2012, V.33, P.2551-2567
  15. Hixson J.E., Vernier D.T. // J. Lipid. Res. 1990, V.31, P.545-548
  16. Shimo-Nakanishi Y., Urabe T., Hattori N., Watanabe Y., Nagao T., Yokochi M., Hamamoto M., Mizuno Y. // Stroke. 2001, V.32, P.1481-1486
  17. Genest J., Rozen R. // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 1997, V.17, №3, P.569-573
  18. Augeri A.L., Tsongalis G.J., van Heest J.L., Maresh C.M., Thompson P.D., Pescatello L.S. // Atherosclerosis. 2009, V.204, №2, P.28-34
  19. // url www.broad.mit.edu/mpg/haploview
  20. // url sourceforge.net/projects/apsampler/
  21. White D.R., Pesner R., Reitz K.P. // Behavior Sci. Res. 1983, V.18, P.103-122
  22. Cortina-Borja M., Smith A.D., Combarros O., Lehmann D.J. // BMC Res. Notes. 2009, V.2, P.105-111
  23. DeLong E.R., DeLong D.M., Clarke-Pearson D.L. // Biometrics. 1988, V.44, P.837-845
  24. Youden W.J. // Cancer. 1950, V.3, №1, P.32-35
  25. // url www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
  26. Astrakova (Benimetskaya) K.S., Shakhtshneider E.V., Ivanoshchuk D.E., Orlov P.S., Ragino Y.I., Voevoda M.I. // Atheroscleros. 2016, V.12, №2, P.18-24
  27. Shioji K., Mannami T., Kokubo Y., Inamoto N., Takagi S., Goto Y., Nonogi H., Iwai N. // J. Hum. Genet. 2004, V.49, №2, P.109-114
  28. Ochoa E., Iriondo M., Manzano C., Fullaondo A., Villar I., Ruiz-Irastorza G., Zubiaga A.M., Estonba A. // PLoS One. 2016, V.11, №1, e0146990
  29. Kathiresan S., Voight B.F., Purcell S., Musunuru K., Ardissino D. // Nat. Genet. 2009, V.41, №3, P.334-341
  30. Kathiresan S. // N. Engl. J. Med. 2008, V.358, №21, P.2299-2300
  31. Wang Y.L., Sun L.M., Zhang L., Xu H.T., Dong Z., Wang L.Q., Wang M.L. // FEBS Open Bio. 2015, V.5, P.852-858
  32. Xu H., Li H., Liu J., Zhu D., Wang Z., Chen A., Zhao Q. // PLoS One. 2014, V.9, №8, e104608
  33. Borinskaia S.A., Kal’ina N.R., Sanina E.D., Kozhekbaeva Zh.M., Gupalo E.Iu., Garmash I.V., Ogurtsov P.P., Parshukova O.N., Boĭko S.G., Veselovskiĭ E.M. // Russ J Genet. 2007, V.43, №10, P.1201-1207
  34. Voevoda M.I., Shakhtshneider E.V., Maksimov V. N., Kulikov I.V., Romaschenko A.G. // Atherosclerosis. 2008, V.4, №1, P.11-26
  35. Chen Q., Razzaghi H., Demirci F.Y., Kamboh M.I. // Atherosclerosis. 2008, V.200, №1, P.102-108
  36. Tanguturi P.R., Pullareddy B., Rama Krishna B.S., Murthy D.K. // Indian Heart J. 2013, V.65, №6, P.653-657
  37. Gigek Cde O., Chen E.S., Cendoroglo M.S., Ramos L.R., Araujo L.M., Payão S.L., Smith Mde A. // Clin. Chem. Lab. Med. 2007, V.45, №5, P.599-604
  38. Malygina N.A., Melent’ev A.S., Kostomarova I.V., Melent’ev I.A., Saégitov R.T., Smirnova Iu.B., Serova L.D. // Mol Biol (Mosk). 2001, V.35, №5, P.787-791
  39. Matsuoka R., Abe S., Tokoro F., Arai M., Noda T., Watanabe S., Horibe H., Fujimaki T., Oguri M., Kato K. // Int. J. Mol. Med. 2015, V.35, №5, P.1451-1459
  40. Doshi A.A., Ziolo M.T., Wang H., Burke E., Lesinski A., Binkley P. // J. Card. Fail. 2010, V.16, №4, P.314-319
  41. Kong X.Z., Zhang Z.Y., Wei L.H., Li R., Yu J. // Med. Sci. Monit. 2017, V.11, №23, P.759-766
  42. Dayakar S., Goud K.I., Reddy T.P., Rao S.P., Sesikeran S.B., Sadhnani M. // Genet. Test. Mol. Biomarkers. 2011, V.15, №11, P.765-769
  43. Xuan C., Bai X.Y., Gao G., Yang Q., He G.W. // Arch. Med. Res. 2011, V.42, №8, P.677-685
  44. Alizadeh S., Djafarian K., Moradi S., Shab-Bidar S. // Int. J. Cardiol. 2016, V.217, P.99-108
  45. Nazarenko G.I., Skvortsova V.I., Kleimenova E.B., Konstantinova M.V. // Zh Nevrol Psikhiatr Im S S Korsakova. 2009, V.109, №10, S2, P.19-25
  46. Maximov V.N., Kulikov I.V., Orlov P.S., Gafarov V.V., Malyutina S.K., Romashchenko A.G., Voevoda M.I. // Vestn. Ross Akad Med Nauk. 2012, V.67, №5, P.24-29

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Кукава Н.Г., Титов Б.В., Осьмак Г.Ж., Матвеева Н.A., Кулакова O.Г., Фаворов A.В., Шахнович Р.M., Руда M.Я., Фаворова O.O., 2017

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах