Противовирусная активность in vitro нового производного индол-3-карбоновой кислоты в отношении SARS-CoV-2

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Пандемия коронавирусной инфекции COVID-19 позволила по-новому оценить угрозу, исходящую от коронавирусов, и перейти к фундаментальному анализу этого семейства и поиску эффективных противоковидных препаратов. Идут работы по актуализации вакцин против COVID-19 и продолжается поиск низкомолекулярных противоковидных препаратов-кандидатов на лекарство для амбулаторного назначения. Обсуждаются возможности и способы ускорения разработки противовирусных препаратов против других патогенов в рамках подготовки к следующей пандемии. В 2012–2015 гг. Н.Г. Цышкова и соавт. синтезировали группу близких по химической структуре к арбидолу водорастворимых низкомолекулярных соединений, обладающих противовирусной активностью. Среди них ряд соединений на основе аминоалкиловых эфиров 5-метоксииндол-3-карбоновой кислоты. Из этой довольно обширной группы соединений достоверным противовирусным эффектом в отношении SARS-CoV-2 в исследованиях in vitro обладал только один – дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)карбонилиндола. В концентрации 52.0 мкМ данное соединение полностью ингибирует репродукцию вируса SARS-CoV-2 с инфекционной активностью 106 ТЦИД50/мл. Концентрационные зависимости свидетельствуют о специфичности действия исследуемого соединения. Выявлена интерферон-индуцирующая активность; обнаружено подавление синцитиеобразования, индуцированного шиповидным белком (S-гликопротеином) SARS-CoV-2, на 89%. Указанное соединение с учетом его синтетической доступности, высокой активности (IC50 = 1.06 мкг/мл) и высокого индекса селективности (SI = 78.6) отвечает требованиям, необходимым для разработки противовирусного средства для профилактики и лечения COVID-19.

Полный текст

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВОЗ – Всемирная организация здравоохранения; ВЭМК – вирус энцефаломиокардита; ИФН – интерферон; ИК – инфракрасный спектр; МС – масс-спектр; ТЦИД50 – 50% тканевая цитопатогенная инфекционная доза; ЦПД – цитопатогенное действие; Тпл – температура плавления; ЭТС – эмбриональная телячья сыворотка; ЯМР 1H – ядерный магнитный резонанс на ядрах 1Н; CC50 50% цитотоксическая концентрация соединения; COVID-19 – COronaVIrus Disease 2019 – коронавирусная инфекция 2019 года; DMEM – питательная среда Dulbecco’s Modified Eagle Medium; GFP – зеленый флуоресцентный белок, green fluorescent protein; IC50 – 50% ингибирующая концентрация; S-гликопротеин – шиповидный белок вируса SARS-CoV-2; SARS-CoV-2 – Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2, коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома – Coronaviridae: Coronavirinae: Betacoronavirus: Sarbecovirus; SI – индекс селективности, рассчитывается как отношение CC50 к IC50 (SI = CC50/IС50).

ВВЕДЕНИЕ

5 мая 2023 года ВОЗ объявила «о прекращении чрезвычайной ситуации в области общественного здравоохранения в связи с распространением коронавируса» [1]. Таким образом, завершилась пандемия, которая продолжалась 3 года 1 месяц и 24 дня. По данным ВОЗ, по состоянию на 12 июля 2023 года в мире было зарегистрировано 767 972 961 подтвержденный случай COVID-19, включая 6 950 655 смертей. В России зарегистрировано 22 967 718 подтвержденных случаев COVID-19 и 399 715 смертей [2]. Однако даже по оценке ВОЗ число умерших от COVID-19 превышает 20 млн человек [3].

Несмотря на объявление о завершении пандемии и констатации снижения общего числа заражений, нельзя сказать, что эпидемия COVID-19 полностью прекратилась. Появились новые подварианты вируса (XBB.1.16 и XBB.2.3) и именно поэтому идут работы по актуализации вакцин против COVID-19 и продолжается поиск низкомолекулярных противоковидных препаратов-кандидатов на лекарство для амбулаторного назначения. Кроме того, примерно у 65 млн больных выявлены долгосрочные последствия инфекции SARS-CoV-2, обозначенные как «состояния после COVID-19», или «длительная COVID» [4].

Пандемия коронавирусной инфекции COVID-19 позволила по-новому оценить угрозу, исходящую от коронавирусов, и перейти к фундаментальному анализу этого семейства и поиску эффективных противоковидных препаратов. Таким образом, по-прежнему необходимы эффективные стратегии лечения COVID-19. Во время пандемии был апробирован целый ряд противовирусных препаратов, таких, как Ремдесивир, нуклеозидные ингибиторы (AT-527 и молнупиравир), ингибитор основной протеазы (Mpro) Нирматрелвир, комплекс Нирматрелвир-ритонавир и молнупиравир, и иммунотропные препараты – барицитиниб, тоцилизумаб и кортикостероиды и др. [5]. Однако практически не разработаны эффективные низкомолекулярные пероральные противовирусные препараты для амбулаторного лечения [6].

В 2012–2015 гг. Н.Г. Цышкова и соавт. синтезировали группу близких по химической структуре к арбидолу водорастворимых низкомолекулярных соединений, обладающих противовирусной активностью. Среди них ряд соединений на основе аминоалкиловых эфиров 5-метоксииндол-3-карбоновой кислоты [7]. Из этой довольно обширной группы достоверным противовирусным эффектом в отношении SARS-CoV-2 в исследованиях in vitro обладало только одно соединение, которое и было исследовано в настоящей работе.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Исследуемое соединение – дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)карбонилиндола (1) (рис. 1)получено [7] в ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России.

 

Рис. 1. Дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)карбонилиндола (соединение 1)

 

Синтез соединения 1 проводили по многостадийной схеме, представленной на рис. 2.

 

Рис. 2. Реагенты и условия: a. 1) водн. NaOH, диоксан, 2) Me2SO4, 20°C; б. N-бромсукцинимид, CCl4, кип.; в. N-бромсукцинимид, (PhCOO)2, CCl4, облучение (лампа 100 Вт), кип.; г. пиперидин, PhH, 20°C; д. 1) водн. NaOH, EtOH, кип., 2) HCl (конц.); е. SOCl2, диоксан, ДМФА (кат.), 60°C; ж. 1) Et2NCH2CH2OH, Et3N, PhH, кип., 2) HCl, Et2O, ацетон, 20°C

 

В работе использовали растворители и реактивы, включая этил-5-гидрокси-1,2-диметил-1H-индол-3-карбоксилат, фирмы Acros Organics. Температуры плавления измеряли на блоке Кофлера. ИК-спектры записывали на Фурье-спектрометре Bruker ALPHA T. Спектр 1H-ЯМР раствора в DMSO-d6 регистрировали на спектрометре Bruker AC-200 при 298 K. Масс-спектр (EI) получен на приборе SHIMADZU LCMS-8040 методом прямого ввода образца в режиме сканирования при положительной ионизации (Q3+Scan).

1,2-Диметил-5-метокси-3-этоксикарбонилиндол (3)

К раствору 4.66 г (0.02 моль) соединения 2 в 40.0 мл диоксана при 20оC прибавили 40.0 мл 10% раствора NaOH, затем по каплям 4.0 мл диметилсульфата (0.042 моль). Реакционную смесь перемешивали 2 ч, затем разбавляли водой и охлаждали (4оC). Выпавший осадок отфильтровывали, промывали водой и высушивали в вакууме (2 Торр) над P2O5. Получено 4.65 г (94%) соединения 3 в виде кристаллов с Тпл 113оC (лит. Тпл 117.5–118°C [8]).

6-Бром-1,2-диметил-5-метокси-3-этокси­карбон­ил­ин­­дол (4)

Смесь 4.65 г (0.0188 моль) соединения 3 и 3.36 г (0.0188 моль) N-бромсукцинимида в 75.0 мл CCl4 нагревали при кипячении в течение 5 ч. Осадок (сукцинимид) отфильтровывали из горячей реакционной смеси. Фильтрат упарили (на 1/3) и охладили. Выпавший осадок отфильтровали, промыли CCl4 на фильтре и сушили в вакууме (2 Торр). Получено 3.3 г (54%) соединения 4 в виде кристаллов с Тпл 156оС (лит. Тпл 164–165оС [8]).

6-Бром-2-бромметил-5-метокси-1-метил-3-этоксикарбонилиндол (5)

Смесь 3.3 г (0.0101 моль) соединения 4, 1.81 г (0.0101 моль) N-бромсукцинимида и 0.1 г перекиси бензоила в 30.0 мл CCl4 кипятили при освещении (лампа 100 Вт) в течение 5 ч. После отделения осадка сукцинимида фильтрованием из горячей смеси и охлаждения фильтрата (20оС), выпавший осадок отфильтровали, промыли CCl4 на фильтре и сушили в вакууме (2 Торр). Получено 3.16 г (78%) соединения 5 в виде кристаллов с Тпл 142оС (лит. Тпл 141–142оС [8]).

6-Бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинoметил)-3-этоксикарбонилиндол (6)

Раствор 4.0 г (0.01 моль) соединения 5 и 1.7 г (0.02 моль) пиперидина в 50.0 мл бензола выдерживали 12 ч при комнатной температуре. Выпавший осадок (бромгидрат пиперидина) отфильтровывали, фильтрат сконцентрировали в вакууме досуха. Кристаллизацией остатка из этанола получено 1.7 г (82.9%) соединения 6 в виде кристаллов с Тпл 124–125оС (лит. Тпл 124–125оС [8]). Найдено: % С 55.72, H 6.20, N 7.02. C19H25BrN2O3. Вычислено: % С 55.75, H 6.16, N 6.84.

Гидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинoметил)-индол-3-карбоновой кислоты (7)

Раствор 6.0 г (0.15 моль) NaOH и 4.1 г (0.01 моль) соединения 6 в 60.0 мл этанола и 3.0 мл воды кипятили в течение 3 ч. Реакционную смесь охладили, разбавили водой (10 мл) и подкислили концентрированной соляной кислотой. Выпавший осадок отфильтровали, промыли на фильтре водой, сушили в вакууме (2 Торр) над P2O5. Получено 4.10 г (98%) соединения 7 в виде кристаллов с Тпл 236–238оC. Найдено: % С 48.68, H 5.32, N 6.65. C17H22BrClN2O3. Вычислено: % С 48.88, H 5.31, N 6.71.

Дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)-карбонилиндола (1)

К перемешиваемому раствору 1.67 г (0.004 моль) гидрохлорида 7 в 30.0 мл диоксана прибавили 3.0 мл (0.041 моль) хлористого тионила и 2 капли диметилформамида. Реакционную смесь нагревали при 60оC в течение 3 ч, затем сконцентрировали в вакууме досуха и остаток промыли эфиром. Полученный порошкообразный хлорангидрид 8 без дополнительной очистки растворили в 25 мл бензола и обработали смесью 1.2 мл (0.008 моль) N-диэтиламиноэтанола и 1.12 мл (0.008 моль) триэтиламина. Реакционную смесь нагревали при 80оC в течение 2 ч, затем охлаждали. Выпавший осадок (гидрохлорид триэтиламина) отфильтровали и промыли горячим бензолом. Объединенный фильтрат сконцентрировали в вакууме досуха, остаток промыли гексаном и сушили в вакууме. К раствору полученного продукта в 10 мл ацетона прибавили 2 мл (~30%) эфирного раствора хлористого водорода. Реакционную смесь сконцентрировали в вакууме досуха, остаток кристаллизовали из 2-пропанола. Получено 1.9 г (85.2%) соединения 1 с Тпл 237–240оС и следующими физико-химическими характеристиками.

ИК (KBr, ν, см-1)

859, 1041, 1114, 1148, 1197, 1303, 1393, 1426, 1449, 1483, 1650, 1694 (C=O), 2354–2700, 2942, 3397, 3588 (рис. 3).

 

Рис. 3. ИК-спектр соединения 1

 

Спектр 1H-ЯМР (200 МГц, ДМСО)

δ 10.76 (уш. с, 1H), 10.23 (уш. с, 1H), 8.03 (с, 1H), 7.65 (с, 1H), 4.87 (д, J = 4.8 Hz, 2H), 4.76 (т, J = 5.1 Hz, 2H), 3.95 (с, 3H), 3.93 (с, 3H), 3.61 (м, 2H), 3.50–3.06 (м, 8H), 2.15–1.33 (м, 6H), 1.26 (т, J = 7.2 Hz, 6H) (рис. 4).

 

Рис. 4. 1Н-ЯМР-спектр соединения 1

 

Масс-спектр

HRMS (ESI): найдено m/z 480.1860 [M+H]; вычислено для C23H35BrN3O3+ 480.1862 (рис. 5).

 

Рис. 5. Масс-спектр соединения 1

 

Элементный анализ

Найдено: % С 49.89, H 6.76, N 7.48; Вычислено: % С 49.92, H 6.56, N 7.59; C23H36BrCl2N3O3.

Растворимость соединения 1 определяли в соответствии с Общей фармакопейной статьей (ОФС.1.2.1.0005.15) [9] и заключили, что дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)карбонилиндола 1 относится к легко растворимым.

Клетки

В эксперименте использовали перевиваемую линию клеток почки африканской зеленой мартышки (Chlorocebus aethiops) Vero E6, клеточную линию 293T (субклон трансформированной эмбриональной линии клеток почки человека, HEK 293, которая хорошо подвергается трансфекции и поддерживает высокие уровни экспрессии вирусного белка), а также клеточную линию мышиных фибробластов L-929. Все линии клеток предоставлены Всероссийской коллекцией клеточных культур при ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России.

Животные

Беспородные белые мыши (самцы весом 12.0–14.0 г) получены из питомника ООО «НЭО Маркет» (вет. свидетельство 250 № 0679392). Эксперименты проводили в соответствии с правилами, принятыми Европейской Конвенцией по защите позвоночных животных, используемых в экспериментальных и иных научных целях [10].

Животных распределяли на группы (интактную и четыре экспериментальных по три мыши в каждой) методом случайной выборки с учетом массы тела. Содержание, питание, уход за животными и выведение их из эксперимента осуществляли в соответствии с Правилами лабораторной практики, принятыми в Российской Федерации [11]. Протокол исследования № 43 от 03.05.23 был рассмотрен и одобрен этическим комитетом Центра.

Вирусы

Пандемический штамм коронавируса человека SARS-CoV-2 с инфекционной активностью 106 ТЦИД50/мл для клеток Vero Е6 (клинический изолят: hCoV-19/Russia/Moscow-PMVL-12/2020 (EPI_ISL_572398)); вирус энцефаломиокардита мышей (ВЭМК), штамм «Колумбия SK-Col-SK» с титром 107 ТЦИД50/мл. Вирусы получены из Государственной коллекции вирусов Института вирусологии им. Д.И. Ивановского ФГБУ «НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России.

Определение цитотоксичности соединения (1)

Культуру клеток Vero Е6 в питательной среде DMEM компании Gibco (Thermo FS) с добавлением 5% ЭТС (5 об. %), L-глутамина (2 мМ) и смеси антибиотиков (150 Ед/мл пенициллина и 150 Ед/мл стрептомицина) высевали в тест-планшеты в присутствии соединения 1 и без него и инкубировали в течение 96 ч при температуре 37 ± 0.5°С в атмосфере 5% СО2. Состояние монослоя и жизнеспособность клеток оценивали ежедневно. Затем удаляли культуральную среду из планшетов и в каждую лунку к монослою культуры клеток добавляли по 100 мкл среды РС (среда DМЕМ с 2% ЭТС Gibco (Thermo FS)) и 20 мкл раствора CellTiter 96® AQueous One Solution Cell Proliferation Assay (MTS) (Promega, G3582) [12]. Инкубировали в течение 3 ч при 37 ± 0.5°С, результаты учитывали на автоматическом ридере BIO-RAD при длине волны 490 нм, используя референс-фильтр 630 нм. Концентрацию раствора соединения 1, вызывающую уменьшение значения оптической плотности при λ = 490 нм на 50% по сравнению с контролем, принимали за 50% цитотоксическую дозу (СС50).

Проведение эксперимента по определению противовирусной активности

Использовали 24-часовой монослой культуры клеток, предварительно промытый средой РС, который обрабатывали нетоксичными для клеток концентрациями соединения 1 (т.е. ниже, чем величина CC50). Клетки Vero Е6 обрабатывали вирусом SARS-CoV-2 через 60 мин после внесения соединения 1. Использовали следующие контроли: положительный контроль – культура клеток, инфицированная различными разведениями SARS-CoV-2 (от 10-1 до 10-7), без соединения 1; негативный контроль 1 – неинфицированная культура клеток без соединения 1; негативный контроль 2 – неинфицированная культура клеток, в которую вносили по 100 мкл растворов соединения 1 в различных концентрациях. Каждую концентрацию соединения 1 исследовали в четырех параллелях. Тест-планшеты инкубировали в течение 96 ч при температуре 37 ± 0.5оС в атмосфере 5% СО2 до полного проявления ЦПД вируса в вирусном контроле в ожидаемом диапазоне. Противовирусную активность соединения 1 определяли визуально под микроскопом через 96 ч после инфицирования по ингибированию ЦПД вируса в культуре клеток Vero E6. За титр вируса принимали величину, обратную последнему разведению, в котором развивалось ЦПД. ТЦИД50 рассчитывали по методу Рида–Менча для каждой концентрации исследуемого препарата и контрольного титрования вируса. Результат оценивали по Δlgmax – максимальному снижению значения заражающей вирусной дозы в опыте по сравнению с контролем, выраженному в десятичных логарифмах. За минимально эффективную вирусингибирующую концентрацию принимали концентрацию соединения 1, снижающую титр вируса не менее чем на 1.5 lg. Для получения статистически значимых результатов эксперименты проводили трижды.

Определение эффективности ингибирования синцитиеобразования

Клетки 293Т котрансфицировали в течение 48 ч плазмидой, содержащей полноразмерный S-гликопротеин (pVAX-1-S-glycoprotein; «Евроген», Россия), и плазмидой, кодирующей GFP (pUCHR-IRES-GFP), с помощью Transporter™ 5 transfection reagent. Далее к выращенному в 96-луночных планшетах монослою клеток Vero E6 добавляли различные концентрации соединения 1, после чего в лунки вносили суспензию эффекторных клеток 293Т-S-GFP (соотношение клеток 3 : 1). Через 2 ч количество образовавшихся синцитиев оценивали с помощью флуоресцентной микроскопии. Эффективность подавления слияния клеток, индуцированного S-гликопротеином SARS-CoV-2, оценивали по сравнению с контролем (без внесения соединения) с помощью программного обеспечения GraphPadPrism 5.0 и выражали в процентах.

Определение ИФН-индуцирующей активности

Забор крови у животных проводили методом декапитации в пробирки без антикоагулянта через 2, 24, 48, 72 ч после однократного внутрибрюшинного введения соединения 1 в дозе 121.2 мкмоль/мышь (70 мкг/мышь) или 0.2 мл дистиллированной воды (плацебо, контроль без препарата). Активность ИФН в сыворотке крови мышей определяли на клеточной линии мышиных фибробластов L-929. В работе использовали трехдневный монослой перевиваемой клеточной линии L-929, выращенный на среде 199 и DMEM (1 : 1) с добавлением 7% ЭТС, L-глутамина и антибиотиков: 150 Ед/мл пенициллина и 150 Ед/мл стрептомицина. ИФН в сыворотке крови определяли при титровании проб в культуре фибробластов L-929 мыши с использованием в качестве индикаторного вируса ВЭМК мыши, находя конечное разведение ИФН, которое защищало 50% клеток от цитопатогенного действия 100 ТЦИД50 вируса.

Статистический анализ

Расчет значений 50% цитотоксической концентрации (CC50) и 50% эффективной концентрации (IC50) выполняли общепринятыми для биологических исследований методами при помощи пакета программ Microsoft Excel 5.0 и GraphPad Prism 6.01. За рабочую модель для анализа CC50 принимали 4-параметрическое уравнение логистической кривой (пункты меню «Нелинейная регрессия» – «Sigmoidal dose-response (variable slope)»). Для анализа IC50 принимали 4-параметрическое уравнение логистической кривой (пункты меню «Нелинейная регрессия» – «log (inhibitor) vs. response (variable slope)»). На основании полученных данных рассчитывали индекс селективности (SI) по уравнению: SI = СС50/ IC50.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Определение цитотоксичности соединения 1

На основании данных, полученных при изучении цитотоксического действия соединения 1 на культуру клеток Vero E6 с использованием витального красителя MTS, построили аналитическую кривую, из которой определили значение СС50 для соединения 1. Концентрация, уменьшающая значение оптической плотности на 50% по сравнению с контролем, составила 83.32 мкг/мл (144.30 мкМ) (рис. 6).

 

Рис. 6. Определение цитотоксического действия соединения 1 через 96 ч после добавления к культуре клеток Vero Е6 (c использованием витального красителя MTS). СС50 = 83.32 мкг/мл

 

Определение противовирусной активности соединения 1

Противовирусную активность соединения 1 определяли по снижению инфекционного титра вируса (ТЦИД50/мл) в культуре клеток Vero E6 (табл. 1).

 

Таблица 1. Действие соединения 1 на репродукцию SARS-CoV-2

Концентрация соединения 1, мкМ (мкг/мл)

ТЦИД50

Контроль вируса

Δlgmax максимальное снижение заражающей вирусной дозы в опыте по сравнению с контролем, выраженное в десятичных логарифмах

52.0 (30.0)

100

106

6

26.0 (15.0)

101

106

5

13.0 (7.5)

103

106

3

Примечание: ТЦИД50 – 50% тканевая цитопатогенная инфекционная доза.

 

Как видно из табл. 1, исследуемое соединение обладает достоверной дозозависимой антивирусной активностью in vitro, что указывает на специ­фический характер действия соединения, и полностью подавляет репродукцию вируса SARS-CoV-2 при концентрации 52.0 мкМ (30 мкг/мл), т.е. на 6 lg ТЦИД50. В вирусологических исследованиях противовирусный эффект лекарственных средств принято считать удовлетворительным, если Δlg ТЦИД50 ≥ 2.0 [13].

Значение IC50 для изучаемого соединения, рассчитанное с помощью программного обеспечения GraphPadPrism 6.01, составило 1.84 мкМ (1.06 мкг/мл). Значение индекса селективности (SI), рассчитанное как отношение CC50 к IC50 (SI = CC50/IС50), составило 78.6.

Исследования эффективности ингибирования синцитиеобразования, индуцированного шиповидным белком (S-гликопротеином) вируса SARS-CoV-2

Проведены дополнительные исследования в системе синцитиеобразования, опосредованного шиповидным белком (S-гликопротеином) SARS-CoV-2. Обнаружено подавление синцитиеобразования, индуцированного шиповидным белком (S-гликопротеином) SARS-CoV-2, на 89%.

Определение интерферон (ИФН)-индуцирующего действия соединения 1

Результаты титрования представлены в табл. 2.

 

Таблица 2. Активность ИФН в сыворотке крови мышей

Время после введения соединения 1 или плацебо мышам, ч

Титр ИФН (Ед/мл)

Соединение 1 (70 мкг/мышь)

Плацебо (контроль без препарата)

2

40

< 4

24

20

48

20

72

20

 

Показано, что соединение 1 обладало ИФН-индуцирующей активностью при его однократном внутрибрюшинном введении в дозе 121.2 мкмоль/мышь (70 мкг/мышь).

ОБСУЖДЕНИЕ

Коронавирус, открытый и описанный в 60-х гг. прошлого столетия, не привлекал к себе значительного внимания, поскольку вызывал легко протекающие острые респираторные инфекции [14, 15]. Однако пандемия коронавирусной инфекции COVID-19 изменила отношение к коронавирусам и привела к поиску противовирусных средств, эффективных в отношении SARS-CoV-2. Поиск и разработка лекарственных средств для применения при пандемической коронавирусной инфекции тесно связаны с точкой приложения к вирусной репродукции и эффектам его действия при лечении больных. Исходя из последних опубликованных данных, инфекцию SARS-CoV-2 разделяют на четыре стадии, связанные с различными требованиями к лекарственным препаратам [16–18]. Так, стадия до контакта с SARS-CoV-2 предпочтительна для профилактической вакцинации, нейтрализующих антител и профилактических противовирусных препаратов. На следующей стадии, когда произошло заражение и идет репликация вируса, эффективно применение антител и противовирусных внутривенных и/или пероральных препаратов. К настоящему времени установлено, что эффект от лечения наблюдается, если антитела против SARS-CoV-2 вводить в течение 10 дней после появления симптомов [19, 20]; а пероральные противовирусные препараты могут оказывать эффект в течение 3–5 дней после появления симптомов [17, 21]. Известно, что репродукция вируса SARS-CoV-2 возрастает примерно в течение 3–5 дней после появления клинических симптомов, а затем снижается в течение двух-трех дней. Последующие клинические события связаны с нарушением регуляции иммунного ответа на SARS-CoV-2 [22]. Однако у некоторых больных рецидивы симптомов COVID-19 и наличие вируса выявляли значительно позже, что свидетельствовало о сохранности и репродукции вируса в отдельных компартментах на поздних сроках [23]. Таким образом, стало понятно, что для подавления реактивации вируса на поздних сроках заболевания также необходим доступный пероральный противовирусный и иммуномодулирующий низкомолекулярный препарат, который можно использовать при реактивации инфекции.

Обширный поиск позволил выявить значительное число соединений с анти-SARS-CoV-2-активностью в доклинических и клинических исследованиях (низкомолекулярные соединения, моноклональные антитела, ингибиторы пептидов, макромолекулярные ингибиторы, а также использование РНК-терапии и клеточной терапии) [24–26].

Имеющиеся противовирусные химиотерапевтические препараты, подавляющие вирусную репродукцию, в том числе аномальные нуклеозиды, ингибиторы вирусспецифических белков и ферментов, в отличие от вакцин, как правило, эффективны в отношении большего круга патогенных вирусов. Однако в ходе их применения нередко развиваются побочные эффекты и также формируются резистентные штаммы вируса, что приводит к рецидиву и обострению заболевания [27, 28].

Одним из широко используемых отечественных противовирусных препаратов является умифеновир (Арбидол, международное наименование Umifenovirum) [29], который включен в методические рекомендации по профилактике и лечению COVID-19 [18]. По данным Leneva и соавт. [30], умифеновир обладает противовирусным действием и ингибирует слияние вирусной оболочки с клеточными мембранами. Это приводит к невозможности проникновения вируса в клетку и подавлению его репродукции. Показано, что умифеновир ингибирует репликацию SARS-CoV-2 в клетках Vero E6 [31, 32]. Однако низкая биодоступность и нерастворимость в воде ограничили терапевтическую эффективность Арбидола и не позволили ему занять лидирующие позиции среди противоковидных лекарственных препаратов [33, 34].

Лекарственный препарат, который предполагается разработать на основе дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)карбонилиндола, по-видимому, будет направлен предпочтительно на профилактику заражения и подавление репродукции SARS-CoV-2. Именно на этой стадии необходимо подавить репликацию и репродукцию вируса в соседних клетках и стимулировать реакции врожденного иммунитета путем активации рецепторов и индукции системы интерферона. По-видимому, этому может содействовать способность соединения в концентрации 52.0 мкМ полностью подавлять репродукцию вируса SARS-CoV-2 в клетках и обнаруженный эффективный механизм ингибирования синцитиеобразования, индуцированного шиповидным белком (S-гликопротеином) вируса SARS-CoV-2. Выявленная способность соединения индуцировать интерфероны, по-видимому, может свидетельствовать о его потенциале активировать систему интерферона и реакции врожденного иммунитета, что также позволяет использовать разрабатываемый препарат для подавления происходящих при COVID-19 следующих друг за другом этапов иммунной дисрегуляции.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Полученные результаты демонстрируют противовирусный эффект синтезированного соединения 1 в отношении SARS-CoV-2 в исследованиях in vitro. В концентрации 52.0 мкМ данное соединение полностью ингибирует репродукцию вируса SARS-CoV-2 с инфекционной активностью 106 ТЦИД50/мл. Концентрационные зависимости свидетельствуют о специфичности действия исследуемого соединения и указывают на перспективность разработанного соединения и возможность дальнейшего его изучения in vivo на экспериментальных животных. Соединение 1, благодаря его синтетической доступности, высокой активности (IC50 = 1.06 мкг/мл) и высокого индекса селективности (SI = 78.6), отвечает требованиям, необходимым для разработки противовирусного средства для профилактики и лечения COVID-19.

Работа выполнена в рамках государственного задания Министерства здравоохранения Российской Федерации (тема № 056-00119-21-00).

×

Об авторах

А. Н. Наровлянский

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Автор, ответственный за переписку.
Email: narovl@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

М. В. Филимонова

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

Н. Г. Цышкова

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

А. В. Пронин

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: proninalexander@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

Т. В. Гребенникова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: t_grebennikova@mail.ru
Россия, 123098, Москва

Э. В. Карамов

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: karamov2004@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

В. Ф. Ларичев

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: vlarichev@mail.ru
Россия, 123098, Москва

Г. В. Корнилаева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: kornilaeva@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

И. Т. Федякина

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: irfed2@mail.ru
Россия, 123098, Москва

И. В. Должикова

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: iv.dolzhikova@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

М. В. Мезенцева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: marmez@mail.ru
Россия, 123098, Москва

Е. И. Исаева

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: immunol.lab@mail.ru
Россия, 123098, Москва

В. В. Полосков

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: en-vladislav@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

Л. С. Коваль

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

В. П. Маринченко

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

В. И. Суринова

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

А. С. Филимонов

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

А. А. Шитова

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

О. В. Солдатова

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

А. В. Санин

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: saninalex@inbox.ru
Россия, 123098, Москва

И. К. Зубашев

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: izubaschev@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

А. В. Пономарев

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: hapratmiraturkanikelovka@gmail.com
Россия, 123098, Москва

В. В. Веселовский

Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН

Email: ves@ioc.ac.ru
Россия, 119991, Москва

В. В. Козлов

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации; ООО «Гамасинтез»

Email: hyperslava@yandex.ru
Россия, 123098, Москва; 123098, Москва

А. В. Степанов

Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН

Email: av_stepanov@mail.ru
Россия, 119991, Москва

А. В. Хомич

ООО «Гамасинтез»

Email: awh@rambler.ru
Россия, 123098, Москва

В. С. Козлов

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: vasss2@yandex.ru
Россия, 123098, Москва

С. А. Иванов

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

П. В. Шегай

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

А. Д. Каприн

Национальный медицинский исследовательский центр радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: mari_fil@mail.ru
Россия, 249036, Обнинск

Ф. И. Ершов

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: felixershov@gmail.com
Россия, 123098, Москва

А. Л. Гинцбург

Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи Министерства здравоохранения Российской Федерации

Email: info@gamaleya.org
Россия, 123098, Москва

Список литературы

  1. ВОЗ объявила об окончании пандемии коронавируса. https://www.rbc.ru/society/05/05/2023/645503499a79477d05bf2bb4https://www.rbc.ru/society/05/05/2023/645503499a79477d05bf2bb4
  2. WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard (WHO, accessed 12.06.2023); https://covid19.who.int/
  3. LIVE: Media briefing on COVID-19 and global health issues. World Health Organization (WHO). https://www.youtube.com/watch?v=B0oBevft4bs
  4. Crook H., Raza S., Nowell J., Young M., Edison P. // BMJ. 2021. V. 374. № 1648. P. 1–18.
  5. Coopersmith C.M., Antonelli M., Bauer S.R., Deutschman C.S., Evans L.E., Ferrer R., Hellman J., Jog S., Kesecioglu J., Kissoon N., et al. // Crit. Care Med. 2021. V. 49. № 4. P. 598–622.
  6. Good S.S., Westover J., Jung K.H., Zhou X.J., Moussa A., La Colla P., Collu G., Canard B., Sommadossi J.P. // Antimicrob. Agents Chemother. 2021. V. 65. № 4. P. e02479–20.
  7. Филимонова М.В., Цышкова Н.Г., Наровлянский А.Н., Маринченко В.П., Коваль Л.С., Парфенова Т.М., Изместьева А.В., Ершов Ф.И. Патент RU 2552422 С2. Российская Федерация. МПК C07D209/42(2006.01); A61K31/404(2006.01); A61P31/12(2006.01). 2015.
  8. Trofimov F.A., Tsyshkova N.G., Grinev A.N. // Chem. Heterocycl. Compd. 1973. V. 9. P. 282–285.
  9. Общая фармакопейная статья (ОФС.1.2.1.0005.15). Государственная фармакопея Российской Федерации. 14 изд. Т. 1. М., 2015. https://pharmacopoeia.ru/ofs-1-2-1-0005-15-rastvorimost/
  10. European Convention for the Protection of Vertebrate Animals Used for Experimental and other Scientific Purposes (ETS 123). // Strasbourg, 1986. 11 p.
  11. ГОСТ. Руководство по содержанию и уходу за лабораторными животными. Правила оборудования помещений и организации процедур; Guidelines for accommodation and care of animals. Environment, housing and management. МКС 13.020.01. Дата введения 2016-07-01. https://docs.cntd.ru/document/1200127789
  12. CellTiter 96® AQueous One Solution Cell Proliferation Assay (MTS) («Promega», G3582). Instructions for use of products G3580, G3581 and G3582. Technical Bulletin.
  13. Руководство по проведению доклинических исследований лекарственных средств // под ред. Миронова А.Н. Ч. 1. М.: Гриф и К, 2012. С. 527–551.
  14. Tyrrell D.A.J., Bynoe M.L. // Br. Med. J. 1965. V. 1. P. 1467–1470.
  15. Almeida J.D., Berry D., Cunningham C., Hamre D., Hofstad M.S., Mallucci L., McIntosh K., Tyrrell D.A.J. // Nature. 1968. V. 220. № 16. P. 650.
  16. Cascella M., Rajnik M., Aleem A., Dulebohn S.C., Di Napoli R. Features, Evaluation and Treatment Coronavirus (COVID-19). // StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publ., 2023.
  17. Toussi S.S., Hammond J.L., Gerstenberger B.S., Andersen A.S. // Nat. Microbiol. 2023. V. 8. P. 771–786.
  18. Временные методические рекомендации. «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Версия 17 (09.12.2022)».
  19. Fact Sheet for Health Care Providers Emergency Use Authorization (EUA) of Bamlanivimab and Etesevimab. Eli Lilly and Company, 2022.
  20. Fact Sheet for Health Care Providers Emergency Use Authorization (EUA) of REGEN-COV (Casirivimab and Imdevimab). Regeneron, 2022.
  21. Petty L.A.., Malani P.N. // JAMA. 2022. V. 327. № 24. P. 2464.
  22. Vetter P., Eberhardt C.S., Meyer B., Murillo M., Torriani G., Pigny F., Lemeille S., Cordey S., Laubscher F., Vu D.L. et al. // mSphere. 2020. V. 5. № 6. P. e00827–20.
  23. Deo R., Choudhary M.C., Moser C., Ritz J., Daar E.S., Wohl D.A., Greninger A.L., Eron J.J., Currier J.S., Hughes M.D., et al. // Ann. Intern. Med. 2023. V. 176. № 3. P. 348–354.
  24. Li G., Hilgenfeld R., Whitley R., De Clercq E. // Nat. Rev. Drug Discov. 2023. V. 22. № 6. P. 449–475.
  25. Zaki M.M., Lesha E., Said K., Kiaee K., Robinson-McCarthy L., George H., Hanna A., Appleton E., Liu S., Ng A.H.M., et al. // Sci. Adv. 2021. V. 7. № 33. P. eabg5995.
  26. Meganck R.M., Baric R.S. // Nat. Med. 2021. V. 27. № 3. P. 401–410.
  27. Samson M., Pizzorno A., Abed Y., Boivin G. // Antiviral Res. 2013. V. 98. № 2. P. 174–185.
  28. Wyles D.L. // J. Infect. Dis. 2013. V. 207. № 1. P. 33–39.
  29. WHO Collaborating Centre for Drug Statistics Methodology. J05 Antivirals for systemic use. J05AX Other antivirals. https://www.whocc.no/atc_ddd_index/?code=J05AX.
  30. Leneva I.A., Russell R.J., Boriskin Y.S., Hay A.J. // Antiviral Res. 2009. V. 81. № 2. P. 132–140.
  31. Leneva I., Kartashova N., Poromov A., Gracheva A., Korchevaya E., Glubokova E., Borisova O., Shtro A., Loginova S., Shchukina V., et al. // Viruses. 2021. V. 13. № 8. P. 1665.
  32. Ge Y., Tian T., Huang S., Wan F., Li J., Li S., Wang X., Yang H., Hong L., Wu N., et al. // Signal Transduct. Target Ther. 2021. V. 6. № 1. P. 165.
  33. Chen C., Zhang Y., Huang J., Yin P., Cheng Z., Wu J., Chen S., Zhang Y., Chen B., Lu M., et al. // Front. Pharmacol. 2021. V. 12. P. 683296.
  34. Арчаков А.И., Гусева М.К., Учайкин В.Ф., Ипатова О.М., Дощицин Ю.Ф., Тихонова Е.Г., Медведева Н.В., Прозоровский В.Н., Стрекалова О.С., Широнин А.В. Патент PCT/WO2010128889A1, РФ. МПК А61К9/19. 2010.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Дигидрохлорид 6-бром-1-метил-5-метокси-2-(1-пиперидинометил)-3-(2-диэтиламиноэтокси)карбонилиндола (соединение 1)

Скачать (53KB)
3. Рис. 2. Реагенты и условия: a. 1) водн. NaOH, диоксан, 2) Me2SO4, 20°C; б. N-бромсукцинимид, CCl4, кип.; в. N-бромсукцинимид, (PhCOO)2, CCl4, облучение (лампа 100 Вт), кип.; г. пиперидин, PhH, 20°C; д. 1) водн. NaOH, EtOH, кип., 2) HCl (конц.); е. SOCl2, диоксан, ДМФА (кат.), 60°C; ж. 1) Et2NCH2CH2OH, Et3N, PhH, кип., 2) HCl, Et2O, ацетон, 20°C

Скачать (361KB)
4. Рис. 3. ИК-спектр соединения 1

Скачать (139KB)
5. Рис. 4. 1Н-ЯМР-спектр соединения 1

Скачать (113KB)
6. Рис. 5. Масс-спектр соединения 1

Скачать (101KB)
7. Рис. 6. Определение цитотоксического действия соединения 1 через 96 ч после добавления к культуре клеток Vero Е6 (c использованием витального красителя MTS). СС50 = 83.32 мкг/мл

Скачать (115KB)

© Наровлянский А.Н., Филимонова М.В., Цышкова Н.Г., Пронин А.В., Гребенникова Т.В., Карамов Э.В., Ларичев В.Ф., Корнилаева Г.В., Федякина И.Т., Должикова И.В., Мезенцева М.В., Исаева Е.И., Полосков В.В., Коваль Л.С., Маринченко В.П., Суринова В.И., Филимонов А.С., Шитова А.А., Солдатова О.В., Санин А.В., Зубашев И.К., Пономарев А.В., Веселовский В.В., Козлов В.В., Степанов А.В., Хомич А.В., Козлов В.С., Иванов С.А., Шегай П.В., Каприн А.Д., Ершов Ф.И., Гинцбург А.Л., 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах