Профиль посттрансляционных модификаций гистона Н1 в хроматине эмбриональных стволовых клеток мыши

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Линкерный гистон H1 - один из основных ядерных белков, принимающих участие в структурно регуляторной организации хроматина. Ряд данных указывает на то, что посттрансляционные модификации H1 способны модулировать активность хроматина. С помощью масс-спектрометрии высокого разрешения (MALDI-FT-ICR-MS) мы обнаружили существенные различия в природе и положениях посттрансляционных модификаций в некоторых вариантах гистона H1 (H1.3-H1.5) из эмбриональных стволовых клеток и дифференцированных клеток - иммортализованных фибробластов линии NIH/3T3 и эмбриональных фибробластов (МЭФ). Так, метилирование K75 в вариантах H1.2-1.4, метилирование K108, K148, K151, K152 K154, K155, K160, K161, K179 и K185 в Н1.1, а также K168 в H1.2, фосфорилирование S129, T146, T149, S159, S163 и S180 в H1.1, T180 в H1.2 и T155 в H1.3 идентифицированы исключительно в эмбриональных стволовых клетках. Большинство сайтов ацетилирования вариантов H1.0 и H1.2 в эмбриональных стволовых клетках расположены в C-концевых доменах, известных своим участием в стабилизации конденсированного хроматина. Полученные данные могут послужить основой для дальнейших исследований, направленных на анализ функциональной значимости посттрансляционной модификации гистона H1 для процессов самообновления и дифференцировки плюрипотентных стволовых клеток.

Полный текст

ВВЕДЕНИЕ Архитектурные белки хроматина, такие, как гистон H1, взаимодействуют с нуклеосомами без явной специфичности к последовательности ДНК, способ ствуя формированию локально и/или глобально из мененной архитектуры хроматина [1-8]. Белки се мейства гистонов H1 человека и мыши представлены семью соматическими подтипами (от H1.0 до H1.5 и H1X) и четырьмя уникальными вариантами (H1t, H1T2m, HILS1 и H1oo), характерными для половых клеток [9-13]. Несмотря на высокую структурную консервативность, подтипы H1 различаются эволю ционной стабильностью, распределением в эухрома тине/гетерохроматине и аффинностью связывания хроматина, что может быть результатом посттран сляционных модификаций (ПТМ) [14-17]. Хроматин эмбриональных стволовых клеток (ЭСК) и индуцированных плюрипотентных клеток активно изучается в течение последних нескольких десяти летий в связи с огромным потенциалом использо вания ЭСК в биомедицине. За это время показано, что гетерохроматин ЭСК более «открыт», чем в диф ференцированных клетках [18], и это свойство, при водящее к глобально повышенной транскрипции, мо жет быть результатом снижения экспрессии белков H1 [19] и ПТМ ядерных белков [18-20]. В рамках нашего исследования с помощью соче тания физико-химических и биологических подхо дов выявлены новые ПТМ гистона H1, специфически присутствующие в хроматине ЭСК, но не в диффе ренцированных клетках мыши. Обсуждается воз можная роль выявленных модификаций в струк турно-регуляторной организации хроматина этих клеток. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ Все процедуры на животных выполняли в соответ ствии с принципами гуманного использования лабо раторных животных по стандартам, предписанным Американским физиологическим обществом. Работа с мышами выполнялась строго в соответствии с за конодательными актами Российской Федерации о за щите животных и была одобрена Советом по этике Института как гуманное использование лаборатор ных животных. Эмбриональные фибробласты мыши (МЭФ) выде лены из 13.5-дневных зародышей мыши после есте ственного спаривания животных. ЭСК мыши линии E14Tg2A приобретены в BayGenomics. Клеточная линия NIH/3T3 получена из Российской коллек ции клеточных культур Института цитологии РАН (Санкт-Петербург, Россия). Культивирование клеточных линий Клетки NIH/3T3 и МЭФ культивировали в DMEM с добавлением 10% эмбриональной бычьей сыворот ки, L-глутамина и 1% пенициллина/ стрептомицина [21, 22]. ЭСК культивировали в DMEM/F12 с добав лением 15% фетальной бычьей сыворотки, 1% пени циллина/стрептомицина, L-глутамина, незаменимых аминокислот и лейкозингибирующего фактора (LIF) на обработанных желатином культуральных чашках. Клетки промывали PBS (pH 7.5), обрабатывали 0.05% трипсином (10 мин при 37°C) и собирали центрифуги рованием при 2000 g в течение 5 мин. Клеточный оса док с 6-8 чашек (d = 10 см) замораживали в жидком азоте и хранили при -70°С. Экстракция и разделение вариантов гистона Н1 Для сохранения интактных ПTM белки H1 выде ляли из клеток напрямую (минуя стадию выделе ния ядер) с помощью 5% хлорной кислоты с после дующим осаждением подкисленным ацетоном [7]. Варианты H1 разделяли методом двухмерного гель электрофореза в полиакриламидном геле [7, 8]. Ферментативный гидролиз и анализ MALDI-FTICR- MS После проведения 2D-электрофореза фрагмен ты геля, содержащие ядерные белки, вырезали, измельчали и обрабатывали 40% ацетонитрилом в 0.1 М бикарбонате аммония при 37°С в течение 15 мин как описано ранее [7]. Биологические образ цы анализировали в двух биологических и двухтрех аналитических повторностях. Масс-спектры регистрировали в режиме положительных ионов в диапазоне 500-3000 м/z с использованием масс спектрометра MALDI-FT-ICR (Varian 902-MS), оснащенного сверхпроводящим магнитом 9.4 Тл и УФ-лазером (Nd: YAG) [7]. Спектры анализирова ли с использованием программных пакетов Mascot (www.matrixscience.com; Matrix Science, Лондон, Великобритания) и Protein Prospector MS-Fit (http://prospector.ucsf.edu) как описано ранее [7]. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ Целью нашей работы было сравнение ПТМ лин керных гистонов H1 из дифференцирован ных и эмбриональных стволовых клеток мыши. Варианты гистона H1 мы разделяли с использова нием сочетания AU-PAGE с SDS-PAGE, что осо бенно оправдано в случае идентификации заря женных кислотно-растворимых белков, включая гистоны [7, 8, 23, 24]. На рис. 1 представлены ре зультаты 2D-электрофоретического разделе ния вариантов H1 хроматина из двух типов диф ференцированных клеток, иммортализованных фибробластов мыши линии NIH/3T3 и первич ных эмбриональных фибробластов мыши (МЭФ), а также плюрипотентных клеток мыши (ЭСК ли нии E14Tg2А). В результате анализа электрофоре грамм мы идентифицировали в клетках NIH/3T3 пять фракций, содержащих варианты Н1 (рис. 1A), семь фракций в МЭФ (рис. 1Б) и восемь в ЭСК (рис. 1В). Оставшиеся фракции включают белки се мейства HMG (High Mobility Group) и другие ядер ные белки (табл. S1 [25]). Результаты MS-анализа H1 представлены в табл. S2 [25] и на рис. 2-4. Обнаружены и проанализированы шесть изоформ H1 (H1.0-H1.5). Идентифицированные ПТМ подтипов H1 из NIH/3T3, МЭФ и ЭСК представлены в табли це и на рис. 5. На рис. 5 дополнительно представлены ранее идентифицированные ПТМ гистона H1 из ти муса мыши [7]. Метилирование Гистоны H1 - одна из основных групп ядерных белков хроматина, которые участвуют в продоль ном уплотнении реплицирующейся хромосомы [24]. В хроматине ЭСК на одну нуклеосому приходится 0.5 молекулы H1 (суммарно всех подтипов), что при мерно в 2 раза ниже, чем в хроматине дифференци рованных клеток [26]. Истощение линкерного гисто на H1 приводит к снижению степени компактизации хроматина, уменьшению глобального расстояния между нуклеосомами и снижению степени ПТМ не которых гистонов, таких, как метилирование [26]. Сравнительный анализ ПТМ вариантов H1 из кле ток NIH/3T3, МЭФ и ЭСК выявил снижение степени метилирования вариантов H1.4 и H1.5 в ЭСК по срав нению с дифференцированными клетками (рис. 5). Идентифицированные сайты метилирования белков H1 расположены, в основном, в области глобулярно го домена в положениях K34/K35, K63/65 и K73/75 в зависимости от варианта H1 (таблица). Большинство выявленных нами таких ПТМ, как meK63/64, в вариантах Н1.2-H1.4, meK47 в H1.3, meK97 в H1.2, meK117 в H1.2 и meK27 в H1.5 уже описаны ранее [7, 8, 10-12]. Считается, что метили рование в этих положениях защищает аминогруп пы лизинов, вызывая увеличение сродства гистона к ДНК и облегчение перехода хроматина в локально репрессированное состояние [7, 8]. Помимо описан ных выше ПТМ, мы идентифицировали метилиро вание K75 вариантов H1.2-1.4 исключительно в ЭСК (рис. 5, табл. S2 [25]), расположенное в глобулярном домене Н1, которое также может приводить к защите аминогруппы лизина в этих клетках. Потенциальные сайты метилирования K108, K148, K151, K152, K154, K155, K160, K161, K179 и K185 в Н1.1, K168 в H1.2 также идентифицированы исклю чительно в клетках ЭСК, тогда как метилирование K202 и K204 в H1.4 - только в дифференцирован ных клетках NIH/3T3 и МЭФ. Большинство из этих ПТМ расположены в мотивах (S/T)PXK или (S/T) PXZ (где Х - любой аминокислотный остаток) вбли зи фосфорилированных серинов и треонинов H1. Потенциальная роль этих модификаций рассмотрена в разделе «Фосфорилирование». Ацетилирование Согласно нашим данным, общий уровень ацетили рования H1 в ЭСК оказался выше, чем в диффе ренцированных клетках (рис. 5). Как и ожидалось, мы идентифицировали несколько сайтов ацети лирования в N-концевом и глобулярном доменах H1 (таблица). В большинстве случаев точная био логическая роль этих модификаций не установлена. Ацетилирование одного из наиболее изучен ных сайтов - acK34-H1.4, является отличительным признаком промоторов транскрипционно активных генов и помогает привлекать к промоторам ком плекс инициации транскрипции TFIID [27]. Однако мы не обнаружили acK34-H1.4 ни в одном из иссле дованных типах клеток. В то же время мы наблю дали метилирование в этой позиции варианта H1.4 в NIH/3T3 и МЭФ, но не в ЭСК. Мы предполагаем, что деметилирование K34-H1.4 ЭСК может способ ствовать ацетилированию в этом сайте и облегчать рекрутирование транскрипционного фактора TFIID к промоторным областям. Кроме того, согласно на шим данным, Н1 ЭСК характеризуется наличием acK83 и acK87 в H1.1 и acK81 в H1.2. Снижение поло жительного заряда в этой области вследствие ацети лирования аминогруппы остатков лизина может при вести к дестабилизации взаимодействий H1 с ДНК и, в свою очередь, способствовать образованию локаль но релаксированного состояния хроматина. Образование «открытого» хроматина также мо жет облегчаться ацетилированием остатков ли зина в С-концевых областях вариантов H1.1-H1.3. Более того, большинство из этих C-концевых ЭСК специфичных сайтов ацетилирования и метилиро вания вариантов H1.1-H1.3 расположены в мотивах (S/T)PXK или (S/T)PXZ вблизи фосфорилирован ных остатков серина и треонина. Их потенциальная биологическая роль и механизм регуляции взаимо действия H1-ДНК, опосредуемый ацетилировани ем/метилированием лизинов в мотивах (S/T)PXK или (S/T)РXZ, более подробно обсуждаются в раз деле «Фосфорилирование». Фосфорилирование Нами идентифицирован ряд сайтов фосфорили рования гистонов H1, таких, как T24, S115, T120 и S123 в H1.1, S2, S41, T154 и T173 в H1.2, харак терных как для дифференцированных клеток, так и для ЭСК. В то же время несколько потенциаль ных сайтов фосфорилирования подтипов Н1 выяв лено исключительно в ЭСК: S129, T146, T149, S159, S163 и S180 в H1.1, T180 в H1.2 и T155 в H1.3 (рис. 5, табл. S2 [25]). Идентифицированные сайты фосфо рилирования расположены в основном в С-концевых доменах H1, в том числе в мотивах (S/T)PXK и (S/T) PXZ (рис. 5), которые фосфорилируются во время митоза и модулируют тем самым состояние хромати на [15, 28-34]. Вопрос о функциональной связи фос форилирования и/или его отсутствия в ряде сайтов других подтипов H1 с поддержанием плюрипотент ности ЭСК и способностью дифференцировки этих клеток остается пока открытым. Известно, что фосфорилирование S173 (H1.2) и S187 (H1.4), происходящее во время интерфазы, не обходимо для релаксации хроматина и активации транскрипции [15, 30-32]. Принимая во внимание тот факт, что эти остатки серина лежат в пределах об ластей, структурно напоминающих так называемые участки с механизмом двоичного метилирования/ фосфорилирования (methyl-phospho switch regions) коровых гистонов, метилирование K172 H1.2 в ЭСК может способствовать фосфорилированию соседнего S173. В свою очередь, pS173 может стимулировать ацетилирование K172, приводящее к активации транскрипции. Мы идентифицировали несколько спарен ных ПТМ, таких, как meK148/pT149-H1.1 и meK179/pS180 (H1.1 в ЭСК), meK191/pS192 (H1.5 в МЭФ), которые расположены в основном в C-концевых областях белков (рис. 5). Их структур ная организация также напоминает области methyl phospho switch regions основных гистонов. Один из примеров данного типа регуляции - сайт K9/S10 в гистоне H3 [35-38]. Регуляторное состояние сайта K9/S10 характеризуется стабильным meK и дина мическим фосфорилированием остатка S/T, который находится вблизи K. Фосфорилирование S10 и S28 в H3 приводит к ацетилированию в K9 и K27 соответ ственно, что способствует активации транскрипции [39]. Кроме того, мы также идентифицировали ряд сайтов ацетилирования/фосфорилирования, вклю чая acK17/pT18 (H1.4 и H1.5 в клетках NIH/3T3), acK17/pT18 (H1.3 в МЭФ), acK23/pT24 (H1.1 в МЭФ), acK184/pS185 (H1.0 в МЭФ), acK153/pT154 (H1.2 в МЭФ и ЭСК), acK154/pT155 (H1.3 в ЭСК) и acK172/pS173 (H1.2 в ЭСК). Эти области ацетилиро вания/фосфорилирования характерны как для ЭСК, так и для дифференцированных клеток. Их струк турная организация также напоминает области methyl-phospho switch regions за исключением того, что метилирование изменяется на ацетилиро вание. Возможно, что и в данном случае мы имеем дело с участками methyl-acetyl-phospho switch регуляции, рассмотренными выше [40, 41], и ацети лирование этих сайтов также может приводить к ак тивации транскрипции. Однако эта гипотеза требует дальнейшей экспериментальной проверки. Цитруллирование Ранее было показано, что цитруллирование H1.2- H1.4 в R54 способствует приобретению и поддер жанию состояния плюрипотентности клеток [42]. Фактически это проявляется в нарушении свя зывания H1 с хроматином, что вызывает фор мирование «открытого» состояния хроматина. Цитруллирование - это процесс замены аргинина на цитруллин, которое приводит к смещению пика пептида ERSGVSLAALK на 0.9844 м/z в масс спектрах. Мы наблюдали смещенный пик низкой интенсивности в области 1131.64 м/z, однако вероят ность его правильного отнесения составляет 9.8 ppm. При анализе спектров мы не учитывали пики свыше 3.0 ppm. Таким образом, мы не можем точно показать, имеет ли место цитруллирование R54 в наших образ цах H1.2-H1.4 из ЭСК. Формилирование Известно, что H1.2 в положениях K63-K85 и K97 в тканях мыши, но не в хроматине иммортализо ванных клеточных линий, может подвергаться формилированию [43]. Мы также не идентифицирова ли сайты формилирования H1 в изученных нами клеточных линиях. Роль данной ПТМ неизвестна, но предполагается, что формилирование может катализироваться неким специфическим фермен том во время деметилирования остатков лизина аминоксидазой LSD1 [44]. Окисление Нами идентифицирован сайт окисления метиони на до метионинсульфоксида MetO [45] в положении M31 гистона H1.0 дифференцированных клеток, но не в ЭСК (табл. 2S [25]). Положение остатков М в белках часто способствует образованию гидро фобных связей между их атомами серы и кольцами ароматических остатков триптофана, фенилаланина или тирозина [46]. Эти гидрофобные серно-кольце вые связи создают структурную стабильность бел ков, примерно равную стабильности ионного солево го мостика [46]. Взаимодействие с М устанавливает оптимальное положение, необходимое для обеспече ния антиоксидантной защиты ароматических ами нокислот. Окисление метионина до MetO разрушает эту гидрофобную связь и может влиять на форми рование нормальной трехмерной структуры белка. Окисленные белки характеризуются повышенной гидрофобностью поверхности [47], что коррелирует с возрастным увеличением содержания MetO [45]. Отсутствие сайтов окисления H1 в ЭСК согласуется с неограниченным потенциалом самообновления этих клеток. ЗАКЛЮЧЕНИЕ В представленном исследовании проведено сравне ние потенциальных сайтов ПТМ гистона H1 в диффе ренцированных и эмбриональных стволовых клетках мыши. Выявлено сходство общих уровней метилиро вания/ацетилирования H1.3-H1.5, природы и поло жения посттрансляционных модификаций гистонов H1.3-H1.5 в ЭСК и дифференцированных клетках. При этом уровни ацетилирования H1.0 и H1.2 в ЭСК (в дополнение к ранее известным фактам о сниже нии уровня их экспрессии в хроматине ЭСК [20]) в целом выше, чем в гистонах дифференцированных клеток (pис. 5). Большинство потенциальных сай тов ацетилирования H1.0 и H1.2 в ЭСК расположены в С-концевых доменах белков, а именно в областях 97-121 и 145-169. Эти области локализованы в двух известных субдоменах С-концевого фрагмента, уча ствующих в стабилизации конденсированного хро матина [20, 48]. Уменьшение положительного заряда N- и C-концевых областей белков H1 может осла бить взаимодействие H1-ДНК на входе/выходе ДНК из коровой частицы и предотвратить взаимодействие H1 с регуляторными белками хроматина, такими, как HMGN и HMGB1/2 [49, 50]. Известно, что белки HMGB1/2 способны вытеснять гистон H1 из ДНК белкового комплекса и тем самым облегчать ремо делирование нуклеосомы, обеспечивая доступность ДНК для факторов транскрипции [51]. Смещение H1 из нуклеосомы должно привести к образованию «открытой» структуры хроматина, что свойственно стволовым клеткам. Таким образом, открытая структура хроматина плюрипотентных стволовых клеток может форми роваться как путем снижения общего уровня экс прессии H1, так и в результате посттрансляционных модификаций вариантов H1.0 и H1.2, приводящих к нарушению их связывания с ДНК и, как следствие, к образованию хроматина с более рыхлой струк турой. Биологическая роль наиболее известных в настоящее время модификаций H1 пока не ясна. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы опре делить индивидуальные и совокупные роли этих ПТМ. Эти знания помогут нам глубже понять моле кулярные процессы, лежащие в основе функциони рования хроматина плюрипотентных клеток.

×

Об авторах

Т. Ю. Старкова

Институт цитологии РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: t.starkova@incras.ru
Россия

Т. О. Артамонова

Санкт-Петербургский государственный политехнический университет имени Петра Великого

Email: t.starkova@incras.ru
Россия

В. В. Ермакова

Институт цитологии РАН

Email: t.starkova@incras.ru
Россия

Е. В. Чихиржина

Институт цитологии РАН

Email: t.starkova@incras.ru
Россия

М. А. Ходорковский

Санкт-Петербургский государственный политехнический университет имени Петра Великого

Email: t.starkova@incras.ru
Россия

А. Н. Томилин

Институт цитологии РАН; Санкт-Петербургский государственный университет

Email: a.tomilin@incras.ru
Россия

Список литературы

  1. White A.E., Hieb A.R., Luger K. // Sci. Rep. 2016, V.6, №19122, P.1-14
  2. Ausió J. // Bioessays. 2015, V.37, P.46-51
  3. Crane-Robinson C. // Biochim Biophys Acta. 2016, V.1859, №3, P.431-435
  4. Song F., Chen P., Sun D., Wang M., Dong L., Liang D., Xu R.M., Zhu P., Li G. // Science. 2014, V.344, №6182, P.376-380
  5. Zhou B.R., Jiang J., Feng H., Ghirlando R., Xiao T.S., Bai Y. // Mol Cell. 2015, V.59, №4, P.628-638
  6. Chikhirzhina E., Starkova T., Polyanichko A. The Role of Linker Histones in Chromatin Structural Organization. 1. H1 Family Histones. // Biophysics. 2018, V.53, №6, P.858-865
  7. Starkova T.Y., Polyanichko A.M., Artamonova T.O., Khodorkovskii M.A., Kostyleva E.I., Chikhirzhina E.V., Tomilin A.N. // Physical Biology. 2017, V.14, P.016005
  8. Kowalski A., Pałyga J. // Gel Electrophoresis - Principles and Basics. 2012, V.8, P.117-136
  9. Parseghian M.H., Newcomb R.L., Hamkalo B.A. // J Cell Biochem. 2001, V.83, P.643-659
  10. Happel N., Doenecke D. // Gene. 2009, V.431, P.1-12
  11. Izzo A., Kamieniarz K., Schneider R. // Biol Chem. 2008, V.389, P.333-343
  12. Fyodorov D.V., Zhou B.R., Skoultchi A.I., Bai Y. // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2018, V.19, P.192-206
  13. Millán-Arino L., Izquierdo-Bouldstridge A., Jordan A. // Biochim Biophys Acta. 2016, V.1859, P.510-519
  14. Khochbin S. // Gene. 2001, V.271, P.1-12
  15. Talasz H., Sapojnikova N., Helliger W., Lindner H., Puschendorf B. // J Biol Chem. 1998, V.273, P.32236-32243
  16. Ponte I., Vidal-Taboada J.M., Suau P. // Mol. Biol. Evol. 1998, V.15, P.702-708
  17. Th’ng J.P., Sung R., Ye M. // J Biol Chem. 2005, V.280, P.27809-17814
  18. Serrano L., Vazquez B.N., Tischfield J. // Experimental Biology and Medicine. 2013, V.238, P.259-270
  19. Meshorer E., Yellajoshula D., George E., Scambler P.J., Brown D.T., Misteli T. // Developmental Cell. 2006, V.10, №1, P.105-116
  20. Terme J.M., Sesé B., Millán-Ariño L., Mayor R., Izpisúa Belmonte J.C., Barrero M.J., Jordan A. // J Biol Chem. 2011, V.286, P.35347-35357
  21. Liskovykh M., Chuykin I., Ranjan A., Safina D., Popova E., Tolkunova E., Mosienko V., Minina J., Zhdanova N., Mullins J. // PLoS ONE. 2011, V.11, e27345
  22. Liskovykh M., Ponomartsev S., Popova E., Bader M., Kouprina N., Larionov V., Alenina N., Tomilin A. // Cell Cycle. 2015, V.4, №8, P.1268-1273
  23. Goldknopf I.L., Busch H. // Physiol Chem Phys. 1975, V.7, P.23-30
  24. Maresca T.J., Heald R. // Cell Cycle. 2006, V.5, P.589-591
  25. https://drive.google.com/open?id=15hmp5ku-JHzy3PXW8vAtHk13jYt97Fty
  26. Fan Y., Nikitina T., Zhao J., Fleury T.J., Bhattacharyya R., Bouhassira E.E., Stein A., Woodcock C.L., Skoultchi A.I. // Cell. 2005, V.123, №7, P.1199-1212
  27. Kamieniarz K., Izzo A., Dundr M., Tropberger P., Ozretic L., Kirfel J., Scheer E., Tropel P., Wisniewski J.R., Tora L., et. all. // Genes Dev. 2012, V.26, №8, P.797-802
  28. Dou Y., Gorovsky M.A. // Mol Cell. 2000, V.6, P.225-231
  29. Chadee D.N., Taylor W.R., Hurta R.A., Allis D., Wright J., Davie J. // J Biol Chem. 1995, V.270, P.20098-20105
  30. Sarg B., Helliger W., Talasz H., Forg B., Lindner H. // J Biol Chem. 2006, V.281, P.6573-6580
  31. Harshman S.W., Young N.L., Parthun M.R., Freitas M.A. // Nucl Acids Res. 2013, V.41, №21, P.9593-9609
  32. Liao R., Mizzen C.A. // Biochim Biophys Acta. 2016, V.1859, P.476-485
  33. Alexandrow M.G., Hamlin J.L. // JCB. 2005, V.168, P.875-886
  34. Strunnikov A.V., Hogan E., Koshland D. // Genes Dev. 1995, V.9, P.587-599
  35. Daujat S., Zeissler U., Waldmann T., Happel N., Schneider R. // J Biol Chem. 2005, V.280, P.38090-38095
  36. Lachner M., Jenuwein T. // Curr Opin Cell Biol. 2002, V.14, P.286-298
  37. Li Y., Danzer J.R., Alvarez P., Belmont A.S., Wallrath L.L. // Development. 2003, V.130, P.1817-1824
  38. Ayyanathan K., Lechner M.S., Bell P., Maul G.G., Schultz D.C., Yamada Y., Tanaka K., Torigoe K., Rauscher F.J. III. // Genes Dev. 2003, V.17, №15, P.1855-1869
  39. Rossetto D., Avvakumov N., Cote J. // Epigenetics. 2012, V.10, P.1098-1108
  40. Cheung P., Tanner K.G., Cheung W.L., Sassone-Corsi P., Denu J.M., Allis C.D. // Mol Cell. 2000, V.5, №6, P.905-915
  41. Chadee D.N., Hendzel M.J., Tylipski C.P., Allis C.D., Bazett-Jones D.P., Wright J.A., Davie J.R. // J Biol Chem. 1999, V.274, P.24914-24920
  42. Christophorou M.A., Castelo-Branco G., Halley-Stott R.P., Oliveira C.S., Loos R., Radzisheuskaya A., Mowen K.A., Bertone P., Silva J.C., Zernicka-Goetz M. // Nature 2014, V.507, №7490, P.104-108
  43. Wisniewski J.R., Zougman A., Krüger S., Mann M. // Mol Cell Proteomics. 2007, V.6, №1, P.72-87
  44. Shi Y., Lan F., Matson C., Mulligan P., Whetstine J.R., Cole P.A., Casero R.A., Shi Y. // Cell. 2004, V.119, P.941-953
  45. Kim G., Weiss S.J., Levine R.L. // Biochim Biophys Acta. 2014, V.1840, P.901-905
  46. Valley C.C., Cembran A., Perlmutter J.D., Lewis A.K., Labello N.P., Gao J., Sachs J.N. // J Biol Chem. 2012, V.287, №42, P.34979-34991
  47. Chao C.C., Ma Y.S., Stadtman E.R. // Proc Natl Acad Sci USA. 1997, V.94, P.2969-2974
  48. Lu X., Hansen J.C. // J Biol Chem. 2004, V.279, P.8701-8707
  49. Roque A., Ponte I., Suau P. // Chromosoma. 2016, V.1859, P.510-519
  50. Murphy K.J., Cutter A.R., Fang H. // NAR. 2017, V.45, P.9917-9930
  51. Stros M. // Biochim Biophys Acta. 2010, V.799, P.101-113

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Старкова Т.Ю., Артамонова Т.О., Ермакова В.В., Чихиржина Е.В., Ходорковский М.А., Томилин А.Н., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах