Аналоги малых ядрышковых C/D-бокс-РНК человека как регуляторы альтернативного сплайсинга пре-мРНК-мишени

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Малые ядрышковые РНК (мяоРНК) играют важную роль в биогенезе эукариотических рибосомных РНК (рРНК). C/D-бокс-мяоРНК направляют сайт-специфичное 2'-О-метилирование нуклеотидов рРНК и малых ядерных РНК (мяРНК). Некоторые природные C/D-бокс-РНК, а также их фрагменты участвуют в регуляции посттранскрипционной модификации и альтернативного сплайсинга пре-мРНК. В представленной работе сконструированы и синтезированы искусственные аналоги U24 C/D-бокс-мяоРНК, направленные на нуклеотиды 28S и 18S рРНК человека, пре-мРНК и зрелой мРНК белка теплового шока hsc70. Установлено, что в клетках линии MCF-7 человека, трансфицированных синтетическими аналогами C/D-бокс-РНК в комплексе с липофектамином, аналоги мяоРНК проникают внутрь клеток и накапливаются в цитоплазме и ядре. Трансфекция клеток человека синтетическими аналогами C/D-бокс-РНК, несущих область узнавания, комплементарную пре-мРНК белка hsc70, вызывает частичное нарушение сплайсинга мРНК-мишени. Трансфекция аналогами C/D-бокс-РНК, направленными на нуклеотиды 18S и 28S рРНК, ключевых для функционирования рибосом, приводит к снижению жизнеспособности клеток MCF-7.

Об авторах

Г. A. Степанов

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Россия

Д. В. Семенов

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Россия

E. В. Кулигина

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Россия

O. A. Коваль

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Россия

И. В. Рабинов

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Россия

Ю. Я. Кит

Институт биологии клетки НАН Украины

Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Украина

В. A Рихтер

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Email: stepanovga@niboch.nsc.ru
Россия

Список литературы

  1. Bachellerie J.P., Cavaille J., Huttenhofer A. // Biochimie. 2002. V. 84. P. 775-790.
  2. Cavaille J., Nicoloso M., Bachellerie J.P. // Nature. 1996. V. 383. P. 732-735.
  3. Liu B., Fournier M. // RNA. 2004. V. 10. P. 1130-1141.
  4. Liu B., Ni J., Fournier M. // Methods. 2001. V. 23. P. 276-286.
  5. Vitali P., Basyuk E., Le M.E., Bertrand E., Muscatelli F., Cavaille J., Huttenhofer A. // J. Cell. Biochem. 2005. V. 169. P. 745-753.
  6. Kishore S., Stamm S. // Science. 2006. V. 311. P. 230-232.
  7. Kiss-Laszlo Z., Henry Y., Bachellerie J.P., Caizergues-Ferrer M., Kiss T. // Cell. 1996. V. 85. P. 1077-1088.
  8. Maden B. // Methods. 2001. V. 25. P. 374-382.
  9. Qu L.H., Henry Y., Nicoloso M., Michot B., Azum M.C., Renalier M.H., Caizergues-Ferrer M., Bachellerie J.P. // Nucl. Acids Res. 1995. V. 23. P. 2669-2676.
  10. Rohde M., Daugaard M., Jensen M.H., Helin K., Nylandsted J., Jaattela M. // Genes Dev. 2005. V. 19. P. 570-582.
  11. Decatur W.A., Fournier M.J. // Trends Biochem. Sci. 2002. V. 27. P. 344-351.
  12. King T.H., Liu B., McCully R.R., Fournier M.J. // Mol. Cell. 2003. V. 11. P. 425-435.
  13. Baxter-Roshek J.L., Petrov A.N., Dinman J.D. // PLoS ONE. 2007. V. 2. e174.
  14. Graifer D.M., Karpova G.G., Knorre D.G. // Biochemistry. 2001. V. 66. P. 585-602.
  15. Kiss-Laszlo Z., Henry Y., Kiss T. // EMBO J. 1998. V. 17. P. 797-807.
  16. Moore M., Sharp P. // Science. 1992. V. 256. P. 992-997.
  17. Dominski Z., Kole R. // Mol. Cell. Biol. 1994. V. 14. P. 7445-7454.
  18. Sazani P., Kole R. // J. Clin. Invest. 2003. V. 112. P. 481-486.
  19. Zalachoras I., Evers M.M., van Roon-Mom W.M., Aartsma-Rus A.M., Meijer O.C. // Front. Mol. Neurosci. 2011. V. 4. P. 1-12.
  20. Semenov D.V., Stepanov G.A., Baryakin D.N., Koval O.A., Kuligina E.V., Richter V.A. // Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum / Ed. Gahan P.B. Springer Science+Business Media B.V. 2011. P. 233-237.
  21. Semenov D.V., Vratskih O.V., Kuligina E.V., Richter V.A. // Ann. N.Y. Acad. Sci. 2008. V. 1137. P. 119-124.
  22. Watkins N.J., Segault V., Charpentier B., Nottrott S., Fabrizio P., Bachi A., Wilm M., Rosbash M., Branlant C., Luhrmann R. // Cell. 2000. V. 27. V. 103. P. 457-466.
  23. Tollervey D., Lehtonen H., Jansen R., Kern H., Hurt E.C. // Cell. 1993. V. 72. P. 443-457.
  24. Newman D.R., Kuhn J.F., Shanab G.M., Maxwell E.S. // RNA. 2000. V. 6. P. 861-879.
  25. Liu B., Liang X.-H., Piekna-Przybylska D. // RNA Biol. 2008. V. 5. P. 249-254.
  26. Ganot P., Bortolin M.L., Kiss T. // Cell. 1997. V. 89. P. 799-809.
  27. Panse V.G., Johnson A.W. // Trends Biochem. Sci. 2010. V. 35. P. 260-266.
  28. Freed E., Bleichert F., Dutca L., Baserga S. // Mol. Biosyst. 2010. V. 6. P. 481-493.
  29. Vanacova S., Stefl R. // EMBO Rep. 2007. V. 8. P. 651-657.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Степанов Г.A., Семенов Д.В., Кулигина E.В., Коваль O.A., Рабинов И.В., Кит Ю.Я., Рихтер В.A., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах