N-Концевые партнеры для эффективной продукции рецепторов, сопряженных с G-белками, в бактериальных бесклеточных системах

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Семейство рецепторов, сопряженных с G-белками (GPCR), - одно из наиболее многочисленных семейств мембранных белков человека. Эти рецепторы, несмотря на их огромную важность для новых разработок в области фармакологии и медицины, остаются малоизученными. Основной фактор, сдерживающий структурно-функциональные исследования GPCR, - отсутствие высокоэффективных систем гетерологической продукции. Бесклеточные белоксинтезирующие системы, основанные на экстрактах из клеток Escherichia coli, в последнее время привлекают большое внимание в качестве эффективной альтернативы клеточным системам продукции рекомбинантных мембранных белков. Продукция GPCR в бактериальных бесклеточных системах затруднена из-за проблем, связанных с низкой эффективностью процесса инициации трансляции. Выход рецепторов может быть увеличен путем экспрессии слитых конструкций, содержащих дополнительные N-концевые аминокислотные последовательности-партнеры. В представленной работе для увеличения эффективности бесклеточного синтеза Р2-адренорецептора, мускаринового Ml холинорецептора и соматостатинового рецептора типа 5 человека предложены три новые N-концевые последовательности. Показано, что использование N-концевого фрагмента (6 а.о.) бактериородопсина грамположительной бактерии Exiguobacterium sibiricum (ESR-tag), N-концевого фрагмента (16 а.о.) рибону-клеазы А (S-tag) и белка Mistic из Bacillus subtilis позволяет увеличить выход GPCR в 5-38 раз и получить 0.6-S.8 мг целевого белка из 1 мл реакционной смеси, что достаточно для структурно-функциональных исследований.

Об авторах

E. Н. Люкманова

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

З. O. Шенкарев

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

Н. Ф. Хабибуллина

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

Д. С. Кульбацкий

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

M. A. Шулепко

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

Л. E. Петровская

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

A. С. Арсеньев

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

Д. A. Долгих

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

M. П. Кирпичников

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова

Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия

Список литературы

  1. Lundstrom K.H. Structural Genomics on Membrane Proteins. CRC Press, 2006.
  2. Wallin E., von Heijne G. // Protein Sci. 1998. V. 7. № 4. P. 1029-1038.
  3. Fredriksson R., Lagerström M.C., Lundin L.G., Schiöth H.B. // Mol. Pharmacol. 2003. V. 63. № 6. P. 1256-1272.
  4. Overington J.P., Al-Lazikani B., Hopkins A.L. // Nat. Rev. Drug. Discov. 2006. V. 5. № 12. P. 993-996.
  5. Rosenbaum D.M., Rasmussen S.G., Kobilka B.K. // Nature. 2009. V. 459. № 7245. P. 356-363.
  6. McCusker E.C., Bane S.E., O’Malley M.A., Robinson A.S. // Biotechnol. Prog. 2007. V. 23. № 3. 540-547.
  7. Cherezov V., Rosenbaum D.M., Hanson M.A., Rasmussen S.G., Thian F.S., Kobilka T.S., Choi H.J., Kuhn P., Weis W.I., Kobilka B.K., et al. // Science. 2007. V. 318. № 5854. P. 1258-1265.
  8. Haga K., Kruse A.C., Asada H., Yurugi-Kobayashi T., Shiroishi M., Zhang C., Weis W.I., Okada T., Kobilka B.K., Haga T., et al. // Nature. 2012. V. 482. № 7386. P. 547-551.
  9. Kruse A.C., Hu J., Pan A.C., Arlow D.H., Rosenbaum D.M., Rosemond E., Green H.F., Liu T., Chae P.S., Dror R.O., et al. // Nature. 2012. V. 482. № 7386. P. 552-556.
  10. Cavanagh, J., Fairbrother, W. J., Palmer, A.G., III, Skelton, N.J., and Rance, M. Protein NMR Spectroscopy Principles and Practice. 2nd ed. N.Y.: Academic Press.
  11. Kiefer H. // Biochim. Biophys. Acta. 2003. V. 1610. № 1. P. 57-62.
  12. Shirokov V.A., Kommer A., Kolb V.A., Spirin A.S. // Methods Mol. Biol. 2007. V. 375. P. 19-55.
  13. Schneider B., Junge F., Shirokov V.A., Durs,t F., Schwarz D., Dötsch V., Bernhard F. // Methods Mol. Biol. 2010. V. 601. P. 165-186.
  14. Klammt C., Schwarz D., Fendler K., Haase W., Dötsch V., Bernhard F. // FEBS J. 2005. V. 272. P. 6024-6038.
  15. Lyukmanova E.N., Shenkarev Z.O., Khabibullina N.F., Kopeina G.S., Shulepko M.A., Paramonov A.S., Mineev K.S., Tikhonov R.V., Shingarova L.N., Petrovskaya L.E., et al. // Biochim. Biophys. Acta. 2012. V. 1818. № 3. P. 349-358.
  16. Klammt C., Schwarz D., Eifler N., Engel A., Piehler J., Haase W., Hahn S., Dötsch V., Bernhard F. // J Struct. Biol. 2007. V. 158. № 3. P. 482-493.
  17. Ishihara G., Goto M., Saeki M., Ito K., Hori T., Kigawa T., Shirouzu M., Yokoyama S. // Protein Expr. Purif. 2005. V. 41. P. 27-37.
  18. Haberstock S., Roos C., Hoevels Y., Dötsch V., Schnapp G., Pautsch A., Bernhard F. // Protein Expr. Purif. 2012. V. 82. № 2. P. 308-316.
  19. Hall M.N., Gabay J., Debarbouille M., Schwartz M. // Nature. 1982. V. 295. P. 616-618.
  20. Kudla G., Murray A.W., Tollervey D., Plotkin J.B. // Science. 2009. V. 324. № 5924. P. 255-258.
  21. Khabibullina N.F., Lyukmanova E.N., Kopeina G.S., Shenkarev Z.O., Arseniev A.S., Dolgikh D.A., Kirpichnikov M.P. // Russian J. Bioorg. Chem. 2010. V.36. № 5. P. 603-609.
  22. Greenwood M.T., Hukovic N., Kumar U., Panetta R., Hjorth S.A., Srikant C.B., Patel Y.C. // Mol. Pharmacol. 1997. V. 52. № 5. P. 807-814.
  23. Hukovic N., Panetta R., Kumar U., Rocheville M., Patel Y.C. // J Biol Chem. 1998. V. 273. № 33. P. 21416-21422.
  24. Kaye R.G., Saldanha J.W., Lu Z.L., Hulme E.C. // Mol. Pharmacol. 2011. V. 79. № 4. P. 701-709.
  25. Shapiro R.A., Nathanson N.M. // Biochemistry. 1989. V. 28. № 22. P. 8946-8950.
  26. Gether U., Lin S., Ghanouni P., Ballesteros J.A., Weinstein H., Kobilka B.K. // EMBO J. 1997. V. 16. № 22. P. 6737-6747.
  27. Fraser C.M. // J Biol Chem. 1989. V. 264. № 16. P. 9266-9270.
  28. Savarese T.M., Wang C.D., Fraser C.M. // J Biol Chem. 1992. V. 267. № 16. P. 11439-11448.
  29. Roth C.B., Hanson M.A., Stevens R.C. // J Mol Biol. 2008. V. 376. № 5. P. 1305-1319.
  30. Petrovskaya L.E., Lukashev E.P., Chupin V.V., Sychev S.V., Lyukmanova E.N., Kryukova E.A., Ziganshin R.H., Khatypov R.A., Erokhina L.G., Spirina E.V., et al. // FEBS lett. 2010. V. 584. № 19. P. 4193-4196.
  31. Petrovskaya L.E., Shulga A.A., Bocharova O.V., Ermolyuk Y.S., Kryukova E.A., Chupin V.V., Blommers M.J., Arseniev A.S., Kirpichnikov M.P. // Biochemistry (Mosc.). 2010. V. 75. № 7. P. 881-891.
  32. Chowdhury A., Feng R., Tong Q., Zhang Y., Xie X.Q. //Protein Expr. Purif. 2012. V. 83. № 2. P. 128-134.
  33. Terpe K. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2003. V. 60. № 5. P. 523-533.
  34. Klammt C., Perrin M.H., Maslennikov I., Renault L., Krupa M., Kwiatkowski W., Stahlberg H., Vale W., Choe S. // Protein Sci. 2011. V. 20. P. 1030-1041.
  35. Zuker M. // Nucleic Acids Res. 2003. V. 31. № 13. P. 3406-3415.
  36. Kaiser L., Graveland-Bikker J., Steuerwald D., Vanberghem M., Herlihy K., Zhang S. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. № 41. P. 15726-15731.
  37. Michel E., Wüthrich K. // J. Biomol. NMR. 2012. V. 53. № 1. P. 43-51.
  38. Goerke A.R., Swartz J.R. // Biotechnol. Bioeng. 2008. V. 99. № 2. P. 351-367.
  39. Rath A., Glibowicka M., Nadeau V.G., Chen G., Deber C.M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. V. 106. № 6. P. 1760-1765.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Люкманова E.Н., Шенкарев З.O., Хабибуллина Н.Ф., Кульбацкий Д.С., Шулепко M.A., Петровская Л.E., Арсеньев A.С., Долгих Д.A., Кирпичников M.П., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах