N-Концевые партнеры для эффективной продукции рецепторов, сопряженных с G-белками, в бактериальных бесклеточных системах
- Авторы: Люкманова E.Н.1, Шенкарев З.O.1, Хабибуллина Н.Ф.1,2, Кульбацкий Д.С.1, Шулепко M.A.1,2, Петровская Л.E.1, Арсеньев A.С.1, Долгих Д.A.1,2, Кирпичников M.П.1,2
-
Учреждения:
- Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
- Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
- Выпуск: Том 4, № 4 (2012)
- Страницы: 58-64
- Раздел: Экспериментальные статьи
- Дата подачи: 17.01.2020
- Дата публикации: 15.12.2012
- URL: https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10615
- DOI: https://doi.org/10.32607/20758251-2012-4-4-58-64
- ID: 10615
Цитировать
Аннотация
Семейство рецепторов, сопряженных с G-белками (GPCR), - одно из наиболее многочисленных семейств мембранных белков человека. Эти рецепторы, несмотря на их огромную важность для новых разработок в области фармакологии и медицины, остаются малоизученными. Основной фактор, сдерживающий структурно-функциональные исследования GPCR, - отсутствие высокоэффективных систем гетерологической продукции. Бесклеточные белоксинтезирующие системы, основанные на экстрактах из клеток Escherichia coli, в последнее время привлекают большое внимание в качестве эффективной альтернативы клеточным системам продукции рекомбинантных мембранных белков. Продукция GPCR в бактериальных бесклеточных системах затруднена из-за проблем, связанных с низкой эффективностью процесса инициации трансляции. Выход рецепторов может быть увеличен путем экспрессии слитых конструкций, содержащих дополнительные N-концевые аминокислотные последовательности-партнеры. В представленной работе для увеличения эффективности бесклеточного синтеза Р2-адренорецептора, мускаринового Ml холинорецептора и соматостатинового рецептора типа 5 человека предложены три новые N-концевые последовательности. Показано, что использование N-концевого фрагмента (6 а.о.) бактериородопсина грамположительной бактерии Exiguobacterium sibiricum (ESR-tag), N-концевого фрагмента (16 а.о.) рибону-клеазы А (S-tag) и белка Mistic из Bacillus subtilis позволяет увеличить выход GPCR в 5-38 раз и получить 0.6-S.8 мг целевого белка из 1 мл реакционной смеси, что достаточно для структурно-функциональных исследований.
Ключевые слова
Об авторах
E. Н. Люкманова
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Автор, ответственный за переписку.
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
З. O. Шенкарев
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
Н. Ф. Хабибуллина
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
Д. С. Кульбацкий
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
M. A. Шулепко
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
Л. E. Петровская
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
A. С. Арсеньев
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
Д. A. Долгих
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
M. П. Кирпичников
Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН; Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
Email: ekaterina-lyukmanova@yandex.ru
Россия
Список литературы
- Lundstrom K.H. Structural Genomics on Membrane Proteins. CRC Press, 2006.
- Wallin E., von Heijne G. // Protein Sci. 1998. V. 7. № 4. P. 1029-1038.
- Fredriksson R., Lagerström M.C., Lundin L.G., Schiöth H.B. // Mol. Pharmacol. 2003. V. 63. № 6. P. 1256-1272.
- Overington J.P., Al-Lazikani B., Hopkins A.L. // Nat. Rev. Drug. Discov. 2006. V. 5. № 12. P. 993-996.
- Rosenbaum D.M., Rasmussen S.G., Kobilka B.K. // Nature. 2009. V. 459. № 7245. P. 356-363.
- McCusker E.C., Bane S.E., O’Malley M.A., Robinson A.S. // Biotechnol. Prog. 2007. V. 23. № 3. 540-547.
- Cherezov V., Rosenbaum D.M., Hanson M.A., Rasmussen S.G., Thian F.S., Kobilka T.S., Choi H.J., Kuhn P., Weis W.I., Kobilka B.K., et al. // Science. 2007. V. 318. № 5854. P. 1258-1265.
- Haga K., Kruse A.C., Asada H., Yurugi-Kobayashi T., Shiroishi M., Zhang C., Weis W.I., Okada T., Kobilka B.K., Haga T., et al. // Nature. 2012. V. 482. № 7386. P. 547-551.
- Kruse A.C., Hu J., Pan A.C., Arlow D.H., Rosenbaum D.M., Rosemond E., Green H.F., Liu T., Chae P.S., Dror R.O., et al. // Nature. 2012. V. 482. № 7386. P. 552-556.
- Cavanagh, J., Fairbrother, W. J., Palmer, A.G., III, Skelton, N.J., and Rance, M. Protein NMR Spectroscopy Principles and Practice. 2nd ed. N.Y.: Academic Press.
- Kiefer H. // Biochim. Biophys. Acta. 2003. V. 1610. № 1. P. 57-62.
- Shirokov V.A., Kommer A., Kolb V.A., Spirin A.S. // Methods Mol. Biol. 2007. V. 375. P. 19-55.
- Schneider B., Junge F., Shirokov V.A., Durs,t F., Schwarz D., Dötsch V., Bernhard F. // Methods Mol. Biol. 2010. V. 601. P. 165-186.
- Klammt C., Schwarz D., Fendler K., Haase W., Dötsch V., Bernhard F. // FEBS J. 2005. V. 272. P. 6024-6038.
- Lyukmanova E.N., Shenkarev Z.O., Khabibullina N.F., Kopeina G.S., Shulepko M.A., Paramonov A.S., Mineev K.S., Tikhonov R.V., Shingarova L.N., Petrovskaya L.E., et al. // Biochim. Biophys. Acta. 2012. V. 1818. № 3. P. 349-358.
- Klammt C., Schwarz D., Eifler N., Engel A., Piehler J., Haase W., Hahn S., Dötsch V., Bernhard F. // J Struct. Biol. 2007. V. 158. № 3. P. 482-493.
- Ishihara G., Goto M., Saeki M., Ito K., Hori T., Kigawa T., Shirouzu M., Yokoyama S. // Protein Expr. Purif. 2005. V. 41. P. 27-37.
- Haberstock S., Roos C., Hoevels Y., Dötsch V., Schnapp G., Pautsch A., Bernhard F. // Protein Expr. Purif. 2012. V. 82. № 2. P. 308-316.
- Hall M.N., Gabay J., Debarbouille M., Schwartz M. // Nature. 1982. V. 295. P. 616-618.
- Kudla G., Murray A.W., Tollervey D., Plotkin J.B. // Science. 2009. V. 324. № 5924. P. 255-258.
- Khabibullina N.F., Lyukmanova E.N., Kopeina G.S., Shenkarev Z.O., Arseniev A.S., Dolgikh D.A., Kirpichnikov M.P. // Russian J. Bioorg. Chem. 2010. V.36. № 5. P. 603-609.
- Greenwood M.T., Hukovic N., Kumar U., Panetta R., Hjorth S.A., Srikant C.B., Patel Y.C. // Mol. Pharmacol. 1997. V. 52. № 5. P. 807-814.
- Hukovic N., Panetta R., Kumar U., Rocheville M., Patel Y.C. // J Biol Chem. 1998. V. 273. № 33. P. 21416-21422.
- Kaye R.G., Saldanha J.W., Lu Z.L., Hulme E.C. // Mol. Pharmacol. 2011. V. 79. № 4. P. 701-709.
- Shapiro R.A., Nathanson N.M. // Biochemistry. 1989. V. 28. № 22. P. 8946-8950.
- Gether U., Lin S., Ghanouni P., Ballesteros J.A., Weinstein H., Kobilka B.K. // EMBO J. 1997. V. 16. № 22. P. 6737-6747.
- Fraser C.M. // J Biol Chem. 1989. V. 264. № 16. P. 9266-9270.
- Savarese T.M., Wang C.D., Fraser C.M. // J Biol Chem. 1992. V. 267. № 16. P. 11439-11448.
- Roth C.B., Hanson M.A., Stevens R.C. // J Mol Biol. 2008. V. 376. № 5. P. 1305-1319.
- Petrovskaya L.E., Lukashev E.P., Chupin V.V., Sychev S.V., Lyukmanova E.N., Kryukova E.A., Ziganshin R.H., Khatypov R.A., Erokhina L.G., Spirina E.V., et al. // FEBS lett. 2010. V. 584. № 19. P. 4193-4196.
- Petrovskaya L.E., Shulga A.A., Bocharova O.V., Ermolyuk Y.S., Kryukova E.A., Chupin V.V., Blommers M.J., Arseniev A.S., Kirpichnikov M.P. // Biochemistry (Mosc.). 2010. V. 75. № 7. P. 881-891.
- Chowdhury A., Feng R., Tong Q., Zhang Y., Xie X.Q. //Protein Expr. Purif. 2012. V. 83. № 2. P. 128-134.
- Terpe K. // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2003. V. 60. № 5. P. 523-533.
- Klammt C., Perrin M.H., Maslennikov I., Renault L., Krupa M., Kwiatkowski W., Stahlberg H., Vale W., Choe S. // Protein Sci. 2011. V. 20. P. 1030-1041.
- Zuker M. // Nucleic Acids Res. 2003. V. 31. № 13. P. 3406-3415.
- Kaiser L., Graveland-Bikker J., Steuerwald D., Vanberghem M., Herlihy K., Zhang S. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. № 41. P. 15726-15731.
- Michel E., Wüthrich K. // J. Biomol. NMR. 2012. V. 53. № 1. P. 43-51.
- Goerke A.R., Swartz J.R. // Biotechnol. Bioeng. 2008. V. 99. № 2. P. 351-367.
- Rath A., Glibowicka M., Nadeau V.G., Chen G., Deber C.M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. V. 106. № 6. P. 1760-1765.