Structural-Functional Analysis of 2,1,3-Benzoxadiazoles and Their N-oxides As HIV-1 Integrase Inhibitors

S. P. Korolev; Королев С. П.; O. V. Kondrashina; Кондрашина O. В.; D. S. Druzhilovsky; Дружиловский Д. С.; A. M. Starosotnikov; Старосотников A. M.; M. D. Dutov; Дутов M. Д.; M. A. Bastrakov; Бастраков M. A.; I. L. Dalinger; Далингер И. Л.; D. A. Filimonov; Филимонов Д. A.; S. A. Shevelev; Шевелев С. A.; V. V. Poroikov; Поройков В. В.; Y. Y. Agapkina; Агапкина Ю. Ю.; M. B. Gottikh; Готтих M. Б.

doi:10.32607/20758251-2013-5-1-63-72

Структурно-функциональный анализ 2,1,3-бензоксадиазолов и их N-оксидов в качестве ингибиторов интегразы ВИЧ-1

Авторы: Королев С.П.¹^,2, Кондрашина O.В.¹^,2, Дружиловский Д.С.³, Старосотников A.M.⁴, Дутов M.Д.⁴, Бастраков M.A.⁴, Далингер И.Л.⁴, Филимонов Д.A.³, Шевелев С.A.⁴, Поройков В.В.³, Агапкина Ю.Ю.¹^,2, Готтих M.Б.¹^,2
Учреждения:
1. Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
2. Научно-исследовательский институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского Московского государственного университете им. М.В. Ломоносова
3. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН
4. Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН
Выпуск: Том 5, № 1 (2013)
Страницы: 63-72
Раздел: Экспериментальные статьи
Дата подачи: 17.01.2020
Дата публикации: 15.03.2013
URL: https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10605
DOI: https://doi.org/10.32607/20758251-2013-5-1-63-72
ID: 10605

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Интеграза вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) считается одной из самых привлекательных мишеней для разработки ингибиторов этого вируса. В настоящей работе изучена способность ряда отобранных с использованием компьютерной программы PASS 2,1,3-бензоксадиазолов (бензофуразанов) и их N-оксидов (бензофуроксанов) подавлять каталитическую активность интегразы ВИЧ-1. Установлено, что ингибирующая способность этих соединений сильно зависит от наличия нитрогруппы. Показано, что нитробензофуразаны и нитробензофуроксаны препятствуют связыванию ДНК-субстрата в активном центре фермента. Эти ингибиторы оказались активными и в отношении мутантов интегразы, устойчивых к действию ралтегравира – единственного разрешенного к клиническому применению ингибитора интегразы. Сравнение полученных с использованием компьютерных программ фармакодинамических и фармако кинетических характеристик исследованных в данной работе соединений и ралтегравира свидетельствует о перспективности дальнейшего их изучения в качестве ингибиторов интегразы ВИЧ-1.

Ключевые слова

интеграза ВИЧ-1, ингибирование, нитробензофуроксан, нитробензофуразан, PASS, Qik-Prop

Список литературы

Cara A., Guarnaccia F., Reitz M.S. Jr., Gallo R.C., Lori F. // Virology. 1995. V. 208. P. 242-248.
Marcelin A.G., Ceccherini-Silberstein F., Perno C.F., Calvez V. // Curr. Opin. HIV AIDS. 2009. V. 4. P. 531-537.
FDA approves raltegravir tablets. // AIDS Patient Care STDS. 2007. V. 21. № 11. P. 889.
Cooper D.A., Steigbigel R.T., Gatell J.M., Rockstroh J.K., Katlama C., Yeni P., Lazzarin A., Clotet B., Kumar P.N., Eron J.E., et al. // N. Engl. J. Med. 2008. V. 359. № 4. P. 355-365.
Korolev S.P., Agapkina Y.Y., Gottikh M.B. // Acta Naturae. 2011. V. 3. № 3. P. 12-28.
Kobayashi M., Nakahara K., Seki T., Miki S., Kawauchi S., Suyama A., Wakasa-Morimoto C., Kodama M., Endoh T., Oosugi E., et al. // Antiviral Res. 2008. V. 80. № 2. P. 213-222.
Keseru G.M., Makara G.M. // Nature Reviews Drug Discovery. 2009. V. 8. P. 203-212.
Johnson B.C., Metifiot M., Pommier Y., Highes S.H. Antimicrob. Agents Chemother. 2012. V. 56. P. 411-419.
Ma K., Wang P., Fu W., Wan X., Zhou L., Chu Y., Ye D. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011. V. 21. № 22. P. 6724-6727.
Ko G.M., Reddy A.S., Garg R., Kumar S., Hadaegh A.R. // Curr. Comput. Aided Drug Des. 2012. V. 8. № 4. P. 255-270.
Filimonov D.A., Poroikov V.V. Probabilistic approach in activity prediction. In: Chemoinformatics Approaches to Virtual Screening. Eds. Alexandre Varnek and Alexander Tropsha. Cambridge (UK): RSC Publishing. 2008. P. 182-216.
Filimonov D.A., Poroikov V.V. // Rus. Khim. Zhurn. 2006. V. 50. № 2. P. 66-75.
Akimov D.V., Filimonov D.A., Prikazchikova T.A., Gottikh M.B., Poroikov V.V. // Biomed. Khim. 2005. V. 51. № 3. P. 335-340.
Druzhilovsky D.S., Filimonov D.A., Liao C., Peach M., Nicklaus M., Poroikov V.V. Biochemistry (Moscow) Supplemental Series B. Biomedical Chemistry. 2010. V. 4. №1. P. 59-67.
Summa V., Petrocchi A., Bonelli F., Crescenzi B., Donghi M., Ferrara M., Fiore F., Gardelli C., Gonzalez Paz O., Hazuda D.J., et al. // J. Med. Chem. 2008. V. 51. № 18. P. 5843-5855.
http://www.schrodinger.com/products/14/17/
Handzlik J., Bajda M., Zygmunt M., Maciąg D., Dybała M., Bednarski M., Filipek B., Malawska B., Kieć-Kononowicz K. // Bioorg. Med. Chem. 2012. V. 20. № 7. P. 2290-2303.
Shukla S., Kumar P., Das N., Moorthy N.S., Shrivastava S.K., Trivedi P., Srivastava R.S. // Med Chem. 2012. V. 8. № 5. 834-845.
Ghose A.K., Herbertz T., Hudkins R.L., Dorsey B.D., Mallamo J.P. // ACS Chem. Neurosci. 2012. V. 3. № 1. 50-68.
Ghosh P.B., Whitehouse M.W. // J. Med. Chem. 1968. V. 11. P. 305-311.
Ghosh P.B. // J. Chem. Soc. B. 1968. P. 334-338.
Terrier F., Croisat D., Chatrousse A.-P., Pouet M.-J., Halle J.-C., Jacob G. // J. Org. Chem. 1992. V. 57. P. 3684-3689.
Zatsepin T.S., Kachlova A.V., Romanova E.A., Stetsenko D.A., Gait M.J., Oretskaya T.S. Russian J. Bioorg. Chem. 2001. V. 27. №1. P. 39-44.
Leh H., Brodin P., Bischerour J., Deprez E., Tauc P., Brochon J.-C., LeCam E., Coulaud D., Auclair C., Mouscadet J.-F. // Biochemistry. 2000. V. 39. P. 9285-9294.
Malet I., Delelis O., Valantin M.A., Montes B., Soulie C., Wirden M., Tchertanov L., Peytavin G., Reynes J., Mouscadet J-F., et al. // Antimicrob. Agents. Chemother. 2008. V. 52. № 4. P. 1351-1358.
FDA approves new 4-drug once-a-day HIV treatment // AIDS Policy Law. 2012. V. 27. № 11: 1.
Delelis, O., Malet, I., Na, L., Tchertanov, L., Calvez, V., Marcelin, A.G., Subra, F., Deprez, E., Mouscadet, J.-F. // Nucleic Acids Res. 2009. V. 37. P. 1193-1201.
Hare S., Vos A.M., Clayton R.F., Thuring J.W., Cummings M.D., Cherepanov P. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. P. 20057-20062.
Quashie P.K., Sloan R.D., Wainberg M.A. // BMC Med. 2012. V. 10:34
Puras Lutzke R.A., Vink C., Plasterk R.H. // Nucleic Acids Res. 1994. V. 22. № 20. P. 4125-4131.
Smolov M., Gottikh M., Tashlitskii V., Korolev S., Demidyuk I., Brochon J-C., Mouscadet J.-F., Deprez E. // FEBS J. 2006. V. 273. P. 1137-1151.
Michel F., Crucifix C., Granger F., Eiler S., Mouscadet J.-F., Korolev S., Agapkina J., Ziganshin R., Gottikh M., Nazabal A., et al. // EMBO J. 2009. V. 28. P. 980-991.
Krishnan L., Li X., Naraharisetty H.L., Hare S., Cherepanov P., Engelman A. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2010. V. 107. № 36. P. 15910-15915.
Johnson A.A., Marchand C., Patil S.S., Costi R., Di Santo R., Burke T.R.-Jr., Pommier Y. // Mol. Pharmacol. 2007. V. 71. № 3. P. 893-901.
Korolev S.P., Tashlitskii V.N., Smolov M.A., Gromyko A.V., Zhuze A.L., Agapkina Yu.Yu., Gottikh M.B. HIV-1 integrase inhibition by dimeric bisbenzimidazoles with different spacers. // Russian J. Mol. Biol. 2010. V. 44. №4. P. 718-727.
Neamati N., Lin Z., Karki R.G., Orr A., Cowansage K., Strumberg D., Pais G.C., Voigt J.H., Nicklaus M.C., Winslow H.E., et al. // J. Med. Chem. 2002. V. 45. №. 26. P. 5661-5670.
http://www.merck.com/product/usa/pi_circulars/i/isentress/isentress_pi.pdf
http://www.ema.europa.eu/docs/en_GB/document_library/EPAR_-_Scientific_Discussion/human/000860/WC500037408.pdf

Дополнительные файлы

Доп. файлы

Действие

1. JATS XML

Скачать

Имя пользователя
Пароль
Запомнить меня

Забыли пароль?	Регистрация

Имя пользователя
Пароль
Запомнить меня

Забыли пароль?	Регистрация

Структурно-функциональный анализ 2,1,3-бензоксадиазолов и их N-оксидов в качестве ингибиторов интегразы ВИЧ-1

Полный текст

Аннотация

Ключевые слова

Об авторах

С. П. Королев

O. В. Кондрашина

Д. С. Дружиловский

A. M. Старосотников

M. Д. Дутов

M. A. Бастраков

И. Л. Далингер

Д. A. Филимонов

С. A. Шевелев

В. В. Поройков

Ю. Ю. Агапкина

M. Б. Готтих

Список литературы

Дополнительные файлы

Данный сайт использует cookie-файлы