Возможная функция гена ribT Bacillus subtilis: теоретическое предсказание, клонирование и экспрессия
- Авторы: Якимов А.П.1,2, Серегина Т.А.3, Холодняк А.А.3, Кренева Р.А.1, Миронов А.С.3, Перумов Д.А.1, Тимковский А.Л.1,2
-
Учреждения:
- Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт
- Санкт-Петербургский государственный политехнический университет
- Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов
- Выпуск: Том 6, № 3 (2014)
- Страницы: 106-109
- Раздел: Краткие сообщения
- Дата подачи: 17.01.2020
- Дата публикации: 15.09.2014
- URL: https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10547
- DOI: https://doi.org/10.32607/20758251-2014-6-3-106-109
- ID: 10547
Цитировать
Аннотация
Полная расшифровка функций и взаимодействия элементов оперона биосинтеза рибофлавина (rib-оперон) у Bacillus subtilis необходима для создания сверхпродуцентов этого важнейшего витамина. Функция гена ribT, замыкающего оперон, до сих пор не определена. В представленной работе проведен поиск гомологов гипотетической аминокислотной последовательности продукта этого гена в базах данных, а также анализ гомологий, теоретически предсказано распределение элементов вторичной структуры, предложена третичная структура белка RibT. Нуклеотидная последовательность гена ribT была амплифицирована и клонирована в стандартный мультикопийный экспрессионный вектор pET15b, а затем экспрессирована после индукции ИПТГ в клетках Escherichia coli BL21(DE3), содержавших индуцибельный ген РНК-полимеразы фага Т7. Экспрессия гена ribT подтверждена электрофорезом в полиакриламидном геле в денатурирующих условиях (SDS-PAGE). Белковый продукт экспрессии очищен с помощью аффинной хроматографии. Таким образом, показана принципиальная возможность получения белка RibT в количествах, достаточных для дальнейшего изучения его структуры и функциональной активности.
Об авторах
А. П. Якимов
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт; Санкт-Петербургский государственный политехнический университет
Автор, ответственный за переписку.
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
Т. А. Серегина
Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
А. А. Холодняк
Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
Р. А. Кренева
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
А. С. Миронов
Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
Д. А. Перумов
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
А. Л. Тимковский
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт; Санкт-Петербургский государственный политехнический университет
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия
Список литературы
- Chikindas M.L., Mironov V.N., Lukyanov E.V., Boretsky Yu.R., Arutyunova L.S., Rabinovich P.M., Stepanov A.I. // Mol. Gen. Mikrobiol. Virusol. (Russian). 1987, V.4, №1, P.22-26
- Mironov V.N., Perumov D.A., Kraev A.S., Stepanov A.I., Skryabin K.G. // Mol. Biol. (Russian). 1990, V.24, №3, P.256-261
- Sklyarova S.A., Kreneva R.A., Perumov D.A., Mironov A.S. // Genetika (Russian). 2012, V.48, №10, P.1-9
- Mironov V.N., Kraev A.S., Chikindas M.L., Chernov B.K., Stepanov A.L., Skryabin K.G. // Mol. Gen. Genet. 1994, V.242, №2, P.201-208
- Perkins J.B., Sloma A., Hermann // J. Ind. Microbiol. Biotechnol.. 1999, V.22, P.8-18
- Jones D.T. // J. Mol. Biol. 1999, V.292, P.195-202
- Bernstein F.C., Koetzle T.F., Williams G.J., Meyer Jr. E.E., Brice M.D., Rodgers J.R., Kennard O., Shimanouchi T., Tasumi M. // J. Mol. Biol. 1977, V.112, №3, P.535-542
- Abagyan R.A., Totrov M.M., Kuznetsov D.N. // J. Comp. Chem. 1994, V.15, P.488-506
- Mironov A.S., Gusarov I., Rafikov R., Errais Lopez L., Shatalin K., Kreneva R.A., Perumov D.A., Nudler E. // Cell. 2002, V.111, №4, P.747-756
- Serganov A., Huang L., Patel D.J. // Nature 2009, V.458, P.233-237