Возможная функция гена ribT Bacillus subtilis: теоретическое предсказание, клонирование и экспрессия

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Полная расшифровка функций и взаимодействия элементов оперона биосинтеза рибофлавина (rib-оперон) у Bacillus subtilis необходима для создания сверхпродуцентов этого важнейшего витамина. Функция гена ribT, замыкающего оперон, до сих пор не определена. В представленной работе проведен поиск гомологов гипотетической аминокислотной последовательности продукта этого гена в базах данных, а также анализ гомологий, теоретически предсказано распределение элементов вторичной структуры, предложена третичная структура белка RibT. Нуклеотидная последовательность гена ribT была амплифицирована и клонирована в стандартный мультикопийный экспрессионный вектор pET15b, а затем экспрессирована после индукции ИПТГ в клетках Escherichia coli BL21(DE3), содержавших индуцибельный ген РНК-полимеразы фага Т7. Экспрессия гена ribT подтверждена электрофорезом в полиакриламидном геле в денатурирующих условиях (SDS-PAGE). Белковый продукт экспрессии очищен с помощью аффинной хроматографии. Таким образом, показана принципиальная возможность получения белка RibT в количествах, достаточных для дальнейшего изучения его структуры и функциональной активности.

Об авторах

А. П. Якимов

Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт; Санкт-Петербургский государственный политехнический университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

Т. А. Серегина

Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов

Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

А. А. Холодняк

Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов

Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

Р. А. Кренева

Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт

Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

А. С. Миронов

Государственный институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов

Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

Д. А. Перумов

Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт

Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

А. Л. Тимковский

Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова НИЦ Курчатовский институт; Санкт-Петербургский государственный политехнический университет

Email: alt@AT1660.spb.edu
Россия

Список литературы

  1. Chikindas M.L., Mironov V.N., Lukyanov E.V., Boretsky Yu.R., Arutyunova L.S., Rabinovich P.M., Stepanov A.I. // Mol. Gen. Mikrobiol. Virusol. (Russian). 1987, V.4, №1, P.22-26
  2. Mironov V.N., Perumov D.A., Kraev A.S., Stepanov A.I., Skryabin K.G. // Mol. Biol. (Russian). 1990, V.24, №3, P.256-261
  3. Sklyarova S.A., Kreneva R.A., Perumov D.A., Mironov A.S. // Genetika (Russian). 2012, V.48, №10, P.1-9
  4. Mironov V.N., Kraev A.S., Chikindas M.L., Chernov B.K., Stepanov A.L., Skryabin K.G. // Mol. Gen. Genet. 1994, V.242, №2, P.201-208
  5. Perkins J.B., Sloma A., Hermann // J. Ind. Microbiol. Biotechnol.. 1999, V.22, P.8-18
  6. Jones D.T. // J. Mol. Biol. 1999, V.292, P.195-202
  7. Bernstein F.C., Koetzle T.F., Williams G.J., Meyer Jr. E.E., Brice M.D., Rodgers J.R., Kennard O., Shimanouchi T., Tasumi M. // J. Mol. Biol. 1977, V.112, №3, P.535-542
  8. Abagyan R.A., Totrov M.M., Kuznetsov D.N. // J. Comp. Chem. 1994, V.15, P.488-506
  9. Mironov A.S., Gusarov I., Rafikov R., Errais Lopez L., Shatalin K., Kreneva R.A., Perumov D.A., Nudler E. // Cell. 2002, V.111, №4, P.747-756
  10. Serganov A., Huang L., Patel D.J. // Nature 2009, V.458, P.233-237

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Якимов А.П., Серегина Т.А., Холодняк А.А., Кренева Р.А., Миронов А.С., Перумов Д.А., Тимковский А.Л., 2014

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах