Acta NaturaeActa NaturaeActa Naturae2075-8251Acta Naturae Ltd2037710.32607/actanaturae.20377Research ArticlesЭкспериментальные статьиResearch ArticleCNA Landscape of HER2-Negative Breast Cancer in Anthracycline-Based Neoadjuvant Chemotherapy RegimensCNA-ландшафт HER2-негативного рака молочной железы при использовании антрациклинсодержащих схем неоадъювантной химиотерапииIbragimovaMarina K.ИбрагимоваМарина Константиновна
Russian Federation
imk1805@yandex.ruKravtsovaEkaterina A.КравцоваЕкатерина Андреевна
Russian Federation
zdereva.e@gmail.comTsyganovMatvey M.ЦыгановМатвей Михайлович
Russian Federation
tsyganovmm@yandex.ruLitviakovNikolay V.ЛитвяковНиколай Васильевич
Russian Federation
nvlitv72@yandex.ruCancer Research Institute, Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of SciencesНаучно-исследовательский институт онкологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наукNational Research Tomsk State UniversityНациональный исследовательский Томский государственный университетSiberian State Medical UniversityСибирский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения Российской Федерации3010202315366741205202328072023Copyright ©; 2023, Ibragimova M.K., Kravtsova E.A., Tsyganov M.M., Litviakov N.V.Copyright ©; 2023, Ибрагимова М.К., Кравцова Е.А., Цыганов М.М., Литвяков Н.В.2023Ibragimova M.K., Kravtsova E.A., Tsyganov M.M., Litviakov N.V.Ибрагимова М.К., Кравцова Е.А., Цыганов М.М., Литвяков Н.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/20377

Critical evaluation of how and when to include anthracyclines in preoperative chemotherapy is becoming more relevant in an era when the molecular genetic approach not only allows for the development of biologically targeted therapeutics, but also implies the ability to select the patients likely to benefit from certain cytotoxic agents. Changes in the copy number aberration (CNA) landscape of luminal B HER2-negative (HER2−) breast cancer (BC) during anthracycline-based neoadjuvant chemotherapy (NAC) regimens were studied in order to identify groups of potential CNA markers of objective response and CNA markers for predicting the development of hematogenous metastasis. Comparison of CNA frequencies depending on the response to NAC showed that objective response was observed in a larger number of deletions in the 11q22.3 and 11q23.1 loci (p = 0.004). Comparison of CNA frequencies in groups of patients after treatment showed that hematogenous metastasis was observed with a greater number of amplifications in the 9p22.2 locus (p = 0.003) and with a greater number of deletions in the 9p21.3 locus (p = 0.03). Potential predictive CNA markers of objective response and prognostic CNA markers of hematogenous metastasis in anthracycline-based NAC regimens have been identified.

Критическая оценка дозировки, сроков и способов включения антрациклинов в предоперационную химиотерапию становится более актуальной в эпоху, когда молекулярно-генетический подход позволяет не только разрабатывать биологически направленные терапевтические средства, но и выбирать пациентов, применение определенных цитотоксических агентов у которых приведет к желаемым эффектам. С целью выявления потенциальных CNA-маркеров объективного ответа и прогностических CNA-маркеров гематогенного метастазирования изучены изменения CNA-генетического ландшафта опухоли молочной железы люминального В HER2-негативного подтипа, вызванные применением антрациклинсодержащих схем неоадъювантной химиотерапии. Cравнение частот CNA в зависимости от ответа на неоадъювантную химиотерапию показало наличие объективного ответа при большем количестве делеций в локусах 11q22.3 и 11q23.1 (р = 0.004). Сравнение частот CNA в группах пациенток после лечения показало, что возникновение гематогенного метастазирования наблюдалось при большем количестве амплификаций в локусе 9p22.2 (р = 0.003) и большем количестве делеций в локусе 9p21.3 (р = 0.03). Выявлены потенциальные предиктивные CNA-маркеры объективного ответа и прогностические CNA-маркеры гематогенного метастазирования при применении антрациклинсодержащих схем неоадъювантной химиотерапии.

breast cancerCNA landscapeanthracycline-based regimensneoadjuvant chemotherapyprognosisрак молочной железыCNA-генетический ландшафт опухолиантрациклинсодержащие схемынеоадъювантная химиотерапияРоссийский научный фондRussian Science Foundationгрант № 22-25-00499Spring L.M., Bar Y., Isakoff S.J. // J. Natl. Compr. Canc. Netw. 2022. V. 20. № 6. P. 723–734.Spring L.M., Fell G., Arfe A., Sharma C., Greenup R., Reynolds K.L., Smith B.L., Alexander B., Moy B., Isakoff S.J., et al. // Clin. Cancer Res. 2020. V. 26. P. 2838–2848.LeVasseur N., Sun J., Gondara L., Diocee R., Speers C., Lohrisch C., Chia S. // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2020. V. 146. P. 529–536.Yee D., De Michele A.M., Yau C., Symmans W.F., Albain K.S., Yi Chen Y., Krings G., Wei S., Harada S., et al. // JAMA Oncol. 2020. V. 6. № 9. P. 1355–1362.Cardoso F., Senkus E., Costa A., Papadopoulos E., Aapro M., André F., Harbeck N., Aguilar Lopez B., Barrios C.H., Bergh J., et al. // Ann. Oncol. 2018. V. 29. P. 1634–1657.Cardoso F., Senkus E., Costa A., Papadopoulos E., Aapro M., André F., Harbeck N., Aguilar Lopez B., Barrios C.H., Bergh J., et al. // Ann. Oncol. 2018. V. 29. Р. 1634–1657.Melendez G.C., Hundley W.G. // Circ. Cardiovasc. Imaging. 2016. V. 9. №12. e005797Melendez G.C., Hundley W.G. // Circ. Cardiovasc. Imaging. 2016. V. 9. № 12. e005797Armenian S.H., Lacchetti C., Barac A. // J. Clin. Oncol.: Off. J. Am. Soc. Clin. Oncol. 2017. V. 35. № 8. P. 893–911.Armenian S.H., Lacchetti C., Barac A. // J. Clin. Oncol.: Off. J. Am. Soc. Clin. Oncol. 2017. V. 35. № 8. Р. 893–911.Wolff A.C., Blackford A.L., Visvanathan K., Rugo H.S., Moy B., Goldstein L.J., Stockerl-Goldstein K., Neumayer L., Langbaum T.S., et al. // J. Clin. Oncol.: Off. J. Am. Soc. Clin. Oncol. 2015. V. 33. № 4. P. 340–348.Wolff A.C., Blackford A.L., Visvanathan K., Rugo H.S., Moy B., Goldstein L.J., Stockerl-Goldstein K., Neumayer L., Langbaum T.S., et al. // J. Clin. Oncol.: Off. J. Am. Soc. Clin. Oncol. 2015. V. 33. № 4. Р. 340–348.National Comprehensive Cancer Network Clinical Practice Guidelines in Oncology: Breast Cancer. v3.2021.https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/breast.pdf.National Comprehensive Cancer Network Clinical Practice Guidelines in Oncology: Breast Cancer. v3.2021. https://www.nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/breast.pdf.Vuger A.T., Tiscoski K., Apolinario T., Cardoso F. // The Breast. 2022. V. 65. P. 67–76.Vuger A.T., Tiscoski K., Apolinario T., Cardoso F. // The Breast. 2022. V. 65. Р. 67–76.Rakha E.A., Miligy I.M., Quinn C.M., Provenzano E., Shaaban A.M., Marchiò C., Toss M.S., Gallagy G., Murray C., Walshe J., et al. // Br. J. Cancer. 2021. V. 124. P. 1836–1842.Rakha E.A., Miligy I.M., Quinn C.M., Provenzano E., Shaaban A.M., Marchiò C., Toss M.S., Gallagy G., Murray C., Walshe J., et al. // Br. J. Cancer. 2021. V. 124. Р. 1836–1842.Hoda R.S., Brogi E., Xu J., Ventura K., Ross D.S., Dang MC., Robson M., Norton L., Morrow M., Wen H.Y. // Arch. Pathol. Lab. Med. 2020. V. 144. № 5. P. 597–601.Hoda R.S., Brogi E., Xu J., Ventura K., Ross D.S., Dang MC., Robson M., Norton L., Morrow M., Wen H.Y. // Arch. Pathol. Lab. Med. 2020. V. 144. № 5. Р. 597–601.Bartlett J.M., McConkey C.C., Munro A.F., Desmedt C., Dunn J.A., Larsimont D.P., O’Malley F.P., Cameron D.A., Earl H.M., Poole C.J., et al. // J. Clin. Oncol. 2015. V. 33. P. 1680–1687.Bartlett J.M., McConkey C.C., Munro A.F., Desmedt C., Dunn J.A., Larsimont D.P., O’Malley F.P., Cameron D.A., Earl H.M., Poole C.J., et al. // J. Clin. Oncol. 2015. V. 33. Р. 1680–1687.Greenwell K., Hussain L., Lee D. Bramlage M., Bills G., Mehta A., Jackson A., Wexelman B. // Breast Cancer Res. Treat. 2020. V. 181. P. 249–254.Greenwell K., Hussain L., Lee D., Bramlage M., Bills G., Mehta A., Jackson A., Wexelman B. // Breast Cancer Res. Treat. 2020. V. 181. Р. 249–254.Choo J.R.E., Jan YH., Ow S.G.W., Wong A., Lee M.X., Ngoi N., Yadav K., Lim J.S.J., Lim S.E., Chan C.W., et al. // Targ. Oncol. 2022. V. 17. P. 355–368.Choo J.R.E., Jan YH., Ow S.G.W., Wong A., Lee M.X., Ngoi N., Yadav K., Lim J.S.J., Lim S.E., Chan C.W., et al. // Targ. Oncol. 2022. V. 17. Р. 355–368.Wang K., Li L., Franch-Expósito S., Le X., Tang J., Li Q., Wu Q., Bassaganyas L., Camps J., Zhang X., et al. // Mol. Oncol. 2022. V. 16. № 12. P. 2413–2431.Barnekow E., Hasslow J., Liu W., Bryant P., Thutkawkorapin J., Wendt C., Czene K., Hall P., Margolin S., Lindblom A. // Internat. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. № 5. P. 44–68.Barnekow E., Hasslow J., Liu W., Bryant P., Thutkawkorapin J., Wendt C., Czene K., Hall P., Margolin S., Lindblom A. // Internat. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. № 5. Р. 44–68.Hamdi Y., Soucy P., Kuchenbaeker K.B., Pastinen T., Droit A., Lemaçon A., Adlard J., Aittomäki K., Andrulis I.L., Arason A., et al. // Breast Cancer Res. Treat. 2017. V. 161. P. 117–134.Hamdi Y., Soucy P., Kuchenbaeker K.B., Pastinen T., Droit A., Lemaçon A., Adlard J., Aittomäki K., Andrulis I.L., Arason A., et al. // Breast Cancer Res. Treat. 2017. V. 161. Р. 117–134.Goudarzi A. // Life Sci. 2019. V. 232. P. 116592.Zhang G., Huang R., Zhao H., Xia Y., Huang H., Qian M., Fu Y., Cui Y. // Genes Immunity. 2023. V. 24. P. 99–107.Zhang G., Huang R., Zhao H., Xia Y., Huang H., Qian M., Fu Y., Cui Y. // Genes Immunity. 2023. V. 24. Р. 99–107.Ismail A., El-Mahdy H.A., Abulsoud A.I., Sallam A.-A.M., Gomaa Eldeib M., Elsakka E.G.E., Bakr Zaki M., Doghish A.S. // Internat. J. Biol. Macromolecules. 2023. V. 224. P. 1541–1565.Hall M.J., Bernhisel R., Hughes E., Larson K., Rosenthal E.T., Singh N.A., Lancaster J.M., Kurian A.W. // Cancer Prev. Res. 2021. V. 14. P. 433–440.Stucci L.S., Internò V., Tucci M., Perrone M., Mannavola F., Palmirotta R., Porta C. // Genes. 2021. V. 12. P. 727.Jong Y.J., Li L.H., Tsou M.H., Chen Y.J., Cheng S.H., Wang-Wuu S., Tsai S.F., Chen C.M., Huang A.T., Hsu M.T., et al. // Cancer Genet. Cytogenet. 2004. V. 148. P. 55–65.Lebok P., Roming M., Kluth M., Koop C., Özden C., Taskin B., Hussein K., Lebeau A., Witzel I., Wölber L., et al. // Oncotarget. 2016. V. 7. P. 81322–81331.R. Beroukhim, Mermel C.H., Porter D., Wei G., Raychaudhuri S., Donovan J., Barretina J., Boehm J.S., Dobson J., Urashima M., et al. // Nature. 2010. V. 463. P. 899–905.Beroukhim R., Mermel C.H., Porter D., Wei G., Raychaudhuri S., Donovan J., Barretina J., Boehm J.S., Dobson J., Urashima M., et al. // Nature. 2010. V. 463. P. 899–905.Han G., Yang G., Hao D., Lu Y., Thein K., Simpson B.S., Chen J., Sun R., Alhalabi O., Wang R., et al. // Nat. Commun. 2021. V. 12. P. 5606.