Acta NaturaeActa NaturaeActa Naturae2075-8251Acta Naturae Ltd1110110.32607/actanaturae.11101ReviewsОбзорыReview ArticleChromatin Modifiers in Transcriptional Regulation: New Findings and ProspectsМодификаторы хроматина в регуляции транскрипции: свежие находки и перспективыMazinaMarina Yu.МазинаМарина Юсуповна
Russian Federation
magadovam@yandex.ruVorobyevaNadezhda E.ВоробьеваНадежда Евгеньевна
Russian Federation
vorobyeva@genebiology.ruhttp://www.genebiology.ru/laboratorii/vorobyeva-lab/Institute of Gene Biology, Russian Academy of SciencesИнститут биологии гена РАН1503202113116302807202001122020Copyright ©; 2021, Mazina M.Y., Vorobyeva N.E.Copyright ©; 2021, Мазина М.Ю., Воробьева Н.Е.2021Mazina M.Y., Vorobyeva N.E.Мазина М.Ю., Воробьева Н.Е.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/11101

Histone-modifying and remodeling complexes are considered the main coregulators that affect transcription by changing the chromatin structure. Coordinated action by these complexes is essential for the transcriptional activation of any eukaryotic gene. In this review, we discuss current trends in the study of histone modifiers and chromatin remodelers, including the functional impact of transcriptional proteins/complexes i.e., “pioneers”; remodeling and modification of non-histone proteins by transcriptional complexes; the supplementary functions of the non-catalytic subunits of remodelers, and the participation of histone modifiers in the “pause” of RNA polymerase II. The review also includes a scheme illustrating the mechanisms of recruitment of the main classes of remodelers and chromatin modifiers to various sites in the genome and their functional activities.

Комплексы, модифицирующие и ремоделирующие гистоны, считаются основными корегуляторами, которые изменяют структуру хроматина и влияют тем самым на транскрипцию. Согласованная работа этих комплексов необходима для активации транскрипции любого гена эукариот. В данном обзоре мы обсуждаем современные направления в исследовании модификаторов гистонов и факторов, ремоделирующих хроматин: механизмы функционирования белков и транскрипционных комплексов-пионеров; ремоделирование и модификация комплексами негистоновых белков; дополнительные функции некаталитических субъединиц ремоделирующих факторов, а также участие модификаторов гистонов в «паузе» РНК-полимеразы II. Приведены также схемы, иллюстрирующие механизмы рекрутирования основных классов факторов, ремоделирующих и модифицирующих хроматин, в различные сайты генома, а также их функциональные активности.

transcriptionchromatinenhancercoregulatorremodelingtranscriptional factorтранскрипцияхроматинэнхансеркорегуляторремоделированиетранскрипционный факторгрант Российского научного фондаgrant from the Russian Science Foundation18-14-00219Krasnov A.N., Mazina M.Y., Nikolenko J.V., Vorobyeva N.E. // Cell Biosci. 2016. V. 6. P. 15.Rybakova K.N., Bruggeman F.J., Tomaszewska A., Moné M.J., Carlberg C., Westerhoff H.V. // PLoS Comput. Biol. 2015. V. 11. № 4. P. e1004236.Wang Y., Ni T., Wang W., Liu F. // Biol. Rev. 2019. V. 94. № 1. P. 248–258.Azpeitia E., Wagner A. // Front. Mol. Biosci. 2020. V. 7. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7198700/.Harada B.T., Hwang W.L., Deindl S., Chatterjee N., Bartholomew B., Zhuang X. // eLife. 2016. V. 5. P. e10051.Yague-Sanz C., Vázquez E., Sánchez M., Antequera F., Hermand D. // Curr. Genet. 2017. V. 63. № 2. P. 187–193.Rawal Y., Chereji R.V., Qiu H., Ananthakrishnan S., Govind C.K., Clark D.J., Hinnebusch A.G. // Genes Dev. 2018. V. 32. № 9–10. P. 695–710.Dechassa M.L., Sabri A., Pondugula S., Kassabov S.R., Chatterjee N., Kladde M.P., Bartholomew B. // Mol. Cell. 2010. V. 38. № 4. P. 590–602.Mazina M.I., Vorob’eva N.E., Krasnov A.N. // Tsitologiia. 2013. V. 55. № 4. P. 218–224.Vorobyeva N.E., Mazina M.U., Golovnin A.K., Kopytova D.V., Gurskiy D.Y., Nabirochkina E.N., Georgieva S.G., Georgiev P.G., Krasnov A.N. // Nucl. Acids Res. 2013. V. 41. № 11. P. 5717–5730.Chatterjee N., Sinha D., Lemma-Dechassa M., Tan S., Shogren-Knaak M.A., Bartholomew B. // Nucl. Acids Res. 2011. V. 39. № 19. P. 8378–8391.Mitra D., Parnell E.J., Landon J.W., Yu Y., Stillman D.J. // Mol. Cell. Biol. 2006. V. 26. № 11. P. 4095–4110.Sullivan E.K., Weirich C.S., Guyon J.R., Sif S., Kingston R.E. // Mol. Cell. Biol. 2001. V. 21. № 17. P. 5826–5837.Yudkovsky N., Logie C., Hahn S., Peterson C.L. // Genes Dev. 1999. V. 13. № 18. P. 2369–2374.Zhang B., Chambers K.J., Faller D.V., Wang S. // Oncogene. 2007. V. 26. № 50. P. 7153–7157.McKnight J.N., Jenkins K.R., Nodelman I.M., Escobar T., Bowman G.D. // Mol. Cell. Biol. 2011. V. 31. № 23. P. 4746–4759.Collins N., Poot R.A., Kukimoto I., García-Jiménez C., Dellaire G., Varga-Weisz P.D. // Nat. Genet. 2002. V. 32. № 4. P. 627–632.Wysocka J., Swigut T., Xiao H., Milne T.A., Kwon S.Y., Landry J., Kauer M., Tackett A.J., Chait B.T., Badenhorst P., et al. // Nature. 2006. V. 442. № 7098. P. 86–90.Eberharter A., Ferrari S., Längst G., Straub T., Imhof A., Varga-Weisz P., Wilm M., Becker P.B. // EMBO J. 2001. V. 20. № 14. P. 3781–3788.Badenhorst P., Xiao H., Cherbas L., Kwon S.Y., Voas M., Rebay I., Cherbas P., Wu C. // Genes Dev. 2005. V. 19. № 21. P. 2540–2545.Song H., Spichiger-Haeusermann C., Basler K. // EMBO Rep. 2009. V. 10. № 10. P. 1140–1146.Siggens L., Cordeddu L., Rönnerblad M., Lennartsson A., Ekwall K. // Epigenetics Chromatin. 2015. V. 8. № 1. P. 4.Smolle M., Workman J.L. // Biochim. Biophys. Acta BBA – Gene Regul. Mech. 2013. V. 1829. № 1. P. 84–97.Bracken A.P., Brien G.L., Verrijzer C.P. // Genes Dev. 2019. V. 33. № 15–16. P. 936–959.Krietenstein N., Wal M., Watanabe S., Park B., Peterson C.L., Pugh B.F., Korber P. // Cell. 2016. V. 167. № 3. P. 709–721.e12.Udugama M., Sabri A., Bartholomew B. // Mol. Cell. Biol. 2011. V. 31. № 4. P. 662–673.Willhoft O., Wigley D.B. // Curr. Opin. Struct. Biol. 2020. V. 61. P. 50–58.Poli J., Gerhold C.-B., Tosi A., Hustedt N., Seeber A., Sack R., Herzog F., Pasero P., Shimada K., Hopfner K.-P., et al. // Genes Dev. 2016. V. 30. № 3. P. 337–354.Lafon A., Taranum S., Pietrocola F., Dingli F., Loew D., Brahma S., Bartholomew B., Papamichos-Chronakis M. // Mol. Cell. 2015. V. 60. № 5. P. 784–796.Hallson G., Hollebakken R.E., Li T., Syrzycka M., Kim I., Cotsworth S., Fitzpatrick K.A., Sinclair D.A.R., Honda B.M. // Genetics. 2012. V. 190. № 1. P. 91–100.Bae H.J., Dubarry M., Jeon J., Soares L.M., Dargemont C., Kim J., Geli V., Buratowski S. // Nat. Commun. 2020. V. 11. № 1. P. 2181.Tie F., Banerjee R., Saiakhova A.R., Howard B., Monteith K.E., Scacheri P.C., Cosgrove M.S., Harte P.J. // Dev. Camb. Engl. 2014. V. 141. № 5. P. 1129–1139.Carbonell A., Mazo A., Serras F., Corominas M. // Mol. Biol. Cell. 2013. V. 24. № 3. P. 361–372.Schurter B.T., Koh S.S., Chen D., Bunick G.J., Harp J.M., Hanson B.L., Henschen-Edman A., Mackay D.R., Stallcup M.R., Aswad D.W. // Biochemistry. 2001. V. 40. № 19. P. 5747–5756.Cheng D., Côté J., Shaaban S., Bedford M.T. // Mol. Cell. 2007. V. 25. № 1. P. 71–83.Bao J., Rousseaux S., Shen J., Lin K., Lu Y., Bedford M.T. // Nucl. Acids Res. 2018. V. 46. № 9. P. 4327–4343.Xu W., Cho H., Kadam S., Banayo E.M., Anderson S., Yates J.R., Emerson B.M., Evans R.M. // Genes Dev. 2004. V. 18. № 2. P. 144–156.Strahl B.D., Briggs S.D., Brame C.J., Caldwell J.A., Koh S.S., Ma H., Cook R.G., Shabanowitz J., Hunt D.F., Stallcup M.R., et al. // Curr. Biol. 2001. V. 11. № 12. P. 996–1000.Kwak Y.T., Guo J., Prajapati S., Park K.-J., Surabhi R.M., Miller B., Gehrig P., Gaynor R.B. // Mol. Cell. 2003. V. 11. № 4. P. 1055–1066.Zhang C., Robinson B.S., Xu W., Yang L., Yao B., Zhao H., Byun P.K., Jin P., Veraksa A., Moberg K.H. // Dev. Cell. 2015. V. 34. № 2. P. 168–180.Le Romancer M., Treilleux I., Leconte N., Robin-Lespinasse Y., Sentis S., Bouchekioua-Bouzaghou K., Goddard S., Gobert-Gosse S., Corbo L. // Mol. Cell. 2008. V. 31. № 2. P. 212–221.Tang J., Kao P.N., Herschman H.R. // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. № 26. P. 19866–19876.Sun X.-J., Wei J., Wu X.-Y., Hu M., Wang L., Wang H.-H., Zhang Q.-H., Chen S.-J., Huang Q.-H., Chen Z. // J. Biol. Chem. 2005. V. 280. № 42. P. 35261–35271.Chen K., Liu J., Liu S., Xia M., Zhang X., Han D., Jiang Y., Wang C., Cao X. // Cell. 2017. V. 170. № 3. P. 492–506.e14.Kizer K.O., Phatnani H.P., Shibata Y., Hall H., Greenleaf A.L., Strahl B.D. // Mol. Cell. Biol. 2005. V. 25. № 8. P. 3305–3316.Govind C.K., Qiu H., Ginsburg D.S., Ruan C., Hofmeyer K., Hu C., Swaminathan V., Workman J.L., Li B., Hinnebusch A.G. // Mol. Cell. 2010. V. 39. № 2. P. 234–246.Bonnet J., Wang C.-Y., Baptista T., Vincent S.D., Hsiao W.-C., Stierle M., Kao C.-F., Tora L., Devys D. // Genes Dev. 2014. V. 28. № 18. P. 1999–2012.Riss A., Scheer E., Joint M., Trowitzsch S., Berger I., Tora L. // J. Biol. Chem. 2015. V. 290. № 48. P. 28997–29009.Weake V.M., Workman J.L. // Trends Cell Biol. 2012. V. 22. № 4. P. 177–184.Jin Q., Yu L.-R., Wang L., Zhang Z., Kasper L.H., Lee J.-E., Wang C., Brindle P.K., Dent S.Y.R., Ge K. // EMBO J. 2011. V. 30. № 2. P. 249–262.Tropberger P., Pott S., Keller C., Kamieniarz-Gdula K., Caron M., Richter F., Li G., Mittler G., Liu E.T., Bühler M., et al. // Cell. 2013. V. 152. № 4. P. 859–872.Han Y., Jin Y.-H., Kim Y.-J., Kang B.-Y., Choi H.-J., Kim D.-W., Yeo C.-Y., Lee K.-Y. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008. V. 375. № 4. P. 576–580.Bedford D.C., Kasper L.H., Fukuyama T., Brindle P.K. // Epigenetics. 2010. V. 5. № 1. P. 9–15.Wang F., Marshall C.B., Ikura M. // Cell. Mol. Life Sci. CMLS. 2013. V. 70. № 21. P. 3989–4008.Kim J., Hake S.B., Roeder R.G. // Mol. Cell. 2005. V. 20. № 5. P. 759–770.Sun Z.-W., Allis C.D. // Nature. 2002. V. 418. № 6893. P. 104–108.Van Oss S.B., Shirra M.K., Bataille A.R., Wier A.D., Yen K., Vinayachandran V., Byeon I.-J.L., Cucinotta C.E., Héroux A., Jeon J., et al. // Mol. Cell. 2016. V. 64. № 4. P. 815–825.Clapier C.R., Iwasa J., Cairns B.R., Peterson C.L. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2017. V. 18. № 7. P. 407–422.Mazina M.Y., Vorobyeva N.E. // Russ. J. Genet. 2016. V. 52. № 5. P. 463–472.Mazina M.Y., Vorobyeva N.E. // Rus. J. Genet. 2016. V. 52. № 5. P. 463–472.Zaret K.S., Carroll J.S. // Genes Dev. 2011. V. 25. № 21. P. 2227–2241.Cirillo L.A., Lin F.R., Cuesta I., Friedman D., Jarnik M., Zaret K.S. // Mol. Cell. 2002. V. 9. № 2. P. 279–289.Updike D.L., Mango S.E. // PLoS Genet. 2006. V. 2. № 9. P. e161.Lupien M., Eeckhoute J., Meyer C.A., Wang Q., Zhang Y., Li W., Carroll J.S., Liu X.S., Brown M. // Cell. 2008. V. 132. № 6. P. 958–970.Hurtado A., Holmes K.A., Ross-Innes C.S., Schmidt D., Carroll J.S. // Nat. Genet. 2011. V. 43. № 1. P. 27–33.Kong S.L., Li G., Loh S.L., Sung W.-K., Liu E.T. // Mol. Syst. Biol. 2011. V. 7. P. 526.Belandia B., Orford R.L., Hurst H.C., Parker M.G. // EMBO J. 2002. V. 21. № 15. P. 4094–4103.Vicent G.P., Nacht A.S., Font-Mateu J., Castellano G., Gaveglia L., Ballaré C., Beato M. // Genes Dev. 2011. V. 25. № 8. P. 845–862.Tang L., Nogales E., Ciferri C. // Prog. Biophys. Mol. Biol. 2010. V. 102. № 2. P. 122–128.Torigoe S.E., Urwin D.L., Ishii H., Smith D.E., Kadonaga J.T. // Mol. Cell. 2011. V. 43. № 4. P. 638–648.Li M., Hada A., Sen P., Olufemi L., Hall M.A., Smith B.Y., Forth S., McKnight J.N., Patel A., Bowman G.D., et al. // eLife. 2015. V. 4. P. e06249.Manning B.J., Peterson C.L. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2014. V. 111. № 50. P. 17827–17832.Rege M., Feldman J.L., Adkins N.L., Peterson C.L. // bioRxiv. 2020. P. 2020.03.24.006205.Kia S.K., Gorski M.M., Giannakopoulos S., Verrijzer C.P. // Mol. Cell. Biol. 2008. V. 28. № 10. P. 3457–3464.Kim K.H., Kim W., Howard T.P., Vazquez F., Tsherniak A., Wu J.N., Wang W., Haswell J.R., Walensky L.D., Hahn W.C., et al. // Nat. Med. 2015. V. 21. № 12. P. 1491–1496.Kadoch C., Williams R.T., Calarco J.P., Miller E.L., Weber C.M., Braun S.M.G., Pulice J.L., Chory E.J., Crabtree G.R. // Nat. Genet. 2017. V. 49. № 2. P. 213–222.Längst G., Manelyte L. // Genes. 2015. V. 6. № 2. P. 299–324.Kadoch C., Crabtree G.R. // Sci. Adv. 2015. V. 1. № 5. P. e1500447.Moshkin Y.M., Mohrmann L., van Ijcken W.F.J., Verrijzer C.P. // Mol. Cell. Biol. 2007. V. 27. № 2. P. 651–661.Vorobyeva N.E., Soshnikova N.V., Nikolenko J.V., Kuzmina J.L., Nabirochkina E.N., Georgieva S.G., Shidlovskii Y.V. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. V. 106. № 27. P. 11049–11054.Emelyanov A.V., Vershilova E., Ignatyeva M.A., Pokrovsky D.K., Lu X., Konev A.Y., Fyodorov D.V. // Genes Dev. 2012. V. 26. № 6. P. 603–614.Torrado M., Low J.K.K., Silva A.P.G., Schmidberger J.W., Sana M., Sharifi Tabar M., Isilak M.E., Winning C.S., Kwong C., Bedward M.J., et al. // FEBS J. 2017. V. 284. № 24. P. 4216–4232.Zhang W., Aubert A., Gomez de Segura J.M., Karuppasamy M., Basu S., Murthy A.S., Diamante A., Drury T.A., Balmer J., Cramard J., et al. // J. Mol. Biol. 2016. V. 428. № 14. P. 2931–2942.Bornelöv S., Reynolds N., Xenophontos M., Gharbi S., Johnstone E., Floyd R., Ralser M., Signolet J., Loos R., Dietmann S., et al. // Mol. Cell. 2018. V. 71. № 1. P. 56–72.e4.Kwok R.S., Li Y.H., Lei A.J., Edery I., Chiu J.C. // PLoS Genet. 2015. V. 11. № 7. P. e1005307.Jordán-Pla A., Yu S., Waldholm J., Källman T., Östlund Farrants A.-K., Visa N. // BMC Genomics. 2018. V. 19. № 1. P. 367.Vorobyeva N.E., Soshnikova N.V., Kuzmina J.L., Kopantseva M.R., Nikolenko J.V., Nabirochkina E.N., Georgieva S.G., Shidlovskii Y.V. // Cell Cycle. 2009. V. 8. № 14. P. 2152–2156.Moshkin Y.M., Chalkley G.E., Kan T.W., Reddy B.A., Ozgur Z., van Ijcken W.F.J., Dekkers D.H.W., Demmers J.A., Travers A.A., Verrijzer C.P. // Mol. Cell. Biol. 2012. V. 32. № 3. P. 675–688.Vorobyeva N.E., Nikolenko J.V., Krasnov A.N., Kuzmina J.L., Panov V.V., Nabirochkina E.N., Georgieva S.G., Shidlovskii Y.V. // Cell Cycle Georget. Tex. 2011. V. 10. № 11. P. 1821–1827.Panov V.V., Kuzmina J.L., Doronin S.A., Kopantseva M.R., Nabirochkina E.N., Georgieva S.G., Vorobyeva N.E., Shidlovskii Y.V. // Nucl. Acids Res. 2012. V. 40. № 6. P. 2445–2453.Jenuwein T., Allis C.D. // Science. 2001. V. 293. № 5532. P. 1074–1080.Howe F.S., Fischl H., Murray S.C., Mellor J. // BioEssays. 2017. V. 39. № 1. P. e201600095.Musselman C.A., Lalonde M.-E., Côté J., Kutateladze T.G. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2012. V. 19. № 12. P. 1218–1227.Yun M., Wu J., Workman J.L., Li B. // Cell Res. 2011. V. 21. № 4. P. 564–578.Peña P.V., Davrazou F., Shi X., Walter K.L., Verkhusha V.V., Gozani O., Zhao R., Kutateladze T.G. // Nature. 2006. V. 442. № 7098. P. 100–103.Shi X., Hong T., Walter K.L., Ewalt M., Michishita E., Hung T., Carney D., Peña P., Lan F., Kaadige M.R., et al. // Nature. 2006. V. 442. № 7098. P. 96–99.Sims R.J., Chen C.-F., Santos-Rosa H., Kouzarides T., Patel S.S., Reinberg D. // J. Biol. Chem. 2005. V. 280. № 51. P. 41789–41792.Morettini S., Tribus M., Zeilner A., Sebald J., Campo-Fernandez B., Scheran G., Wörle H., Podhraski V., Fyodorov D.V., Lusser A. // Nucl. Acids Res. 2011. V. 39. № 8. P. 3103–3115.Lauberth S.M., Nakayama T., Wu X., Ferris A.L., Tang Z., Hughes S.H., Roeder R.G. // Cell. 2013. V. 152. № 5. P. 1021–1036.Li H., Ilin S., Wang W., Duncan E.M., Wysocka J., Allis C.D., Patel D.J. // Nature. 2006. V. 442. № 7098. P. 91–95.Li Y., Schulz V.P., Deng C., Li G., Shen Y., Tusi B.K., Ma G., Stees J., Qiu Y., Steiner L.A., et al. // Nucl. Acids Res. 2016. V. 44. № 15. P. 7173–7188.Beisel C., Paro R. // Nat. Rev. Genet. 2011. V. 12. № 2. P. 123–135.Kassis J.A., Brown J.L. // Advances in Genetics / Eds Friedmann T., Dunlap J.C., Goodwin S.F. Acad. Press, 2013. V. 81. P. 83–118. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780124076778000038.Saksouk N., Simboeck E., Déjardin J. // Epigenetics Chromatin. 2015. V. 8. № 1. P. 3.Kahn T.G., Dorafshan E., Schultheis D., Zare A., Stenberg P., Reim I., Pirrotta V., Schwartz Y.B. // Nucl. Acids Res. 2016. V. 44. № 21. P. 10132–10149.Francis N.J., Follmer N.E., Simon M.D., Aghia G., Butler J.D. // Cell. 2009. V. 137. № 1. P. 110–122.Müller-Ott K., Erdel F., Matveeva A., Mallm J.-P., Rademacher A., Hahn M., Bauer C., Zhang Q., Kaltofen S., Schotta G., et al. // Mol. Syst. Biol. 2014. V. 10. № 8. P. 746.Coulon A., Chow C.C., Singer R.H., Larson D.R. // Nat. Rev. Genet. 2013. V. 14. № 8. P. 572–584.Deal R.B., Henikoff J.G., Henikoff S. // Science. 2010. V. 328. № 5982. P. 1161–1164.Adelman K., Lis J.T. // Nat. Rev. Genet. 2012. V. 13. № 10. P. 720–731.Gaertner B., Johnston J., Chen K., Wallaschek N., Paulson A., Garruss A.S., Gaudenz K., De Kumar B., Krumlauf R., Zeitlinger J. // Cell Rep. 2012. V. 2. № 6. P. 1670–1683.Min I.M., Waterfall J.J., Core L.J., Munroe R.J., Schimenti J., Lis J.T. // Genes Dev. 2011. V. 25. № 7. P. 742–754.Vastenhouw N.L., Schier A.F. // Curr. Opin. Cell Biol. 2012. V. 24. № 3. P. 374–386.Kuroda M.I., Kang H., De S., Kassis J.A. // Annu. Rev. Biochem. 2020. V. 89. P. 235–253.Atlasi Y., Stunnenberg H.G. // Nat. Rev. Genet. 2017. V. 18. № 11. P. 643–658.Kim H.J., Kim T., Oldfield A.J., Yang P. // bioRxiv. 2020. P. 2020.10.13.338103.Chen S., Ma J., Wu F., Xiong L., Ma H., Xu W., Lv R., Li X., Villen J., Gygi S.P., et al. // Genes Dev. 2012. V. 26. № 12. P. 1364–1375.Boija A., Mahat D.B., Zare A., Holmqvist P.-H., Philip P., Meyers D.J., Cole P.A., Lis J.T., Stenberg P., Mannervik M. // Mol. Cell. 2017. V. 68. № 3. P. 491–503.e5.Gates L.A., Shi J., Rohira A.D., Feng Q., Zhu B., Bedford M.T., Sagum C.A., Jung S.Y., Qin J., Tsai M.-J., et al. // J. Biol. Chem. 2017. V. 292. № 35. P. 14456–14472.Mazina M.Yu., Kovalenko E.V., Derevyanko P.K., Nikolenko J.V., Krasnov A.N., Vorobyeva N.E. // Biochim. Biophys. Acta BBA – Gene Regul. Mech. 2018. V. 1861. № 2. P. 178–189.Chandy M., Gutiérrez J.L., Prochasson P., Workman J.L. // Eukaryot. Cell. 2006. V. 5. № 10. P. 1738–1747.Qiu H., Chereji R.V., Hu C., Cole H.A., Rawal Y., Clark D.J., Hinnebusch A.G. // Genome Res. 2016. V. 26. № 2. P. 211–225.Dion M.F., Altschuler S.J., Wu L.F., Rando O.J. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2005. V. 102. № 15. P. 5501–5506.Shahbazian M.D., Grunstein M. // Annu. Rev. Biochem. 2007. V. 76. № 1. P. 75–100.Kim J.-H., Saraf A., Florens L., Washburn M., Workman J.L. // Genes Dev. 2010. V. 24. № 24. P. 2766–2771.Daujat S., Bauer U.-M., Shah V., Turner B., Berger S., Kouzarides T. // Curr. Biol. 2002. V. 12. № 24. P. 2090–2097.Ma H., Baumann C.T., Li H., Strahl B.D., Rice R., Jelinek M.A., Aswad D.W., Allis C.D., Hager G.L., Stallcup M.R. // Curr. Biol. 2001. V. 11. № 24. P. 1981–1985.Chevillard-Briet M., Trouche D., Vandel L. // EMBO J. 2002. V. 21. № 20. P. 5457–5466.Dorafshan E., Kahn T.G., Glotov A., Savitsky M., Walther M., Reuter G., Schwartz Y.B. // EMBO Rep. 2019. V. 20. № 4. P. e46762.Hödl M., Basler K. // Curr. Biol. 2012. V. 22. № 23. P. 2253–2257.Swinstead E.E., Paakinaho V., Presman D.M., Hager G.L. // BioEssays. 2016. V. 38. № 11. P. 1150–1157.Barisic D., Stadler M.B., Iurlaro M., Schübeler D. // Nature. 2019. V. 569. № 7754. P. 136–140.Baptista T., Grünberg S., Minoungou N., Koster M.J.E., Timmers H.T.M., Hahn S., Devys D., Tora L. // Mol. Cell. 2017. V. 68. № 1. P. 130–143.e5.Chandrasekharan M.B., Huang F., Sun Z.-W. // Epigenetics. 2010. V. 5. № 6. P. 460–468.Gurskiy D., Orlova A., Vorobyeva N., Nabirochkina E., Krasnov A., Shidlovskii Y., Georgieva S., Kopytova D. // Nucl. Acids Res. 2012. V. 40. № 21. P. 10689–10700.Allen B.L., Taatjes D.J. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2015. V. 16. № 3. P. 155–166.Fant C.B., Taatjes D.J. // Transcription. 2018. https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/21541264.2018.1556915.van der Knaap J.A., Verrijzer C.P. // Genes Dev. 2016. V. 30. № 21. P. 2345–2369.Hoggard T., Fox C.A. //The Initiation of DNA Replication in Eukaryotes / Ed. Kaplan D.L. Cham. Springer Internat. Publ. 2016. P. 159–188. https://doi.org/10.1007/978-3-319-24696-3_9.Kopytova D., Popova V., Kurshakova M., Shidlovskii Y., Nabirochkina E., Brechalov A., Georgiev G., Georgieva S. // Nucl. Acids Res. 2016. V. 44. № 10. P. 4920–4933.Popova V.V., Brechalov A.V., Georgieva S.G., Kopytova D.V. // Nucleus. 2018. V. 9. № 1. P. 460–473.Fioravanti R., Stazi G., Zwergel C., Valente S., Mai A. // Chem. Rec. 2018. V. 18. № 12. P. 1818–1832.Laubach J.P., San-Miguel J.F., Hungria V., Hou J., Moreau P., Lonial S., Lee J.H., Einsele H., Alsina M., Richardson P.G. // Expert Rev. Hematol. 2017. V. 10. № 3. P. 229–237.Waring M.J., Chen H., Rabow A.A., Walker G., Bobby R., Boiko S., Bradbury R.H., Callis R., Clark E., Dale I., et al. // Nat. Chem. Biol. 2016. V. 12. № 12. P. 1097–1104.