Acta NaturaeActa NaturaeActa Naturae2075-8251Acta Naturae Ltd1104110.32607/actanaturae.11041ReviewsОбзорыReview ArticleModification of Nuclear Compartments and the 3D Genome in the Course of a Viral InfectionМодификация ядерных компартментов и 3D генома в условиях вирусной инфекцииRazinS. V.РазинC. В.
Russian Federation
sergey.v.razin@usa.netGavrilovA. A.ГавриловА. А.
Russian Federation
sergey.v.razin@usa.netIarovaiaO. V.ЯроваяО. В.
Russian Federation
sergey.v.razin@usa.netInstitute of Gene Biology Russian Academy of SciencesИнститут биологии гена РАН2212202012434460406202007072020Copyright ©; 2020, Razin S.V., Gavrilov A.A., Iarovaia O.V.Copyright ©; 2020, Разин C.В., Гаврилов А.А., Яровая О.В.2020Razin S.V., Gavrilov A.A., Iarovaia O.V.Разин C.В., Гаврилов А.А., Яровая О.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/11041

The review addresses the question of how the structural and functional compartmentalization of the cell nucleus and the 3D organization of the cellular genome are modified during the infection of cells with various viruses. Particular attention is paid to the role of the introduced changes in the implementation of the viral strategy to evade the antiviral defense systems and provide conditions for viral replication. The discussion focuses on viruses replicating in the cell nucleus. Cytoplasmic viruses are mentioned in cases when a significant reorganization of the nuclear compartments or the 3D genome structure occurs during an infection with these viruses.

В обзоре обсуждается, как изменяется структурно-функциональная компартментализация клеточного ядра и 3D-организация клеточного генома при заражении клеток различными вирусами. Особое внимание уделено тому, как вносимые изменения способствуют реализации стратегии вируса по преодолению систем противовирусной защиты и обеспечению условий для репликации вируса. Обсуждение фокусируется на вирусах, репликация которых происходит в клеточном ядре. Цитоплазматические вирусы упоминаются в тех случаях, когда в процессе инфекции происходит существенная реорганизация ядерных компартментов либо 3D генома.

nuclear compartmentalizationspatial organization of the eukaryotic genomevirus infectionкомпартментализация ядрапространственная организация геномавирусная инфекцияРФФИRussian Foundation for Basic Research18-29-07001Russian Foundation for Basic Researches 18-29-07001Российский фонд фундаментальных исследований 18-29-07001Ulianov S.V., Gavrilov A.A., Razin S.V. // Int. Rev. Cell Mol. Biol. 2015. V. 315. P. 183–244.Cremer T., Cremer C. // Nat. Rev. Genet. 2001. V. 2. P. 292–301.Cremer T., Cremer M. // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2010. V. 2. P. a003889.Cremer T., Kurz A., Zirbel R., Dietzel S., Rinke B., Schrock E., Speicher M.R., Mathieu U., Jauch A., Emmerich P., et al. // Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 1993. V. 58. P. 777–792.Cremer T., Cremer M., Hubner B., Silahtaroglu A., Hendzel M., Lanctot C., Strickfaden H., Cremer C. // Bioessays. 2020. V. 42. P. e1900132.Cremer T., Cremer M., Cremer C. // Biochemistry (Moscow). 2018. V. 83. P. 313–325.Huang S. // J. Cell. Biol. 2002. V. 157. P. 739–741.Lamond A.I., Spector D.L. // Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2003. V. 4. P. 605–612.Spector D.L., Lamond A.I. // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2011. V. 3. P. a000646.Machyna M., Heyn P., Neugebauer K.M. // Wiley Interdiscip. Rev. RNA. 2013. V. 4. P. 17–34.Wang Q., Sawyer I.A., Sung M.H., Sturgill D., Shevtsov S.P., Pegoraro G., Hakim O., Baek S., Hager G.L., Dundr M. // Nat. Commun. 2016. V. 7. P. 10966.Brown J.M., Green J., das Neves R.P., Wallace H.A., Smith A.J., Hughes J., Gray N., Taylor S., Wood W.G., Higgs D.R., et al. // J. Cell. Biol. 2008. V. 182. P. 1083–1097.Chen Y., Belmont A.S. // Curr. Opin. Genet. Dev. 2019. V. 55. P. 91–99.Lieberman-Aiden E., van Berkum N.L., Williams L., Imakaev M., Ragoczy T., Telling A., Amit I., Lajoie B.R., Sabo P.J., Dorschner M.O., et al. // Science. 2009. V. 326. P. 289–293.Dixon J.R., Selvaraj S., Yue F., Kim A., Li Y., Shen Y., Hu M., Liu J.S., Ren B. // Nature. 2012. V. 485. P. 376–380.Dixon J.R., Gorkin D.U., Ren B. // Mol. Cell. 2016. V. 62. P. 668–680.Nora E.P., Lajoie B.R., Schulz E.G., Giorgetti L., Okamoto I., Servant N., Piolot T., van Berkum N.L., Meisig J., Sedat J., et al. // Nature. 2012. V. 485. P. 381–385.Lupianez D.G., Kraft K., Heinrich V., Krawitz P., Brancati F., Klopocki E., Horn D., Kayserili H., Opitz J.M., Laxova R., et al. // Cell. 2015. V. 161. P. 1012–1025.Symmons O., Uslu V.V., Tsujimura T., Ruf S., Nassari S., Schwarzer W., Ettwiller L., Spitz F. // Genome Res. 2014. V. 24. P. 390–400.Razin S.V., Ulianov S.V. // Cell. Mol. Biol. Lett. 2017. V. 22. P. 18.Rao S.S., Huntley M.H., Durand N.C., Stamenova E.K., Bochkov I.D., Robinson J.T., Sanborn A.L., Machol I., Omer A.D., Lander E.S., et al. // Cell. 2014. V. 159. P. 1665–1680.Sanborn A.L., Rao S.S., Huang S.C., Durand N.C., Huntley M.H., Jewett A.I., Bochkov I.D., Chinnappan D., Cutkosky A., Li J., et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015. V. 112. P. E6456–E6465.Krivega I., Dean A. // Curr. Opin. Genet. Dev. 2012. V. 22. P. 79–85.Krivega I., Dean A. // Nat. Cell. Biol. 2017. V. 19. P. 883–885.Kaiser V.B., Semple C.A. // F1000Res. 2017. V. 6. P. F1000 Fac. Rev.-314.Ibrahim D.M., Mundlos S. // Curr. Opin. Cell Biol. 2020. V. 64. P. 1–9.Achinger-Kawecka J., Taberlay P.C., Clark S.J. // Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 2016. V. 81. P. 41–51.Valton A.L., Dekker J. // Curr. Opin. Genet. Dev. 2016. V. 36. P. 34–40.Hu S., Lv P., Yan Z., Wen B. // Epigenetics Chromatin. 2019. V. 12. P. 43.Quinodoz S.A., Ollikainen N., Tabak B., Palla A., Schmidt J.M., Detmar E., Lai M.M., Shishkin A.A., Bhat P., Takei Y., et al. // Cell. 2018. V. 174. P. 744–757.Chen Y., Zhang Y., Wang Y., Zhang L., Brinkman E.K., Adam S.A., Goldman R., van Steensel B., Ma J., Belmont A.S. // J. Cell. Biol. 2018. V. 217. P. 4025–4048.Xu M., Cook P.R. // J. Cell. Biol. 2008. V. 181. P. 615–623.Schoenfelder S., Fraser P. // Nat. Rev. Genet. 2019. V. 20. P. 437–455.Schoenfelder S., Sexton T., Chakalova L., Cope N.F., Horton A., Andrews S., Kurukuti S., Mitchell J.A., Umlauf D., Dimitrova D.S., et al. // Nat. Genet. 2010. V. 42. P. 53–61.Razin S.V., Gavrilov A.A., Ioudinkova E.S., Iarovaia O.V. // FEBS Lett. 2013. V. 587. P. 1840–1847.Cook P.R., Marenduzzo D. // Nucl. Acids Res. 2018. V. 46. P. 9895–9906.Iarovaia O.V., Minina E.P., Sheval E.V., Onichtchouk D., Dokudovskaya S., Razin S.V., Vassetzky Y.S. // Trends Cell. Biol. 2019. V. 29. P. 647–659.Calle A., Ugrinova I., Epstein A.L., Bouvet P., Diaz J.J., Greco A. // J. Virol. 2008. V. 82. P. 4762–4773.Salvetti A., Greco A. // Biochim. Biophys. Acta. 2014. V. 1842. P. 840–847.Rawlinson S.M., Moseley G.W. // Cell. Microbiol. 2015. V. 17. P. 1108–1120.Hiscox J.A., Whitehouse A., Matthews D.A. // Proteomics. 2010. V. 10. P. 4077–4086.Strang B.L. // J. Gen. Virol. 2015. V. 96. P. 239–252.Hiscox J.A. // Arch. Virol. 2002. V. 147. P. 1077–1089.Hiscox J.A. // Nat. Rev. Microbiol. 2007. V. 5. P. 119–127.Wang L., Ren X.M., Xing J.J., Zheng A.C. // Virol. Sin. 2010. V. 25. P. 151–157.Calderone A., Licata L., Cesareni G. // Nucl. Acids Res. 2015. V. 43. P. D588–D592.Guirimand T., Delmotte S., Navratil V. // Nucl. Acids Res. 2015. V. 43. P. D583–D587.Nouri K., Moll J.M., Milroy L.G., Hain A., Dvorsky R., Amin E., Lenders M., Nagel-Steger L., Howe S., Smits S.H., et al. // PLoS One. 2015. V. 10. P. e0143634.Reyes E.D., Kulej K., Pancholi N.J., Akhtar L.N., Avgousti D.C., Kim E.T., Bricker D.K., Spruce L.A., Koniski S.A., Seeholzer S.H., et al. // Mol. Cell Proteomics. 2017. V. 16. P. 2079–2097.Emmott E., Wise H., Loucaides E.M., Matthews D.A., Digard P., Hiscox J.A. // J. Proteome Res. 2010. V. 9. P. 5335–5345.Ni L., Wang S., Zheng C. // J. Med. Microbiol. 2012. V. 61. P. 1637–1643.Jia W., Yao Z., Zhao J., Guan Q., Gao L. // Life Sci. 2017. V. 186. P. 1–10.Chaudhry U., Malik D.A., Saleem N., Malik M.T. // EC Microbiology. 2018. V. 14. P. 631–640.Gao Z., Hu J., Wang X., Yang Q., Liang Y., Ma C., Liu D., Liu K., Hao X., Gu M., et al. // Arch. Virol. 2018. V. 163. P. 2775–2786.Dong D., Zhu S., Miao Q., Zhu J., Tang A., Qi R., Liu T., Yin D., Liu G. // J. Gen. Virol. 2020. V. 101. P. 33–43.Bian W.X., Xie Y., Wang X.N., Xu G.H., Fu B.S., Li S., Long G., Zhou X., Zhang X.L. // Nucl. Acids Res. 2019. V. 47. P. 56–68.Tosoni E., Frasson I., Scalabrin M., Perrone R., Butovskaya E., Nadai M., Palu G., Fabris D., Richter S.N. // Nucl. Acids Res. 2015. V. 43. P. 8884–8897.Kalt I., Borodianskiy-Shteinberg T., Schachor A., Sarid R. // J. Virol. 2010. V. 84. P. 2935–2945.Gouzil J., Fablet A., Lara E., Caignard G., Cochet M., Kundlacz C., Palmarini M., Varela M., Breard E., Sailleau C., et al. // J. Virol. 2017. V. 91. P. e01263–16.Banerjee R., Weidman M.K., Navarro S., Comai L., Dasgupta A. // J. Gen. Virol. 2005. V. 86. P. 2315–2322.Amineva S.P., Aminev A.G., Palmenberg A.C., Gern J.E. // J. Gen. Virol. 2004. V. 85. P. 2969–2979.Ponti D., Troiano M., Bellenchi G.C., Battaglia P.A., Gigliani F. // BMC Cell. Biol. 2008. V. 9. P. 32.Zhu C., Zheng F., Zhu J., Liu M., Liu N., Li X., Zhang L., Deng Z., Zhao Q., Liu H. // Oncotarget. 2017. V. 8. P. 94519–94527.Yan Y., Du Y., Wang G., Li K. // Sci. Rep. 2017. V. 7. P. 17761.Kao C.F., Chen S.Y., Lee Y.H. // J. Biomed. Sci. 2004. V. 11. P. 72–94.Ahuja R., Kapoor N.R., Kumar V. // Biochim. Biophys. Acta. 2015. V. 1853. P. 1783–1795.Rajput P., Shukla S.K., Kumar V. // Virol. J. 2015. V. 12. P. 62.Pyper J.M., Clements J.E., Zink M.C. // J. Virol. 1998. V. 72. P. 7697–7702.Li Y.J., Macnaughton T., Gao L., Lai M.M. // J. Virol. 2006. V. 80. P. 6478–6486.Behrens R.T., Aligeti M., Pocock G.M., Higgins C.A., Sherer N.M. // J. Virol. 2017. V. 91. P. e02107–16.Michienzi A., Cagnon L., Bahner I., Rossi J.J. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. P. 8955–8960.Zolotukhin A.S., Felber B.K. // J. Virol. 1999. V. 73. P. 120–127.Vercruysse T., Daelemans D. // Curr. HIV Res. 2013. V. 11. P. 623–634.Charman M., Weitzman M.D. // Viruses. 2020. V. 12. P. 151.Hidalgo P., Gonzalez R.A. // FEBS Lett. 2019. V. 593. P. 3518–3530.Shulla A., Randall G. // Curr. Opin. Microbiol. 2016. V. 32. P. 82–88.Crump C. // Adv. Exp. Med. Biol. 2018. V. 1045. P. 23–44.Sagou K., Uema M.,, Kawaguchi Y. // J. Virol. 2010. V. 84. P. 2110–2121.Strang B.L., Boulant S., Coen D.M. // J. Virol. 2010. V. 84. P. 1771–1784.Terrier O., Carron C., De Chassey B., Dubois J., Traversier A., Julien T., Cartet G., Proust A., Hacot S., Ressnikoff D., et al. // Sci. Rep. 2016. V. 6. P. 29006.Su W.C., Hsu S.F., Lee Y.Y., Jeng K.S., Lai M.M. // J. Virol. 2015. V. 89. P. 11245–11255.Yang C., Liu X., Gao Q., Cheng T., Xiao R., Ming F., Zhang S., Jin M., Chen H., Ma W., et al. // J. Virol. 2018. V. 92. P. e01042–18.Ruiz Z., Mihaylov I.S., Cotmore S.F., Tattersall P. // Virology. 2011. V. 410. P. 375–384.Majumder K., Wang J., Boftsi M., Fuller M.S., Rede J.E., Joshi T., Pintel D.J. // Elife. 2018. V. 7. P. e37750.Adeyemi R.O., Landry S., Davis M.E., Weitzman M.D., Pintel D.J. // PLoS Pathog. 2010. V. 6. P. e1001141.Deng X., Yan Z., Cheng F., Engelhardt J.F., Qiu J. // PLoS Pathog. 2016. V. 12. P. e1005399.Schwartz R.A., Carson C.T., Schuberth C., Weitzman M.D. // J. Virol. 2009. V. 83. P. 6269–6278.Luo Y., Chen A.Y., Qiu J. // J. Virol. 2011. V. 85. P. 133–145.McKinney C.C., Hussmann K.L., McBride A.A. // Viruses. 2015. V. 7. P. 2450–2469.Weitzman M.D., Fradet-Turcotte A. // Annu. Rev. Virol. 2018. V. 5. P. 141–164.Jang M.K., Shen K., McBride A.A. // PLoS Pathog. 2014. V. 10. P. e1004117.Jackson D.A., Hassan A.B., Errington R.J., Cook P.R. // EMBO J. 1993. V. 12. P. 1059–1065.Eskiw C.H., Rapp A., Carter D.R., Cook P.R. // J. Cell. Sci. 2008. V. 121. P. 1999–2007.Carter D.R., Eskiw C., Cook P.R. // Biochem. Soc. Trans. 2008. V. 36. P. 585–589.Chen C.P., Lyu Y., Chuang F., Nakano K., Izumiya C., Jin D., Campbell M., Izumiya Y. // J. Virol. 2017. V. 91. P. e02491–16.Baquero-Perez B., Whitehouse A. // PLoS Pathog. 2015. V. 11. P. e1005274.Li L., Johnson L.A., Dai-Ju J.Q., Sandri-Goldin R.M. // PLoS One. 2008. V. 3. P. e1491.Jenkins H.L., Spencer C.A. // J. Virol. 2001. V. 75. P. 9872–9884.Girard C., Will C.L., Peng J., Makarov E.M., Kastner B., Lemm I., Urlaub H., Hartmuth K., Luhrmann R. // Nat. Commun. 2012. V. 3. P. 994.Galganski L., Urbanek M.O., Krzyzosiak W.J. // Nucl. Acids Res. 2017. V. 45. P. 10350–10368.Simoes M., Rino J., Pinheiro I., Martins C., Ferreira F. // Viruses. 2015. V. 7. P. 4978–4996.Aspegren A., Rabino C., Bridge E. // Exp. Cell Res. 1998. V. 245. P. 203–213.Bridge E., Xia D.X., Carmo-Fonseca M., Cardinali B., Lamond A.I., Pettersson U. // J. Virol. 1995. V. 69. P. 281–290.Park R., Miller G. // J. Virol. 2018. V. 92. P. e01254–18.Jimenez-Garcia L.F., Spector D.L. // Cell. 1993. V. 73. P. 47–59.Bridge E., Riedel K.U., Johansson B.M., Pettersson U. // J. Cell. Biol. 1996. V. 135. P. 303–314.Chang L., Godinez W.J., Kim I.H., Tektonidis M., de Lanerolle P., Eils R., Rohr K., Knipe D.M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2011. V. 108. P. E136–144.Melcak I., Cermanova S., Jirsova K., Koberna K., Malinsky J., Raska I. // Mol. Biol. Cell. 2000. V. 11. P. 497–510.Spector D.L., Fu X.D., Maniatis T. // EMBO J. 1991. V. 10. P. 3467–3481.Mor A., White A., Zhang K., Thompson M., Esparza M., Munoz-Moreno R., Koide K., Lynch K.W., Garcia-Sastre A., Fontoura B.M. // Nat. Microbiol. 2016. V. 1. P. 16069.Fox A.H., Lamond A.I. // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. 2010. V. 2. P. a000687.Nakagawa S., Hirose T. // Cell. Mol. Life Sci. 2012. V. 69. P. 3027–3036.Pisani G., Baron B. // Noncoding RNA Res. 2019. V. 4. P. 128–134.Ma H., Han P., Ye W., Chen H., Zheng X., Cheng L., Zhang L., Yu L., Wu X., Xu Z., et al. // J. Virol. 2017. V. 91. P. e02250–16.Zhang Q., Chen C.Y., Yedavalli V.S., Jeang K.T. // mBio. 2013. V. 4. P. e00596–12.Saha S., Murthy S., Rangarajan P.N. // J. Gen. Virol. 2006. V. 87. P. 1991–1995.Wang Z., Fan P., Zhao Y., Zhang S., Lu J., Xie W., Jiang Y., Lei F., Xu N., Zhang Y. // Cell. Mol. Life Sci. 2017. V. 74. P. 1117–1131.Imamura K., Imamachi N., Akizuki G., Kumakura M., Kawaguchi A., Nagata K., Kato A., Kawaguchi Y., Sato H., Yoneda M., et al. // Mol. Cell. 2014. V. 53. P. 393–406.Ahn J.H., Hayward G.S. // J. Virol. 1997. V. 71. P. 4599–4613.Chelbi-Alix M.K., de The H. // Oncogene. 1999. V. 18. P. 935–941.Everett R.D., Freemont P., Saitoh H., Dasso M., Orr A., Kathoria M., Parkinson J. // J. Virol. 1998. V. 72. P. 6581–6591.Adamson A.L., Kenney S. // J. Virol. 2001. V. 75. P. 2388–2399.Everett R.D. // Oncogene. 2001. V. 20. P. 7266–7273.Tavalai N., Stamminger T. // Viruses. 2009. V. 1. P. 1240–1264.Stepp W.H., Meyers J.M., McBride A.A. // mBio. 2013. V. 4. P. e00845–13.Mitchell A.M., Hirsch M.L., Li C., Samulski R.J. // J. Virol. 2014. V. 88. P. 925–936.Bonilla W.V., Pinschewer D.D., Klenerman P., Rousson V., Gaboli M., Pandolfi P.P., Zinkernagel R.M., Salvato M.S., Hengartner H. // J. Virol. 2002. V. 76. P. 3810–3818.Boutell C., Cuchet-Lourenco D., Vanni E., Orr A., Glass M., McFarlane S., Everett R.D. // PLoS Pathog. 2011. V. 7. P. e1002245.Smith M.C., Boutell C., Davido D.J. // Future Virol. 2011. V. 6. P. 421–429.Lee H.R., Kim D.J., Lee J.M., Choi C.Y., Ahn B.Y., Hayward G.S., Ahn J.H. // J. Virol. 2004. V. 78. P. 6527–6542.Schreiner S., Wimmer P., Sirma H., Everett R.D., Blanchette P., Groitl P., Dobner T. // J. Virol. 2010. V. 84. P. 7029–7038.Leppard K.N., Emmott E., Cortese M.S., Rich T. // J. Gen. Virol. 2009. V. 90. P. 95–104.Ullman A.J., Hearing P. // J. Virol. 2008. V. 82. P. 7325–7335.Rivera-Molina Y.A., Martinez F.P., Tang Q. // World J. Virol. 2013. V. 2. P. 110–122.Ishov A.M., Maul G.G. // J. Cell. Biol. 1996. V. 134. P. 815–826.Maul G.G., Ishov A.M., Everett R.D. // Virology. 1996. V. 217. P. 67–75.Everett R.D. // PLoS Pathog. 2013. V. 9. P. e1003386.Everett R.D., Murray J. // J. Virol. 2005. V. 79. P. 5078–5089.Stubbe M., Mai J., Paulus C., Stubbe H.C., Berscheminski J., Karimi M., Hofmann S., Weber E., Hadian K., Hay R., et al. // mBio. 2020. V. 11. P. e00049–20.Reuter N., Schilling E.M., Scherer M., Muller R., Stamminger T. // J. Virol. 2017. V. 91. P. e02335–16.Schmid M., Speiseder T., Dobner T., Gonzalez R.A. // J. Virol. 2014. V. 88. P. 1404–1420.Nagaraju T., Sugden A.U., Sugden B. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2019. V. 116. P. 24630–24638.Kobiler O., Brodersen P., Taylor M.P., Ludmir E.B., Enquist L.W. // mBio. 2011. V. 2. P. e00278–11.Tomer E., Cohen E.M., Drayman N., Afriat A., Weitzman M.D., Zaritsky A., Kobiler O. // FASEB J. 2019. V. 33. P. 9388–9403.Li Z., Fang C., Su Y., Liu H., Lang F., Li X., Chen G., Lu D., Zhou J. // Virol. J. 2016. V. 13. P. 65.Taylor T.J., Knipe D.M. // J. Virol. 2004. V. 78. P. 5856–5866.Dembowski J.A., DeLuca N.A. // PLoS Pathog. 2015. V. 11. P. e1004939.Strom A.R., Brangwynne C.P. // J. Cell. Sci. 2019. V. 132. P. jcs235093.Uversky V.N. // Adv. Colloid Interface Sci. 2017. V. 239. P. 97–114.Tamarozzi E.R., Giuliatti S. // Int. J. Mol. Sci. 2018. V. 19. P. 198.Pelka P., Ablack J.N., Fonseca G.J., Yousef A.F., Mymryk J.S. // J. Virol. 2008. V. 82. P. 7252–7263.Xue B., Blocquel D., Habchi J., Uversky A.V., Kurgan L., Uversky V.N., Longhi S. // Chem. Rev. 2014. V. 114. P. 6880–6911.Peng Q., Wang L., Qin Z., Wang J., Zheng X., Wei L., Zhang X., Zhang X., Liu C., Li Z., et al. // J. Virol. 2020. V. 94. P. e01771–19.Taylor T.J., McNamee E.E., Day C., Knipe D.M. // Virology. 2003. V. 309. P. 232–247.McSwiggen D.T., Hansen A.S., Teves S.S., Marie-Nelly H., Hao Y., Heckert A.B., Umemoto K.K., Dugast-Darzacq C., Tjian R., Darzacq X. // Elife. 2019. V. 8. P. e47098.Denker A., de Laat W. // Genes Dev. 2016. V. 30. P. 1357–1382.Sati S., Cavalli G. // Chromosoma. 2017. V. 126. P. 33–44.Hensel K.O., Cantner F., Bangert F., Wirth S., Postberg J. // Epigenetics Chromatin. 2018. V. 11. P. 34.Moreau P., Cournac A., Palumbo G.A., Marbouty M., Mortaza S., Thierry A., Cairo S., Lavigne M., Koszul R., Neuveut C. // Nat. Commun. 2018. V. 9. P. 4268.Kim K.D., Tanizawa H., De Leo A., Vladimirova O., Kossenkov A., Lu F., Showe L.C., Noma K.I., Lieberman P.M. // Nat. Commun. 2020. V. 11. P. 877.Moquin S.A., Thomas S., Whalen S., Warburton A., Fernandez S.G., McBride A.A., Pollard K.S., Miranda J.L. // J. Virol. 2018. V. 92. P. e01413–17.Heinz S., Texari L., Hayes M.G.B., Urbanowski M., Chang M.W., Givarkes N., Rialdi A., White K.M., Albrecht R.A., Pache L., et al. // Cell. 2018. V. 174. P. 1522–1536.Rutkowski A.J., Erhard F., L’Hernault A., Bonfert T., Schilhabel M., Crump C., Rosenstiel P., Efstathiou S., Zimmer R., Friedel C.C., et al. // Nat. Commun. 2015. V. 6. P. 7126.Hennig T., Michalski M., Rutkowski A.J., Djakovic L., Whisnant A.W., Friedl M.S., Jha B.A., Baptista M.A.P., L’Hernault A., Erhard F., et al. // PLoS Pathog. 2018. V. 14. P. e1006954.Kanda T. // Adv. Exp. Med. Biol. 2018. V. 1045. P. 377–394.Farrell P.J. // Annu. Rev. Pathol. 2019. V. 14. P. 29–53.Sall F.B., Germini D., Kovina A.P., Ribrag V., Wiels J., Toure A.O., Iarovaia O.V., Lipinski M., Vassetzky Y. // Biochemistry (Moscow). 2018. V. 83. P. 402–410.Jiang S., Zhou H., Liang J., Gerdt C., Wang C., Ke L., Schmidt S.C.S., Narita Y., Ma Y., Wang S., et al. // Cell Host Microbe. 2017. V. 22. P. 561–573 e4.Wood C.D., Veenstra H., Khasnis S., Gunnell A., Webb H.M., Shannon-Lowe C., Andrews S., Osborne C.S., West M.J. // Elife. 2016. V. 5. P. e18270.McClellan M.J., Wood C.D., Ojeniyi O., Cooper T.J., Kanhere A., Arvey A., Webb H.M., Palermo R.D., Harth-Hertle M.L., Kempkes B., et al. // PLoS Pathog. 2013. V. 9. P. e1003636.Paschos K., Parker G.A., Watanatanasup E., White R.E., Allday M.J. // Nucl. Acids Res. 2012. V. 40. P. 7233–7246.Musinova Y.R., Sheval E.V., Dib C., Germini D., Vassetzky Y.S. // Cell. Mol. Life Sci. 2016. V. 73. P. 589–601.Germini D., Tsfasman T., Klibi M., El-Amine R., Pichugin A., Iarovaia O.V., Bilhou-Nabera C., Subra F., Bou Saada Y., Sukhanova A., et al. // Leukemia. 2017. V. 31. P. 2515–2522.Maeda N., Fan H., Yoshikai Y. // Rev. Med. Virol. 2008. V. 18. P. 387–405.Katsura Y., Asai S. // Am. J. Med. Sci. 2019. V. 358. P. 384–388.Johnson W.E. // Nat. Rev. Microbiol. 2019. V. 17. P. 355–370.Bushman F.D. // Mol. Ther. 2020. V. 28. P. 352–356.Uren A.G., Kool J., Berns A., van Lohuizen M. // Oncogene. 2005. V. 24. P. 7656–7672.Rosewick N., Durkin K., Artesi M., Marcais A., Hahaut V., Griebel P., Arsic N., Avettand-Fenoel V., Burny A., Charlier C., et al. // Nat. Commun. 2017. V. 8. P. 15264.Pattison J.M., Wright J.B., Cole M.D. // PLoS One. 2015. V. 10. P. e0120256.Zhang J., Markus J., Bies J., Paul T., Wolff L. // J. Virol. 2012. V. 86. P. 10524–10532.de Ridder J., Uren A., Kool J., Reinders M., Wessels L. // PLoS Comput. Biol. 2006. V. 2. P. e166.Babaei S., Akhtar W., de Jong J., Reinders M., de Ridder J. // Nat. Commun. 2015. V. 6. P. 6381.Shen C., Liu Y., Shi S., Zhang R., Zhang T., Xu Q., Zhu P., Chen X., Lu F. // Int. J. Cancer. 2017. V. 141. P. 540–548.Satou Y., Miyazato P., Ishihara K., Yaguchi H., Melamed A., Miura M., Fukuda A., Nosaka K., Watanabe T., Rowan A.G., et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2016. V. 113. P. 3054–3059.Melamed A., Yaguchi H., Miura M., Witkover A., Fitzgerald T.W., Birney E., Bangham C.R. // Elife. 2018. V. 7. P. e36245.Hou C., Zhao H., Tanimoto K., Dean A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. P. 20398–20403.Rawat P., Jalan M., Sadhu A., Kanaujia A., Srivastava M. // Mol. Cell. Biol. 2017. V. 37. P. e00557–16.Goodman M.A., Arumugam P., Pillis D.M., Loberg A., Nasimuzzaman M., Lynn D., van der Loo J.C.M., Dexheimer P.J., Keddache M., Bauer T.R., Jr., et al. // J/ Virol. 2018. V. 92. P. e01639–17.Goodman M.A., Arumugam P., Pillis D.M., Loberg A., Nasimuzzaman M., Lynn D., van der Loo J.C.M., Dexheimer P.J., Keddache M., Bauer T.R., Jr., et al. // J. Virol. 2018. V. 92. P. e01639–17.Caudron-Herger M., Pankert T., Rippe K. // Nucleus. 2016. V. 7. P. 308–318.Caudron-Herger M., Pankert T., Seiler J., Nemeth A., Voit R., Grummt I., Rippe K. // EMBO J. 2015. V. 34. P. 2758–2774.Schaller A.M., Tucker J., Willis I., Glaunsinger B.A. // J. Virol. 2020. JVI.00262–20Kataoka K., Nagata Y., Kitanaka A., Shiraishi Y., Shimamura T., Yasunaga J., Totoki Y., Chiba K., Sato-Otsubo A., Nagae G., et al. // Nat. Genet. 2015. V. 47. P. 1304–1315.Sokol M., Wabl M., Ruiz I.R., Pedersen F.S. // Retrovirology. 2014. V. 11. P. 36.Zhang Y., Li T., Preissl S., Amaral M.L., Grinstein J.D., Farah E.N., Destici E., Qiu Y., Hu R., Lee A.Y., et al. // Nat. Genet. 2019. V. 51. P. 1380–1388.