Acta NaturaeActa NaturaeActa Naturae2075-8251Acta Naturae Ltd1061010.32607/20758251-2012-4-4-28-46ReviewsОбзорыResearch ArticleEpigenetics of Pluripotent CellsЭпигенетика плюрипотентных клетокMedvedevS. P.МедведевС. П.
Russian Federation
zakian@bionet.nsc.ruPokushalovE. A.ПокушаловE. A.
Russian Federation
zakian@bionet.nsc.ruZakianS. M.ЗакиянС. M.
Russian Federation
zakian@bionet.nsc.ruInstitute of Cytology and Genetics, Siberian Branch, Russian Academy of SciencesИнститут цитологии и генетики СО РАНMeshalkin Novosibirsk State Research Institute of Circulation PathologyНовосибирский научно-исследовательский институт патологии кровообращения им. академика Е.Н. Мешалкина Минздравсоцразвития Российской ФедерацииInstitute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch, Russian Academy of SciencesИнститут химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН1512201244VOL 4, NO4 (2012)ТОМ 4, №4 (2012)284617012020Copyright ©; 2012, Medvedev S.P., Pokushalov E.A., Zakian S.M.Copyright ©; 2012, Медведев С.П., Покушалов E.A., Закиян С.M.2012Medvedev S.P., Pokushalov E.A., Zakian S.M.Медведев С.П., Покушалов E.A., Закиян С.M.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10610

Pluripotency is maintained by a complex system that includes the genetic and epigenetic levels. Recent studies have shown that the genetic level (transcription factors, signal pathways, and microRNAs) closely interacts with the enzymes and other specific proteins that participate in the formation of the chromatin structure. The interaction between the two systems results in the unique chromatin state observed in pluripotent cells. In this review, the epigenetic features of embryonic stem cells and induced pluripotent stem cells are considered. Special attention is paid to the interplay of the transcription factors OCT4, SOX2, and NANOG with the Polycomb group proteins and other molecules involved in the regulation of the chromatin structure. The participation of the transcription factors of the pluripotency system in the inactivation of the X chromosome is discussed. In addition, the epigenetic events taking place during reprogramming of somatic cells to the pluripotent state and the problem of “epigenetic memory” are considered.

Плюрипотентность клеток поддерживается сложнейшей системой, включающей генетический и эпигенетический уровни. Исследования последних лет показывают, что генетический уровень, включающий транскрипционные факторы, сигнальные пути и микроРНК, тесно взаимодействует с системой ферментов и других специфических белков, участвующих в формировании структуры хроматина. Взаимодействие этих двух систем формирует уникальное состояние хроматина, существующее в плюрипотентных клетках. В представленном обзоре рассмотрены особенности эпигенетики эмбриональных стволовых и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток. Особое внимание уделено взаимодействию транскрипционных факторов OCT4, SOX2 и NANOG с белками группы Polycomb и другими молекулами, участвующими в регуляции структуры хроматина. Обсуждено участие транскрипционных факторов системы поддержания плюрипотентности в процессе инактивации X-хромосомы. Рассмотрены также эпигенетические события, происходящие при репрограммировании соматических клеток к плюрипотентному состоянию, и проблемы, связанные с «эпигенетической памятью».

embryonic stem cellsinduced pluripotent stem cellspluripotencycovalent histone modificationsDNA methylationиндуцированные плюрипотентные стволовые клеткиковалентные модификации гистоновметилирование ДНКплюрипотентностьэмбриональные стволовые клеткиThis work was supported by the Russian Foundation for Basic Research (grants No. 11-04-00847-a and 12-04-00208-a) and the Program of the Russian Academy of Sciences “Molecular and Cell Biology”.Работа поддержана РФФИ(гранты № 11-04-00847-а и 12-04-00208-а), а также Программой РАН «Молекулярная и клеточная биология».Boiani M., Scholer H.R. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005. V. 6. № 11. P. 872-884.Evans M.J., Kaufman M.H. // Nature. 1981. V. 292. № 5819. P. 154-156.Martin G.R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1981. V. 78. № 12. P. 7634-7638.Thomson J.A., Itskovitz-Eldor J., Shapiro S.S., Waknitz M.A., Swiergiel J.J., Marshall V.S., Jones J.M. // Science. 1998. V. 282. № 5391. P. 1145-1147.Cohen D.E., Melton D. // Nat. Rev Genet. 2011. V. 12. № 4. P. 243-252.Grskovic M., Javaherian A., Strulovici B., Daley G.Q. //Nat. Rev. Drug. Discov. 2011. V. 10. № 12. P. 915-929.Tiscornia G., Vivas E.L., Belmonte J.C. // Nat. Med. 2011. V. 17. № 12. P. 1570-1576.Boyer L.A., Lee T.I., Cole M.F., Johnstone S.E., Levine S.S., Zucker J.P., Guenther M.G., Kumar R.M., Murray H.L., Jenner R.G., et al. // Cell. 2005. V. 122. № 6. P. 947-956.Loh Y.H., Wu Q., Chew J.L., Vega V.B., Zhang W., Chen X., Bourque G., George J., Leong B., Liu J., et al. // Nat. Genet. 2006. V. 38. № 4. P. 431-440.Takahashi K., Yamanaka S. // Cell. 2006. V. 126. № 4. P. 663-676.Takahashi K., Tanabe K., Ohnuki M., Narita M., Ichisaka T., Tomoda K., Yamanaka S. // Cell. 2007. V. 131. № 5. P. 861-872.Yu J., Vodyanik M.A., Smuga-Otto K., Antosiewicz-Bourget J., Frane J.L., Tian S., Nie J., Jonsdottir G.A., Ruotti V., Stewart R., et al. // Science. 2007. V. 318. № 5858. P. 1917-1920.Maherali N., Hochedlinger K. // Cell Stem. Cell. 2008. V. 3. № 6. P. 595-605.Anokye-Danso F., Trivedi C.M., Juhr D., Gupta M., Cui Z., Tian Y., Zhang Y., Yang W., Gruber P.J., Epstein J.A., et al. // Cell Stem. Cell. 2011. V. 8. № 4. P. 376-388.Miyoshi N., Ishii H., Nagano H., Haraguchi N., Dewi D.L., Kano Y., Nishikawa S., Tanemura M., Mimori K., Tanaka F., et al. // Cell Stem. Cell. 2011. V. 8. № 6. P. 633-638.Aasen T., Raya A., Barrero M.J., Garreta E., Consiglio A., Gonzalez F., Vassena R., Bilic J., Pekarik V., Tiscornia G., et al. // Nat. Biotechnol. 2008. V. 26. № 11. P. 1276-1284.Utikal J., Maherali N., Kulalert W., Hochedlinger K. // J. Cell Sci. 2009. V. 122. Pt 19. P. 3502-3510.Huangfu D., Osafune K., Maehr R., Guo W., Eijkelenboom A., Chen S., Muhlestein W., Melton D.A. // Nat. Biotechnol. 2008. V. 26. № 11. P. 1269-1275.Loh Y.H., Hartung O., Li H., Guo C., Sahalie J.M., Manos P.D., Urbach A., Heffner G.C., Grskovic M., Vigneault F., et al. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 7. № 1. P. 15-19.Medvedev S.P., Grigor'eva E.V., Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Dementyeva E.V., Shilov A.A., Pokushalov E.A., Zaidman A.M., Aleksandrova M.A., Plotnikov E.Y., et al. // Stem. Cells Dev. 2011. V. 20. № 6. P. 1099-1112.Stadtfeld M., Brennand K., Hochedlinger K. // Curr Biol. 2008. V. 18. № 12. P. 890-894.Hanna J., Markoulaki S., Schorderet P., Carey B.W., Beard C., Wernig M., Creyghton M.P., Steine E.J., Cassady J.P., Foreman R., et al. // Cell. 2008. V. 133. № 2. P. 250-264.Maherali N., Ahfeldt T., Rigamonti A., Utikal J., Cowan C., Hochedlinger K. // Cell Stem. Cell. 2008. V. 3. № 3. P. 340-345.Yamanaka S. // Cell. 2009. V. 137. № 1. P. 13-17.Boland M.J., Hazen J.L., Nazor K.L., Rodriguez A.R., Gifford W., Martin G., Kupriyanov S., Baldwin K.K. // Nature. 2009. V. 461. № 7260. P. 91-94.Kang L., Wang J., Zhang Y., Kou Z., Gao S. // Cell Stem. Cell. 2009. V. 5. № 2. P. 135-138.Zhao X.Y., Li W., Lv Z., Liu L., Tong M., Hai T., Hao J., Guo C.L., Ma Q.W., Wang L., et al. // Nature. 2009. V. 461. № 7260. P. 86-90.Bernstein B.E., Mikkelsen T.S., Xie X., Kamal M., Huebert D.J., Cuff J., Fry B., Meissner A., Wernig M., Plath K., et al. // Cell. 2006. V. 125. № 2. P. 315-326.Azuara V., Perry P., Sauer S., Spivakov M., Jorgensen H.F., John R.M., Gouti M., Casanova M., Warnes G., Merkenschlager M., et al. // Nat. Cell Biol. 2006. V. 8. № 5. P. 532-538.Pan G., Tian S., Nie J., Yang C., Ruotti V., Wei H., Jonsdottir G.A., Stewart R., Thomson J.A. // Cell Stem. Cell. 2007. V. 1. № 3. P. 299-312.Zhao X.D., Han X., Chew J.L., Liu J., Chiu K.P., Choo A., Orlov Y.L., Sung W.K., Shahab A., Kuznetsov V.A., et al. // Cell Stem. Cell. 2007. V. 1. № 3. P. 286-298.Creyghton M.P., Markoulaki S., Levine S.S., Hanna J., Lodato M.A., Sha K., Young R.A., Jaenisch R., Boyer L.A. // Cell. 2008. V. 135. № 4. P. 649-661.Mikkelsen T.S., Ku M., Jaffe D.B., Issac B., Lieberman E., Giannoukos G., Alvarez P., Brockman W., Kim T.K., Koche R.P., et al. // Nature. 2007. V. 448. № 7153. P. 553-560.Mohn F., Weber M., Rebhan M., Roloff T.C., Richter J., Stadler M.B., Bibel M., Schubeler D. // Mol. Cell. 2008. V. 30. № 6. P. 755-766.Liang J., Wan M., Zhang Y., Gu P., Xin H., Jung S.Y., Qin J., Wong J., Cooney A.J., Liu D., et al. // Nat. Cell. Biol. 2008. V. 10. № 6. P. 731-739.Pardo M., Lang B., Yu L., Prosser H., Bradley A., Babu M.M., Choudhary J. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 6. № 4. P. 382-395.Wang J., Rao S., Chu J., Shen X., Levasseur D.N., Theunissen T.W., Orkin S.H. // Nature. 2006. V. 444. № 7117. P. 364-368.van den Berg D.L., Snoek T., Mullin N.P., Yates A., Bezstarosti K., Demmers J., Chambers I., Poot R.A. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 6. № 4. P. 369-381.Ringrose L. // Bioessays. 2006. V. 28. № 4. P. 330-334.Ringrose L. // Curr. Opin. Cell Biol. 2007. V. 19. № 3. P. 290-297.Hauenschild A., Ringrose L., Altmutter C., Paro R., Rehmsmeier M. // PLoS Biol. 2008. V. 6. № 10. P. e261.de Napoles M., Mermoud J.E., Wakao R., Tang Y.A., Endoh M., Appanah R., Nesterova T.B., Silva J., Otte A.P., Vidal M., et al. // Dev. Cell. 2004. V. 7. № 5. P. 663-676.Wang H., Wang L., Erdjument-Bromage H., Vidal M., Tempst P., Jones R.S., Zhang Y. // Nature. 2004. V. 431. № 7010. P. 873-878.Elderkin S., Maertens G.N., Endoh M., Mallery D.L., Morrice N., Koseki H., Peters G., Brockdorff N., Hiom K. // Mol. Cell. 2007. V. 28. № 1. P. 107-120.Voncken J.W., Roelen B.A., Roefs M., de Vries S., Verhoeven E., Marino S., Deschamps J., van Lohuizen M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003. V. 100. № 5. P. 2468-2473.Lessard J., Sauvageau G. // Nature. 2003. V. 423. № 6937. P. 255-260.Park I.K., Qian D., Kiel M., Becker M.W., Pihalja M., Weissman I.L., Morrison S.J., Clarke M.F. // Nature. 2003. V. 423. № 6937. P. 302-305.Dovey J.S., Zacharek S.J., Kim C.F., Lees J.A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. № 33. P. 11857-11862.Molofsky A.V., Pardal R., Iwashita T., Park I.K., Clarke M.F., Morrison S.J. // Nature. 2003. V. 425. № 6961. P. 962-967.Liu J., Cao L., Chen J., Song S., Lee I.H., Quijano C., Liu H., Keyvanfar K., Chen H., Cao L.Y., et al. // Nature. 2009. V. 459. № 7245. P. 387-392.Endoh M., Endo T.A., Endoh T., Fujimura Y., Ohara O., Toyoda T., Otte A.P., Okano M., Brockdorff N., Vidal M., et al. // Development. 2008. V. 135. № 8. P. 1513-1524.Morey L., Pascual G., Cozzuto L., Roma G., Wutz A., Benitah S.A., Di Croce L. // Cell Stem. Cell. 2012. V. 10. № 1. P. 47-62.O'Loghlen A., Munoz-Cabello A.M., Gaspar-Maia A., Wu H.A., Banito A., Kunowska N., Racek T., Pemberton H.N., Beolchi P., Lavial F., et al. // Cell Stem. Cell. 2012. V. 10. № 1. P. 33-46.Morey L., Helin K. // Trends Biochem. Sci. 2010. V. 35. № 6. P. 323-332.Camahort R., Cowan C.A. // Cell Stem. Cell. 2012. V. 10. № 1. P. 4-6.Pasini D., Bracken A.P., Hansen J.B., Capillo M., Helin K. // Mol. Cell Biol. 2007. V. 27. № 10. P. 3769-3779.Shumacher A., Faust C., Magnuson T. // Nature. 1996. V. 383. № 6597. P. 250-253.Faust C., Schumacher A., Holdener B., Magnuson T. // Development. 1995. V. 121. № 2. P. 273-285.Chamberlain S.J., Yee D., Magnuson T. // Stem. Cells. 2008. V. 26. № 6. P. 1496-1505.Shen X., Liu Y., Hsu Y.J., Fujiwara Y., Kim J., Mao X., Yuan G.C., Orkin S.H. // Mol. Cell. 2008. V. 32. № 4. P. 491-502.Peng J.C., Valouev A., Swigut T., Zhang J., Zhao Y., Sidow A., Wysocka J. // Cell. 2009. V. 139. № 7. P. 1290-1302.Shen X., Kim W., Fujiwara Y., Simon M.D., Liu Y., Mysliwiec M.R., Yuan G.C., Lee Y., Orkin S.H. // Cell. 2009. V. 139. № 7. P. 1303-1314.Pasini D., Cloos P.A., Walfridsson J., Olsson L., Bukowski J.P., Johansen J.V., Bak M., Tommerup N., Rappsilber J., Helin K. // Nature. 2010. V. 464. № 7286. P. 306-310.Zhang Z., Jones A., Sun C.W., Li C., Chang C.W., Joo H.Y., Dai Q., Mysliwiec M.R., Wu L.C., Guo Y., et al. // Stem. Cells. 2011. V. 29. № 2. P 229-240.Li G., Margueron R., Ku M., Chambon P., Bernstein B.E., Reinberg D. // Genes Dev. 2010. V. 24. № 4. P. 368-380.Landeira D., Sauer S., Poot R., Dvorkina M., Mazzarella L., Jorgensen H.F., Pereira C.F., Leleu M., Piccolo F.M., Spivakov M., et al. // Nat. Cell Biol. 2010. V. 12. № 6. P. 618-624.Zhang Z., Jones A., Sun C.W., Li C., Chang C.W., Joo H.Y., Dai Q., Mysliwiec M.R., Wu L.C., Guo Y., et al. // Stem. Cells. 2011. V. 29. № 2. P. 229-240.Landeira D., Fisher A.G. // Trends Cell Biol. 2011. V. 21. № 2. P. 74-80.Stock J.K., Giadrossi S., Casanova M., Brookes E., Vidal M., Koseki H., Brockdorff N., Fisher A.G., Pombo A. // Nat. Cell Biol. 2007. V. 9. № 12. P. 1428-1435.Guenther M.G., Levine S.S., Boyer L.A., Jaenisch R., Young R.A. // Cell. 2007. V. 130. № 1. P. 77-88.Boyer L.A., Plath K., Zeitlinger J., Brambrink T., Medeiros L.A., Lee T.I., Levine S.S., Wernig M., Tajonar A., Ray M.K., et al. // Nature. 2006. V. 441. № 7091. P. 349-353.Lee T.I., Jenner R.G., Boyer L.A., Guenther M.G., Levine S.S., Kumar R.M., Chevalier B., Johnstone S.E., Cole M.F., Isono K., et al. // Cell. 2006. V. 125. № 2. P. 301-313.Ringrose L., Paro R. // Annu Rev. Genet. 2004. V. 38. P. 413-443.Ang Y.S., Tsai S.Y., Lee D.F., Monk J., Su J., Ratnakumar K., Ding J., Ge Y., Darr H., Chang B., et al. // Cell. 2011. V. 145. № 2. P. 183-197.Dou Y., Milne T.A., Ruthenburg A.J., Lee S., Lee J.W., Verdine G.L., Allis C.D., Roeder R.G. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2006. V. 13. № 8. P. 713-719.Cao F., Chen Y., Cierpicki T., Liu Y., Basrur V., Lei M., Dou Y. // PLoS One. 2010. V. 5. № 11. P. e14102.Pullirsch D., Hartel R., Kishimoto H., Leeb M., Steiner G., Wutz A. // Development. 2010. V. 137. № 6. P. 935-943.Wysocka J., Swigut T., Milne T.A., Dou Y., Zhang X., Burlingame A.L., Roeder R.G., Brivanlou A.H., Allis C.D. // Cell. 2005. V. 121. № 6. P. 859-872.Kim J.K., Huh S.O., Choi H., Lee K.S., Shin D., Lee C., Nam J.S., Kim H., Chung H., Lee H.W., et al. // Mol. Cell Biol. 2001. V. 21. № 22. P. 7787-7795.Wu J.I., Lessard J., Olave I.A., Qiu Z., Ghosh A., Graef I.A., Crabtree G.R. // Neuron. 2007. V. 56. № 1. P. 94-108.Wu J.I., Lessard J., Crabtree G.R. // Cell. 2009. V. 136. № 2. P. 200-206.Lessard J., Wu J.I., Ranish J.A., Wan M., Winslow M.M., Staahl B.T., Wu H., Aebersold R., Graef I.A., Crabtree G.R. // Neuron. 2007. V. 55. № 2. P. 201-215.Ho L., Jothi R., Ronan J.L., Cui K., Zhao K., Crabtree G.R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. V. 106. № 13. P. 5187- 5191.Ho L., Ronan J.L., Wu J., Staahl B.T., Chen L., Kuo A., Lessard J., Nesvizhskii A.I., Ranish J., Crabtree G.R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2009. V. 106. № 13. P. 5181-5186.Roberts C.W., Galusha S.A., McMenamin M.E., Fletcher C.D., Orkin S.H. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. № 25. P. 13796-13800.Bultman S.J., Gebuhr T.C., Pan H., Svoboda P., Schultz R.M., Magnuson T. // Genes Dev. 2006. V. 20. № 13. P. 1744-1754.Gao X., Tate P., Hu P., Tjian R., Skarnes W.C., Wang Z. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. № 18. P. 6656-6661.Guidi C.J., Sands A.T., Zambrowicz B.P., Turner T.K., Demers D.A., Webster W., Smith T.W., Imbalzano A.N., Jones S.N. // Mol. Cell Biol. 2001. V. 21. № 10. P. 3598-3603.Fazzio T.G., Huff J.T., Panning B. // Cell. 2008. V. 134. № 1. P. 162-174.Schaniel C., Ang Y.S., Ratnakumar K., Cormier C., James T., Bernstein E., Lemischka I.R., Paddison P.J. // Stem. Cells. 2009. V. 27. № 12. P. 2979-2991.Seki Y., Kurisaki A., Watanabe-Susaki K., Nakajima Y., Nakanishi M., Arai Y., Shiota K., Sugino H., Asashima M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. № 24. P. 10926-10931.Hu G., Kim J., Xu Q., Leng Y., Orkin S.H., Elledge S.J. // Genes Dev. 2009. V. 23. № 7. P. 837-848.Singhal N., Graumann J., Wu G., Arauzo-Bravo M.J., Han D.W., Greber B., Gentile L., Mann M., Scholer H.R. // Cell. 2010. V. 141. № 6. P. 943-955.He L., Liu H., Tang L. // Stem. Cell Rev. 2012. V. 8. № 1. P. 128-136.Matsuda T., Nakamura T., Nakao K., Arai T., Katsuki M., Heike T., Yokota T. // EMBO J. 1999. V. 18. № 15. P. 4261- 4269.Ho L., Miller E.L., Ronan J.L., Ho W.Q., Jothi R., Crabtree G.R. // Nat. Cell Biol. 2011. V. 13. № 8. P. 903-913.Denslow S.A., Wade P.A. // Oncogene. 2007. V. 26. № 37. P. 5433-5438.McDonel P., Costello I., Hendrich B. // Int. J. Biochem. Cell Biol. 2009. V. 41. № 1. P. 108-116.Kaji K., Caballero I.M., MacLeod R., Nichols J., Wilson V.A., Hendrich B. // Nat. Cell Biol. 2006. V. 8. № 3. P. 285-292.Zhu D., Fang J., Li Y., Zhang J. // PLoS One. 2009. V. 4. № 11. P. e7684.Kaji K., Nichols J., Hendrich B. // Development. 2007. V. 134. № 6. P. 1123-1132.Reynolds N., Salmon-Divon M., Dvinge H., Hynes-Allen A., Balasooriya G., Leaford D., Behrens A., Bertone P., Hendrich B. // EMBO J. 2011. V. 31. № 3. P. 593-605.Yildirim O., Li R., Hung J.H., Chen P.B., Dong X., Ee L.S., Weng Z., Rando O.J., Fazzio T.G. // Cell. 2011. V. 147. № 7. P. 1498-1510.Bhutani N., Burns D.M., Blau H.M. // Cell. 2011. V. 146. № 6. P. 866-872.Tahiliani M., Koh K.P., Shen Y., Pastor W.A., Bandukwala H., Brudno Y., Agarwal S., Iyer L.M., Liu D.R., Aravind L., et al. // Science. 2009. V. 324. № 5929. P. 930-935.Ito S., D'Alessio A.C., Taranova O.V., Hong K., Sowers L.C., Zhang Y. // Nature. 2010. V. 466. № 7310. P. 1129-1133.Koh K.P., Yabuuchi A., Rao S., Huang Y., Cunniff K., Nardone J., Laiho A., Tahiliani M., Sommer C.A., Mostoslavsky G., et al. // Cell Stem. Cell. 2011. V. 8. № 2. P. 200-213.Inoue A., Zhang Y. // Science. 2011. V. 334. № 6053. P. 194.Iqbal K., Jin S.G., Pfeifer G.P., Szabo P.E. // Proc. Natl.Acad. Sci. USA. 2011. V. 108. № 9. P. 3642-3647.Ikura T., Ogryzko V.V., Grigoriev M., Groisman R., Wang J., Horikoshi M., Scully R., Qin J., Nakatani Y. // Cell. 2000. V. 102. № 4. P. 463-473.Cai Y., Jin J., Tomomori-Sato C., Sato S., Sorokina I., Parmely T.J., Conaway R.C., Conaway J.W. // J. Biol. Chem. 2003. V. 278. № 44. P. 42733-42736.Sapountzi V., Logan I.R., Robson C.N. // Int. J. Biochem. Cell Biol. 2006. V. 38. № 9. P. 1496-1509.Squatrito M., Gorrini C., Amati B. // Trends Cell Biol. 2006. V. 16. № 9. P. 433-442.Herceg Z., Hulla W., Gell D., Cuenin C., Lleonart M., Jackson S., Wang Z.Q. // Nat. Genet. 2001. V. 29. № 2. P. 206-211.Gorrini C., Squatrito M., Luise C., Syed N., Perna D., Wark L., Martinato F., Sardella D., Verrecchia A., Bennett S., et al. // Nature. 2007. V. 448. № 7157. P. 1063-1067.Loh Y.H., Zhang W., Chen X., George J., Ng H.H. // Genes Dev. 2007. V. 21. № 20. P. 2545-2557.Chen X., Xu H., Yuan P., Fang F., Huss M., Vega V.B., Wong E., Orlov Y.L., Zhang W., Jiang J., et al. // Cell. 2008. V. 133. № 6. P. 1106-1117.Sims R.J., 3rd, Chen C.F., Santos-Rosa H., Kouzarides T., Patel S.S., Reinberg D. // J. Biol. Chem. 2005. V. 280. № 51. P. 41789-41792.Gaspar-Maia A., Alajem A., Polesso F., Sridharan R., Mason M.J., Heidersbach A., Ramalho-Santos J., McManus M.T., Plath K., Meshorer E., et al. // Nature. 2009. V. 460. № 7257. P. 863-868.Kooistra S.M., van den Boom V., Thummer R.P., Johannes F., Wardenaar R., Tesson B.M., Veenhoff L.M., Fusetti F., O'Neill L.P., Turner B.M., et al. // Stem. Cells. 2010. V. 28. № 10. P. 1703-1714.Nishimoto M., Fukushima A., Okuda A., Muramatsu M. // Mol. Cell Biol. 1999. V. 19. № 8. P. 5453-5465.Cedar H., Bergman Y. // Nat. Rev. Genet. 2009. V. 10. № 5. P. 295-304.Bestor T.H. // Hum. Mol. Genet. 2000. V. 9. № 16. P. 2395-2402.Li E., Bestor T.H., Jaenisch R. // Cell. 1992. V. 69. № 6. P. 915-926.Lippman Z., Gendrel A.V., Black M., Vaughn M.W., Dedhia N., McCombie W.R., Lavine K., Mittal V., May B., Kasschau K.D., et al. // Nature. 2004. V. 430. № 6998. P. 471-476.Okano M., Bell D.W., Haber D.A., Li E. // Cell. 1999. V. 99. № 3. P. 247-257.Reik W. // Nature. 2007. V. 447. № 7143. P. 425-432.Straussman R., Nejman D., Roberts D., Steinfeld I., Blum B., Benvenisty N., Simon I., Yakhini Z., Cedar H. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2009. V. 16. № 5. P. 564-571.Fouse S.D., Shen Y., Pellegrini M., Cole S., Meissner A., van Neste L., Jaenisch R., Fan G. // Cell Stem. Cell. 2008. V. 2. № 2. P. 160-169.Hattori N., Nishino K., Ko Y.G., Ohgane J., Tanaka S., Shiota K. // J. Biol. Chem. 2004. V. 279. № 17. P. 17063-17069.Hattori N., Imao Y., Nishino K., Ohgane J., Yagi S., Tanaka S., Shiota K. // Genes Cells. 2007. V. 12. № 3. P. 387-396.Li J.Y., Pu M.T., Hirasawa R., Li B.Z., Huang Y.N., Zeng R., Jing N.H., Chen T., Li E., Sasaki H., et al. // Mol. Cell Biol. 2007. V. 27. № 24. P. 8748-8759.Li E., Beard C., Jaenisch R. // Nature. 1993. V. 366. № 6453. P. 362-365.Kaneda M., Okano M., Hata K., Sado T., Tsujimoto N., Li E., Sasaki H. // Nature. 2004. V. 429. № 6994. P. 900-903.Ueda Y., Okano M., Williams C., Chen T., Georgopoulos K., Li E. // Development. 2006. V. 133. № 6. P. 1183-1192.Tsumura A., Hayakawa T., Kumaki Y., Takebayashi S., Sakaue M., Matsuoka C., Shimotohno K., Ishikawa F., Li E., Ueda H.R., et al. // Genes Cells. 2006. V. 11. № 7. P. 805-814.Feldman N., Gerson A., Fang J., Li E., Zhang Y., Shinkai Y., Cedar H., Bergman Y. // Nat. Cell Biol. 2006. V. 8. № 2. P. 188-194.Bird A. // Genes Dev. 2002. V. 16. № 1. P. 6-21.Meissner A., Mikkelsen T.S., Gu H., Wernig M., Hanna J., Sivachenko A., Zhang X., Bernstein B.E., Nusbaum C., Jaffe D.B., et al. // Nature. 2008. V. 454. № 7205. P. 766-770.Thomson J.P., Skene P.J., Selfridge J., Clouaire T., Guy J., Webb S., Kerr A.R., Deaton A., Andrews R., James K.D., et al. // Nature. 2010. V. 464. № 7291. P. 1082-1086.Ooi S.K., Qiu C., Bernstein E., Li K., Jia D., Yang Z., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Lin S.P., Allis C.D., et al.// Nature. 2007. V. 448. № 7154. P. 714-717.Ramsahoye B.H., Biniszkiewicz D., Lyko F., Clark V., Bird A.P., Jaenisch R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. № 10. P. 5237-5242.Lister R., Pelizzola M., Dowen R.H., Hawkins R.D., Hon G., Tonti-Filippini J., Nery J.R., Lee L., Ye Z., Ngo Q.M., et al. // Nature. 2009. V. 462. № 7271. P. 315-322.Lister R., Pelizzola M., Kida Y.S., Hawkins R.D., Nery J.R., Hon G., Antosiewicz-Bourget J., O'Malley R., Castanon R., Klugman S., et al. // Nature. 2011. V. 471. № 7336. P. 68-73.Ziller M.J., Muller F., Liao J., Zhang Y., Gu H., Bock C., Boyle P., Epstein C.B., Bernstein B.E., Lengauer T., et al. // PLoS Genet. 2011. V. 7. № 12. P. e1002389.Mikkelsen T.S., Hanna J., Zhang X., Ku M., Wernig M., Schorderet P., Bernstein B.E., Jaenisch R., Lander E.S., Meissner A. // Nature. 2008. V. 454. № 7200. P. 49-55.Lagarkova M.A., Shutova M.V., Bogomazova A.N., Vassina E.M., Glazov E.A., Zhang P., Rizvanov A.A., Chestkov I.V., Kiselev S.L. // Cell Cycle. 2010. V. 9. № 5. P. 937-946.Okita K., Ichisaka T., Yamanaka S. // Nature. 2007. V. 448. № 7151. P. 313-317.Bhutani N., Brady J.J., Damian M., Sacco A., Corbel S.Y., Blau H.M. // Nature. 2010. V. 463. № 7284. P. 1042-1047.Shi Y., Desponts C., Do J.T., Hahm H.S., Scholer H.R., Ding S. // Cell Stem. Cell. 2008. V. 3. № 5. P. 568-574.Sado T., Wang Z., Sasaki H., Li E. // Development. 2001. V. 128. № 8. P. 1275-1286.Mak W., Nesterova T.B., de Napoles M., Appanah R., Yamanaka S., Otte A.P., Brockdorff N. // Science. 2004. V. 303. № 5658. P. 666-669.Okamoto I., Otte A.P., Allis C.D., Reinberg D., Heard E. // Science. 2004. V. 303. № 5658. P. 644-649.Chureau C., Prissette M., Bourdet A., Barbe V., Cattolico L., Jones L., Eggen A., Avner P., Duret L. // Genome Res. 2002. V. 12. № 6. P. 894-908.Brockdorff N., Ashworth A., Kay G.F., McCabe V.M., Norris D.P., Cooper P.J., Swift S., Rastan S. // Cell. 1992. V. 71. № 3. P. 515-526.Lee J.T., Davidow L.S., Warshawsky D. // Nat. Genet. 1999. V. 21. № 4. P. 400-404.Lee J.T., Lu N. // Cell. 1999. V. 99. № 1. P. 47-57.Silva S.S., Rowntree R.K., Mekhoubad S., Lee J.T. //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008. V. 105. № 12. P. 4820-4825.Maherali N., Sridharan R., Xie W., Utikal J., Eminli S., Arnold K., Stadtfeld M., Yachechko R., Tchieu J., Jaenisch R., et al. // Cell Stem. Cell. 2007. V. 1. № 1. P. 55-70.Tchieu J., Kuoy E., Chin M.H., Trinh H., Patterson M., Sherman S.P., Aimiuwu O., Lindgren A., Hakimian S., Zack J.A., et al. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 7. № 3. P. 329-342.Lengner C.J., Gimelbrant A.A., Erwin J.A., Cheng A.W., Guenther M.G., Welstead G.G., Alagappan R., Frampton G.M., Xu P., Muffat J., et al. // Cell. 2010. V. 141. № 5. P. 872-883.Hanna J., Cheng A.W., Saha K., Kim J., Lengner C.J., Soldner F., Cassady J.P., Muffat J., Carey B.W., Jaenisch R. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. № 20. P. 9222-9227.Navarro P., Chambers I., Karwacki-Neisius V., Chureau C., Morey C., Rougeulle C., Avner P. // Science. 2008. V. 321. № 5896. P. 1693-1695.Navarro P., Moffat M., Mullin N.P., Chambers I. // Hum. Genet. 2011. V. 130. № 2. P. 255-264.Barakat T.S., Gunhanlar N., Pardo C.G., Achame E.M., Ghazvini M., Boers R., Kenter A., Rentmeester E., Grootegoed J.A., Gribnau J. // PLoS Genet. 2011. V. 7. № 1. P. e1002001.Orkin S.H., Hochedlinger K. // Cell. 2011. V. 145. № 6. P. 835-850.Navarro P., Oldfield A., Legoupi J., Festuccia N., Dubois A., Attia M., Schoorlemmer J., Rougeulle C., Chambers I., Avner P. // Nature. 2010. V. 468. № 7322. P. 457-460.Donohoe M.E., Silva S.S., Pinter S.F., Xu N., Lee J.T. // Nature. 2009. V. 460. № 7251. P. 128-132.Tesar P.J., Chenoweth J.G., Brook F.A., Davies T.J., Evans E.P., Mack D.L., Gardner R.L., McKay R.D. // Nature. 2007. V. 448. № 7150. P. 196-199.Mattout A., Biran A., Meshorer E. // J. Mol. Cell Biol. 2011. V. 3. № 6. P. 341-350.Shi Y., Do J.T., Desponts C., Hahm H.S., Scholer H.R., Ding S. // Cell Stem. Cell. 2008. V. 2. № 6. P. 525-528.Huangfu D., Maehr R., Guo W., Eijkelenboom A., Snitow M., Chen A.E., Melton D.A. // Nat. Biotechnol. 2008. V. 26. № 7. P. 795-797.Mali P., Chou B.K., Yen J., Ye Z., Zou J., Dowey S., Brodsky R.A., Ohm J.E., Yu W., Baylin S.B., et al. // Stem. Cells. 2010. V. 28. № 4. P. 713-720.Wang T., Chen K., Zeng X., Yang J., Wu Y., Shi X., Qin B., Zeng L., Esteban M.A., Pan G., et al. // Cell Stem. Cell. 2011. V. 9. № 6. P. 575-587.Esteban M.A., Wang T., Qin B., Yang J., Qin D., Cai J., Li W., Weng Z., Chen J., Ni S., et al. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 6. № 1. P. 71-79.Hong H., Takahashi K., Ichisaka T., Aoi T., Kanagawa O., Nakagawa M., Okita K., Yamanaka S. // Nature. 2009. V. 460. № 7259. P. 1132-1135.Kawamura T., Suzuki J., Wang Y.V., Menendez S., Morera L.B., Raya A., Wahl G.M., Belmonte J.C. // Nature. 2009. V. 460. № 7259. P. 1140-1144.Marion R.M., Strati K., Li H., Murga M., Blanco R., Ortega S., Fernandez-Capetillo O., Serrano M., Blasco M.A. // Nature. 2009. V. 460. № 7259. P. 1149-1153.Li H., Collado M., Villasante A., Strati K., Ortega S., Canamero M., Blasco M.A., Serrano M. // Nature. 2009. V. 460. № 7259. P. 1136-1139.Ruiz S., Panopoulos A.D., Herrerias A., Bissig K.D., Lutz M., Berggren W.T., Verma I.M., Izpisua Belmonte J.C. // Curr. Biol. 2011. V. 21. № 1. P. 45-52.Onder T.T., Kara N., Cherry A., Sinha A.U., Zhu N., Bernt K.M., Cahan P., Mancarci O.B., Unternaehrer J., Gupta P.B., et al. // Nature. 2012. V. 483. № 7391. P. 598-602.Guenther M.G., Frampton G.M., Soldner F., Hockemeyer D., Mitalipova M., Jaenisch R., Young R.A. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 7. № 2. P. 249-257.Chin M.H., Mason M.J., Xie W., Volinia S., Singer M., Peterson C., Ambartsumyan G., Aimiuwu O., Richter L., Zhang J., et al. // Cell Stem. Cell. 2009. V. 5. № 1. P. 111-123.Newman A.M., Cooper J.B. // Cell Stem. Cell. 2010. V. 7. № 2. P. 258-262.Bock C., Kiskinis E., Verstappen G., Gu H., Boulting G., Smith Z.D., Ziller M., Croft G.F., Amoroso M.W., Oakley D.H., et al. // Cell. 2011. V. 144. № 3. P. 439-452.Nishino K., Toyoda M., Yamazaki-Inoue M., Fukawatase Y., Chikazawa E., Sakaguchi H., Akutsu H., Umezawa A. // PLoS Genet. 2011. V. 7. № 5. P. e1002085.Kim K., Doi A., Wen B., Ng K., Zhao R., Cahan P., Kim J., Aryee M.J., Ji H., Ehrlich L.I., et al. // Nature. 2010. V. 467. № 7313. P. 285-290.Bar-Nur O., Russ H.A., Efrat S., Benvenisty N. // Cell Stem. Cell. 2011. V. 9. № 1. P. 17-23.Stadtfeld M., Apostolou E., Akutsu H., Fukuda A., Follett P., Natesan S., Kono T., Shioda T., Hochedlinger K. // Nature. 2010. V. 465. № 7295. P. 175-181.Polo J.M., Liu S., Figueroa M.E., Kulalert W., Eminli S., Tan K.Y., Apostolou E., Stadtfeld M., Li Y., Shioda T., et al. // Nat. Biotechnol. 2010. V. 28. № 8. P. 848-855.Marchetto M.C., Yeo G.W., Kainohana O., Marsala M., Gage F.H., Muotri A.R. // PLoS One. 2009. V. 4. № 9. P. e7076.Hu Q., Friedrich A.M., Johnson L.V., Clegg D.O. // Stem. Cells. 2010. V. 28. № 11. P. 1981-1991.Kim K., Zhao R., Doi A., Ng K., Unternaehrer J., Cahan P., Hongguang H., Loh Y.H., Aryee M.J., Lensch M.W., et al. // Nat. Biotechnol. 2011. V. 29. № 12. P. 1117-1119.