Acta NaturaeActa NaturaeActa Naturae2075-8251Acta Naturae Ltd1054610.32607/20758251-2014-6-2-48-52Research ArticlesЭкспериментальные статьиResearch ArticleHigh-throughput Method of One-Step DNA Isolation for PCR Diagnostics of Mycobacterium tuberculosisВысокоэффективный метод одностадийного выделения ДНК для ПЦР-диагностики Mycobacterium tuberculosisKapustinD. V.КапустинД. В.
Russian Federation
kapustin@ibch.ruProstyakovaA. I.ПростяковаА. И.
Russian Federation
kapustin@ibch.ruAlexeevYa. I.АлексеевЯ. И.
Russian Federation
kapustin@ibch.ruVarlamovD. A.ВарламовД. А.
Russian Federation
kapustin@ibch.ruZubovV. P.ЗубовВ. П.
Russian Federation
kapustin@ibch.ruZavrievS. K.ЗавриевС. К.
Russian Federation
kapustin@ibch.ruM.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry of the Russian Academy of SciencesИнститут биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАНZAO SINTOLЗАО «Синтол»Russian National Research Institute of Agricultural Biotechnology of the Russian Academy of Agricultural SciencesВсероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии РАСХ1506201462VOL 6, NO2 (2014)ТОМ 6, №2 (2014)485217012020Copyright ©; 2014, Kapustin D.V., Prostyakova A.I., Alexeev Y.I., Varlamov D.A., Zubov V.P., Zavriev S.K.Copyright ©; 2014, Капустин Д.В., Простякова А.И., Алексеев Я.И., Варламов Д.А., Зубов В.П., Завриев С.К.2014Kapustin D.V., Prostyakova A.I., Alexeev Y.I., Varlamov D.A., Zubov V.P., Zavriev S.K.Капустин Д.В., Простякова А.И., Алексеев Я.И., Варламов Д.А., Зубов В.П., Завриев С.К.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10546

The efficiency of one-step and multi-step protocols of DNA isolation from lysed sputum samples containing the Mycobacterium tuberculosis complex has been compared. DNA was isolated using spin-cartridges containing a special silica-based sorbent modified with fluoroplast and polyaniline, or using an automated isolation system. One-step isolation using the obtained sorbent has been shown to ensure a significantly lower DNA loss and higher sensitivity in the PCR detection of Mycobacterium tuberculosis as compared to a system based on sorption and desorption of nucleic acids during the isolation.

Сравнили эффективность выделения ДНК Mycobacterium tuberculosis complex из лизированных образцов мокроты двумя способами с помощью спин-картриджей, содержащих сорбент на основе кремнезема, модифицированного фторопластом и полианилином, и с помощью автоматической системы выделения. Показано, что при одностадийном выделении с использованием сорбента существенно снижаются потери ДНК и обеспечивается большая чувствительность выявления ДНК M. tuberculosis complex по сравнению с системой, основанной на сорбции и десорбции нуклеиновых кислот в ходе выделения.

composite sorbentsDNA isolationPCR diagnosticsMycobacterium tuberculosis complexfluoropolymerspolyanilineвыделение ДНКкомпозиционные сорбентыMycobacterium tuberculosis complexполианилинПЦР-диагностикафторполимерыThis work was partially supported by a grant from the European Committee DIAGNOSIS (contract № LSHB-CT-037212).Работа частично поддержана грантом Европейской комиссии DIAGNOSIS (договор № LSHB-CT-037212).[1] Vogelstein B., Gillespie D. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1979, V.76, P.615-619[2] Boom R., Sol C.J.A., Salimans M.M.M., Jansen C.L., Wertheim-van Dillen P.M.E., van der Noordaa J. // J. Clin. Microbiol. 1990, V.28, P.495-503[3] Park M.E., Chang J.H. // Biomimetic and Supramolecular Systems. // Mater. Sci. Eng. C. 2007, V.27, №5-8, P.1232-1235[4] Cady N.C., Stelick S., Batt C.A. // Biosens. Bioelectron. 2003, V.19, P.59-66[5] Craig J.M., Kraus J., Cremer T. // Hum. Genet. 1997, V.100, P.472-476[6] Kapustin D.V., Saburov V.V., Zavada L.L., Evstratov A.V., Barsamyan G.B., Zubov V.P. // Rus. J. Bioorgan. Chem. 1998, V.24, P.770-777[7] Kapustin D.V., Yagudaeva E.Yu., Zavada L.L., Zhigis L.S., Zubov V.P., Yaroshevskaya E.M., Plobner L., Leiser R.-M., Brem G. // Rus. J. Bioorgan. Chem. 2003, V.29, P.281-285[8] Yagudaeva E.Yu., Muydinov M.R., Kapustin D.V., Zubov V.P. // Russ. Chem. Bull. Int. Ed. 2007, V.56, №6, P.1166-1173[9] Kapustin D., Prostyakova A., Bryk Ya., Yagudaeva E., Zubov V. // Nanocomposites and polymers with analytical methods / Ed. Cuppoletti J. Croatia: Intech 2011, P.83-106[10] Kapustin D.V., Prostyakova A.I., Ryazantcev D.Yu., Zubov V.P. // Nanomedicine. 2011, V.6, №2, P.241-255[11] Kapustin D., Prostyakova A., Zubov V. // Zing Conferences. Polymer Chemistry Conference. 12-16 November 2012. Cancun. Mexico. Stow Cum Quy, UK, 2012, P.42