The development of high-throughput technologies is increasingly resulting in identification of numerous cases of low correlation between mRNA and the protein level in cells. These controversial observations were made on various bacteria, such as E. coli, Desulfovibrio vulgaris, and Lactococcus lactis. Thus, it is important to develop technologies, including high-throughput techniques, aimed at studying gene expression regulation at the level of translation. In the current study, we performed proteomic profiling of M. gallisepticum ribosomes and identified high abundant noncanonical proteins. We found that binding of mRNAs to ribosomes is mainly determined by two parameters: (1) abundance of mRNA itself and (2) complimentary interactions between the 3’ end of 16S rRNA and the ribosome binding site in the 5’-untranslated region of mRNA.
Успешное применение высокопроизводительных технологий все чаще приводит к обнаружению случаев низкой корреляции между уровнем мРНК и белков в клетках. Это явление, противоречащее классическим представлениям, обнаружено у ряда бактерий, таких, как Escherichia coli, Desulfovibrio vulgaris и Lactococcus lactis. Поэтому важной представляется разработка технологий исследования механизмов регуляции экспрессии генов на уровне трансляции, в том числе высокопроизводительными методами. Проведено протеомное профилирование рибосом Mycoplasma gallisepticum, обнаружен ряд неканонических белков, связанных с рибосомами в большом количестве. Показано, что количество мРНК, связанной с рибосомами, определяется, в основном, двумя параметрами: уровнем транскрипции гена этой мРНК и эффективностью комплементарных взаимодействий между 3’-концом 16S рРНК и сайтом связывания рибосомы в 5’-нетранслируемой области мРНК.