Acta NaturaeActa NaturaeActa Naturae2075-8251Acta Naturae Ltd1046910.32607/20758251-2016-8-1-111-116Research ArticlesЭкспериментальные статьиResearch ArticleCombinations of Polymorphic Markers of Chemokine Genes, Their Receptors and Acute Phase Protein Genes As Potential Predictors of Coronary Heart DiseasesСочетания полиморфных маркеров генов белков острой фазы воспаления, хемокинов и их рецепторов как потенциальные предикторы ишемической болезни сердцаNasibullinT. R.НасибуллинT. Р.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruYagafarovaL. F.ЯгафароваЛ. Ф.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruYagafarovI. R.ЯгафаровИ. Р.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruTimashevaYa. R.ТимашеваЯ. Р.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruErdmanV. V.ЭрдманВ. В.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruTuktarovaI. A.ТуктароваИ. A.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruMustafinaO. E.МустафинаO. E.
Russian Federation
NasibullinTR@yandex.ruInstitute of Biochemistry and Genetics, Ufa Research Center of the Russian Academy of SciencesИнститут биохимии и генетики Уфимского научного центра РАНMedical and sanitary unit of PJSC “Tatneft” and the city of AlmetyevskМедико-санитарная часть ОАО «Татнефть» и г. Альметьевска1503201681VOL 8, NO1 (2016)ТОМ 8, №1 (2016)11111617012020Copyright ©; 2016, Nasibullin T.R., Yagafarova L.F., Yagafarov I.R., Timasheva Y.R., Erdman V.V., Tuktarova I.A., Mustafina O.E.Copyright ©; 2016, Насибуллин T.Р., Ягафарова Л.Ф., Ягафаров И.Р., Тимашева Я.Р., Эрдман В.В., Туктарова И.A., Мустафина O.E.2016Nasibullin T.R., Yagafarova L.F., Yagafarov I.R., Timasheva Y.R., Erdman V.V., Tuktarova I.A., Mustafina O.E.Насибуллин T.Р., Ягафарова Л.Ф., Ягафаров И.Р., Тимашева Я.Р., Эрдман В.В., Туктарова И.A., Мустафина O.E.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10469

Atherosclerosis, the main factor in the development of coronary heart diseases (CHD), is an inflammatory response to endothelial layer damage in the arterial bed. We have analyzed the association between CHD and the polymorphic markers of genes that control the synthesis of proteins involved in the processes of adhesion and chemotaxis of immunocompetent cells: rs1024611 (-2518A>G, CCL2 gene), rs1799864 (V64I, CCR2 gene), rs3732378 (T280M, CX3CR1 gene), rs1136743 (A70V, SAA1 gene), and rs1205 (2042C>T, CRP gene) in 217 patients with CHD and 250 controls. Using the Monte Carlo method and Markov chains (APSampler), we revealed a combination of alleles/genotypes associated with both a reduced and increased risk of CHD. The most significant alleles/genotypes areSAA1*T/T+CRP*C+CX3CR1*G/A (Pperm = 0.0056, OR = 0.07 95%CI 0.009-0.55),SAA1*T+CRP*T+CCR2*G/A+CX3CR1*G (Pperm = 0.0063, OR = 14.58 95%CI 1.88-113.04), SAA1*T+CCR2*A+CCL2* G/G (Pperm = 0.0351, OR = 10.77 95%CI 1.35-85.74).

Атеросклероз, основной фактор развития ишемической болезни сердца (ИБС), представляет собой воспалительную реакцию на повреждение эндотелиального слоя в артериальном русле. Нами проведен анализ ассоциаций с ИБС полиморфных маркеров генов, контролирующих синтез белков, участвующих в процессах адгезии и хемотаксиса иммунокомпетентных клеток: rs1024611 (-2518A>G, ген CCL2), rs1799864 (V64I, ген CCR2), rs3732378 (T280M, ген CX3CR1), rs1136743 (A70V, ген SAA1), rs1205 (2042C>T, ген CRP) у 217 больных ИБС и 250 человек контрольной группы. С помощью метода Монте-Карло и цепей Маркова (APSampler) выявлены сочетания аллелей/генотипов, ассоциированные как с пониженным, так и с повышенным риском ИБС. Наиболее значимыми оказались: SAA1*T/T+CRP*C+CX3CR1*G/A (Pperm = 0.0056, OR = 0.07 95%CI 0.009-0.55), SAA1*T+CRP*T+CCR2*G/A+CX3CR1*G (Pperm = 0.0063, OR = 14.58 95%CI 1.88- 113.04), SAA1*T+CCR2*A+CCL2*G/G (Pperm = 0.0351, OR = 10.77 95%CI 1.35-85.74).

coronary heart diseasegenetic polymorphismcomplex traitsAPSamplerгенетический полиморфизмсложные признакиAPSamplerThe study was performed with the equipment provided by USC “Complex equipment for the study of nucleic acids – KODINC” and Biomika (Department of biochemical research methods and nanobiotechnology RTSKP Agidel).Исследование выполнено с использованием оборудования ЦКП «Биомика» (Отделение биохимических методов исследований и нанобиотехнологии РЦКП «Агидель») и УНУ «КОДИНК».[1] Ross R. // Nature 1993, V.362, P.801-809[2] Han K.H., Tangirala R.K., Green S.R., Quehenberger O. // Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 1998, V.18, №12, P.1983-1991[3] Zhang S., Wang X., Zhang L., Yang X., Pan J., Ren G. // J. Atherosclerosis Thrombosis. 2011, V.18, №10, P.846-856[4] Haskell C.A., Cleary M.D., Charo I.F. // J. Biol. Chem. 2000, V.275, №44, P.34183-34189[5] White G.E., Greaves D.R. // Arteriosclerosis, Thrombosis and Vascular Biology. 2012, V.32, №3, P.589-594[6] Pasceri V., Willerson J.T., Yeh E.T. // Circulation. 2000, V.102, №18, P.2165-2168[7] Pasceri V., Cheng J.S., Willerson J.T., Yeh E.T. // Circulation. 20011, V.103, №21, P.2531-2534[8] Gouwy M., Buck M., Pörtner N., Opdenakker G., Proost P., Struyf S., Damme J. // Eur. J. Immunol. 2015, V.45, №1, P.101-112[9] Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. // Molecular Cloning. N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989. 1989, V.2, P.14-9.23[10] Favorov A.V., Andreewski T.V., Sudomoina M.A., Favorova O.O., Parmigiani G., Ochs M.F. // Genetics. 2005, V.171, №4, P.2113-2121[11] Myakotkin V.A., Muravyev Yu.V., Alekseyeva A.V., Kadnikova V.A., Polyakov A. V. // Nauchno-prakticheskaya revmatologiya. 2012, V.53, №4, P.40-43[12] Yilmaz E., Balci B., Kutlay S., Ozen S., Erturk S., Oner A., Besbas N., Bakkaloglu A. // Turkish J. Pediatrics. 2003, V.45, №3, P.198-202[13] van Lenten B.J., Hama S.Y., de Beer F., Stafforini D.M., McIntyre T.M., Prescott S.M., La Du B.N., Fogelman A.M., Navab M. // J. Clin. Invest. 1995, V.96, №6, P.2758-2767[14] Zimlichman S., Danon A., Nathan I., Mozes G., Shainkin-Kestenbaum R. // J. Lab. Clin. Med. 1990, V.116, №2, P.180-186[15] Stonik J.A., Remaley A.T., Demosky S.J., Neufeld E.B., Bocharov A., Brewer H.B. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, V.321, №4, P.936-941[16] Kolz M., Koenig W., Müller M., Andreani M., Greven S., Illig T., Khuseyinova N., Panagiotakos D., Pershagen G., Salomaa V. // Eur. Heart J. 2008, V.29, №10, P.1250-1258[17] Eiriksdottir G., Smith A.V., Aspelund T., Hafsteinsdottir S.H., Olafsdottir E., Launer L.J., Harris T.B., Gudnason V. // Int. J. Obes. 2009, V.33, №2, P.267-272[18] Lange L.A., Carlson C.S., Hindorff L.A., Lange E.M., Walston J., Durda J.P., Cushman M., Bis J.C., Zeng D., Lin D. // JAMA. 2006, V.296, №22, P.2703-2711[19] Hatzis G., Tousoulis D., Papageorgiou N., Miliou A., Bouras G., Tsioufis C., Sinetos A., Latsios G., Siasos G., Stefanadis C. // J. Am. Coll. Cardiol. 2012, V.59, №13, E1413[20] Papaoikonomou S., Tousoulis D., Tentolouris N., Papageorgiou N., Miliou A., Androulakis E., Antoniades C., Stefanadis C. // J. Diabetes Metab. 2015, V.6, №4, P.529[21] Hein T. W., Singh U., Vasquez-Vivar J., Devaraj S., Kuo L., Jialal I. // Atherosclerosis. 2009, V.206, №1, P.61-68[22] Teupser D., Weber O., Rao T.N., Sass K., Thiery J., Fehling H.J. // J. Biol. Chem. 2011, V.286, №8, P.6272-6279[23] Torzewski M., Reifenberg K., Cheng F., Wiese E., Küpper I., Crain J., Lackner K.J., Bhakdi S. // Thromb. Haemost. 2008, V.99, №1, P.196-201[24] Tabuchi M., Inoue K., Usui-Kataoka H., Kobayashi K., Teramoto M., Takasugi K., Shikata K., Yamamura M., Ando K., Nishida K. // J. Lipid Res. 2007, V.48, №4, P.768-781[25] Lei Z.B., Zhang Z., Jing Q., Qin Y.W., Pei G., Cao B.Z., Li X.Y. // Cardiovascular Res. 2002, V.53, №2, P.524-532[26] Amberger A., Maczek C., Jürgens G., Michaelis D., Schett G., Trieb K., Eberl T., Jindal S., Xu Q., Wick G. // Cell Stress Chaperones. 1997, V.2, №2, P.94-103[27] Barlic J., Zhang Y., Murphy P.M. // J. Biol. Chem. 2007, V.282, №26, P.19167-19176[28] Arakelyan A., Zakharyan R., Hambardzumyan M., Petrkova J., Olsson M.C., Petrek M., Boyajyan A. // J. Interferon Cytokine Res. 2014, V.34, №2, P.100-105[29] Bai X.Y., Li S., Wang M., Qu X., Hu G., Xu Z., Chen M., He G.W., Wu H. // Ann. Hum. Genet. 2015, V.79, №3, P.173-187[30] Katrancioglu N., Manduz S., Karahan O., Yilmaz M. B., Sezgin I., Bagci G., Berkan O. // Angiolog. 2011, V.62, №2, P.140-143[31] Petrkova J., Cermakova Z., Drabek J., Lukl J., Petrek M. // Immunol. Lett. 2003, V.88, №1, P.53-55[32] Zakharyan R., Boyajyan A., Arakelyan A., Melkumova M., Mrazek F., Petrek M. // Cytokine. 2012, V.58, №3, P.351-354[33] McDermott D.H., Yang Q., Kathiresan S., Cupples L.A., Massaro J.M., Keaney J.F., Larson M.G., Vasan R.S., Hirschhorn J.N., O’Donnell C.J., Murphy Ph.M., Benjamin E. J. // Circulation 2005, V.112, №8, P.1113-1120[34] Rovin B.H., Lu L., Saxena R. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, V.259, №2, P.344-348[35] Nasibullin T. R., Sadikova R. I., Timasheva Y. R., Tuktarova I. A., Erdman V. V., Khusainova L. N., Nikolaeva I. E., Mustafina O. E. // Russian Journal of Genetics. 2014, V.50, №2, P.211-217[36] Timasheva Y. R., Nasibullin T. R., Tuktarova I. A., Erdman V. V., Nikolaeva I. E., Mustafina O. E. // Molecular medicine. 2015, №3, P.62-64[37] McDermott D.H., Fong A.M., Yang Q., Sechler J.M., Cupples L.A., Merrell M.N., Wilson P.W., D’Agostino R.B., O’Donnell C.J., Patel D.D., Murphy P.M. // J. Clin. Invest. 2003, V.111, №8, P.1241-1250[38] Shah R., Hinkle C.C., Ferguson J.F., Mehta N.N., Li M., Qu L., Lu Y., Putt M.E., Ahima R.S., Reilly M.P. // Diabetes. 2011, V.60, №5, P.1512-1518[39] Wu J., Yin R.X., Lin Q.Z., Guo T., Shi G.Y., Sun J.Q., Shen S.W., Li Q. // Disease Markers. 2014, V.2014, P.1-13