<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Acta Naturae</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Acta Naturae</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Acta Naturae</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2075-8251</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Acta Naturae Ltd</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">10427</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.32607/20758251-2016-8-4-100-109</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Research Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Экспериментальные статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Evolution of Tumor Clones in Adult Acute Lymphoblastic Leukemia</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Эволюция опухолевых клонов при остром лимфобластном лейкозе взрослых</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Smirnova</surname><given-names>S. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Смирнова</surname><given-names>С. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>dusha@blood.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sidorova</surname><given-names>Yu. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сидорова</surname><given-names>Ю. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>dusha@blood.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ryzhikova</surname><given-names>N. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Рыжикова</surname><given-names>Н. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>dusha@blood.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sychevskaya</surname><given-names>K. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сычевская</surname><given-names>K. A.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>dusha@blood.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Parovichnikova</surname><given-names>E. N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Паровичникова</surname><given-names>E. Н.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>dusha@blood.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sudarikov</surname><given-names>A. B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Судариков</surname><given-names>A. Б.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>dusha@blood.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">National Hematology Research Center</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Гематологический научный центр Министерства здравоохранения РФ</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Lomonosov Moscow State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2016-12-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>12</month><year>2016</year></pub-date><volume>8</volume><issue>4</issue><issue-title xml:lang="en">VOL 8, NO4 (2016)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">ТОМ 8, №4 (2016)</issue-title><fpage>100</fpage><lpage>109</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2020-01-17"><day>17</day><month>01</month><year>2020</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2016, Smirnova S.Y., Sidorova Y.V., Ryzhikova N.V., Sychevskaya K.A., Parovichnikova E.N., Sudarikov A.B.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2016, Смирнова С.Ю., Сидорова Ю.В., Рыжикова Н.В., Сычевская K.A., Паровичникова E.Н., Судариков A.Б.</copyright-statement><copyright-year>2016</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Smirnova S.Y., Sidorova Y.V., Ryzhikova N.V., Sychevskaya K.A., Parovichnikova E.N., Sudarikov A.B.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Смирнова С.Ю., Сидорова Ю.В., Рыжикова Н.В., Сычевская K.A., Паровичникова E.Н., Судариков A.Б.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10427">https://actanaturae.ru/2075-8251/article/view/10427</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Clonal instability of a tumor cell population in acute lymphoblastic leukemia (ALL) may complicate the monitoring of a minimal residual disease (MRD) by means of patient-specific targets identified at the disease onset. Most of the data concerning the possible instability of rearranged clonal TCR and IG genes during disease recurrence were obtained for ALL in children. The appropriate features of adult ALL, which are known to differ from those of childhood ALL in certain biological characteristics and prognosis, remain insufficiently studied. The aim of this study was to assess the stability of IG and TCR gene rearrangements in adult ALL. Rearrangements were identified according to the BIOMED-2 protocol (PCR followed by fragment analysis). Mismatch in clonal rearrangements at onset and relapse was identified in 83% of patients, indicating clonal instability during treatment. Clonal evolution and diversity of IG and TCR gene rearrangements may be one of the tumor progression mechanisms. New rearrangements may emerge due to residual VDJ-recombinase activity in tumor cells. Also, many clonal IG and TCR gene rearrangements may be present at different levels at a diagnosis, but less abundant clones may be “invisible” due to limited detection sensitivity. Later, major clones may disappear in the course of chemotherapy, while others may proliferate. Investigation of clonal evolution and heterogeneity in ALL and their impact on the treatment efficacy will contribute to the identification of new prognostic factors and the development of therapeutic approaches.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Нестабильность клонального состава популяции опухолевых клеток при острых лимфобластных лейкозах (ОЛЛ) усложняет процесс контроля минимальной остаточной болезни (МОБ) и эффективности терапии по установленным в дебюте заболевания мишеням, специфичным для данного пациента. Основные работы, в которых изучали эволюцию опухолевых клеток со сменой клональных реаранжировок генов TCR и IG в рецидиве заболевания, выполнены на детских ОЛЛ. Данные для взрослых больных ОЛЛ ограничены,тогда как ОЛЛ у взрослых и детей имеют различия в особенностях биологии и прогноза заболевания. Цель нашей работы состояла в изучении клональных реаранжировок генов IG и TCR и их стабильности у взрослых больных с ОЛЛ. Реаранжировки выявляли методом ПЦР по протоколу BIOMED-2 с последующим анализом фрагментов. У 83% пациентов выявили несоответствие клональных реаранжировок в дебюте и рецидиве заболевания. Клональная эволюция может быть одним из механизмов опухолевой прогрессии. Не исключена изначальная неоднородность состава опухолевых клеток, и в то время как одни клоны исчезают под воздействием терапии, другие, не распознанные из-за недостаточной чувствительности метода, приобретают способность к пролиферации. Кроме того, в течение заболевания реаранжировки могут меняться благодаря сохраняющейся активности рекомбиназного комплекса, что приводит к появлению опухолевых клонов de novo. Изучение механизмов клональной эволюции, способности терапии влиять на процессы клональной эволюции позволит выделить новые прогностические факторы, разработать тактику диагностики МОБ, расширит современные представления о механизмах онкогенеза.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>acute lymphoblastic leukemia</kwd><kwd>relapse</kwd><kwd>PCR</kwd><kwd>IG and TCR gene rearrangements</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>острый лимфобластный лейкоз</kwd><kwd>рецидив</kwd><kwd>ПЦР</kwd><kwd>реаранжировки генов IG</kwd><kwd>реаранжировки генов TCR</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>[1] Felix C. // Acute lymphoblastic leukemia in infants. Washington: Education Program Book of hematology, American society of hematology, 2015. 2015, P.285-302</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>[2] Parovichnikova E.N., Troitskaya V.V., Sokolov A.N., Akhmerzaeva Z.Kh., Kuzmina L.A., Mendeleeva L.P., Klyasova G.A., Kravchenko S.K., Gribanova E.O., Bondarenko S.N. // Oncohematology. 2014, №3, P.6-15</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>[3] Campana D., Pui C. // Blood. 1995, V.85, №6, P.1416-1434</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>[4] Copelan E., McGuire E. // Blood. 1995, V.85, №5, P.1151-1168</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>[5] Flohr T., Schrauder A., Cazzaniga G., Panzer-Grümayer R., van der Velden V., Fischer S., Stanulla M., Basso G., Niggli FK., Schäfer BW. // Leukemia. 2008, V.22, №4, P.771-782</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>[6] Brüggemann M., Raff T., Flohr T., Gökbuget N., Nakao M., Droese J., Lüschen S., Pott C., Ritgen M., Scheuring U. // Blood. 2006, V.107, №3, P.1116-1123</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>[7] van Dongen J.J., van der Velden V.H., Brüggemann M., Orfao A. // Blood. 2015, V.125, №26, P.3996-4009</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>[8] van der Velden V.H., Hochhaus A., Cazzaniga G., Szczepanski T., Gabert J., van Dongen J.J. // Leukemia. 2003, V.17, P.1013-1034</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>[9] van Dongen J.J., Langerak A.W., Bruggemann M., Evans P.A.S., Hummel M., Lavender F.L., Delabesse E., Davi F., Schuuring E., García-Sanz R. // Leukemia. 2003, V.17, №12, P.2257-2317</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>[10] Pongerse-Willemse M.J., Seriu T., Stolz F., d’Aniello E., Gameiro P., Pisa P., Gonzalez M., Bartram C.R., Panzer-Grümayer E.R., Biondi A. // Leukemia. 1999, V.13, P.110-118</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>[11] Szczepański T., van der Velden V.H., Raff T., Jacobs D.C., van Wering E.R., Brüggemann M., Kneba M., van Dongen J.J. // Leukemia. 2003, V.17, №11, P.2149-2156</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>[12] Szczepanski T., van der Velden V.H., Waanders E., Kuiper R.P., van Vlierberghe P., Gruhn B., Eckert C., Panzer-Grümayer R., Basso G., Cavé H. // ClinOncol. 2011, V.29, №12, P.1643-1649</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>[13] Beishuizen A., Verhoeven M.A., van Wering E.R., Hahlen K., Hooijkaas H., van Dongen J.J. // Blood. 1994, V.83, №8, P.2238-2247</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>[14] Aihong Li Jianbiao Z., David Z., Montse R., Virginia D., Cheryl L., Lewis B.S., Stephen E. S., John G.G. // Blood. 2003, V.102, №13, P.4520-4526</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>[15] Szczepański T., Willemse M.J., Brinkhof B., van Wering E.R., van der Burg M., van Dongen J.J. // Blood. 2002, V.99, №7, P.2315-2323</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>[16] van der Velden V.H., Szczepanski T., Wijkhuijs J.M., Wijkhuijs J.M., Hart P.G., Hoogeveen P.G., Hop W.C.J., van Wering E.R., van Dongen J.J.M. // Leukemia. 2003, V.17, №9, P.1834-1844</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>[17] Beishuizen A., Hahlen K., Hagemeijer A., Verhoeven M.A., Hooijkaas H., Adriaansen H.J., Wolvers-Tettero I.L., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Leukemia. 1991, V.5, №8, P.657-667</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>[18] Beishuizen A., de Bruijn M.A., Pongers-Willemse M.J., Verhoeven M.A.J., van Wering E.R., Hählen K., Breit T.M., de Bruin-Versteeg S., Hooijkaas H., van Dongen J.J.M. // Leukemia. 1997, V.11, №12, P.2200-2207</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>[19] Bruggemann M., van der Velden V.H., Raff T., Droese J., Ritgen M., Pott C., Wijkhuijs A.J., Gökbuget N., Hoelzer D., van Wering E.R. // Leukemia. 2004, V.18, №4, P.709-719</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>[20] Breit T.M., WolVers-Tettero I.L., Beishuizen A., Verhoeven M.A., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Blood. 1993, V.82, №10, P.3063-3074</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>[21] Szczepański T., Langerak A.W., Willemse M.J., Wolvers-Tettero I.L., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Leukemia. 2000, V.14, №7, P.1208-1214</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>[22] van der Velden V.H., Wijkhuijs J.M., Jacobs D.C., van Wering E.R., van Dongen J.J. // Leukemia. 2002, V.16, №7, P.1372-1380</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>[23] Willemse M.J., Seriu T., Hettinger K., d’Aniello E., Hop W.C., Panzer-Grümayer E.R., Biondi A., Schrappe M., Kamps W.A., Masera G. // Blood. 2002, V.99, №12, P.4386-4393</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>[24] Germano G., del Giudice L., Palatron S., Giarin E., Cazzaniga G., Biondi A., Basso G.. // Leukemia. 2003, V.17, №8, P.1573-1582</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>[25] Sidorova Yu.V., Sorokina T.V., Biderman B.V., Nikulina E.E., Kisilichina D.G., Naumova E.V., Pochtar’ M.E., Lugovskaya S.A., Ivanova V.L., Kovaleva L.G. // Klin Lab Diagn. 2011, №12, P.22-35</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>[26] Dongen J.J., Langerak A.W., Bruggemann M., Evans P.A., Hummel M., Lavender F.L., Delabesse E., Davi F., Schuuring E., García-Sanz R. // Leukemia. 2003, V.17, №12, P.2257-2317</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>[27] Lo Nigro L., Cazzaniga G., Di Cataldo A., Pannunzio A., D’Aniello E., Masera G., Schiliró G., Biondi A. // Leukemia. 1999, V.13, P.190-195</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>[28] Eckert C., Flohr T., Koehler R., Hagedorn N., Moericke A., Stanulla M., Kirschner-Schwabe R., Cario G., Stackelberg A., Bartram C.R. // Leukemia. 2011, V.25, №8, P.1305-1313</mixed-citation></ref><ref id="B29"><label>29.</label><mixed-citation>[29] Choi S., Henderson M.J., Kwan E., Beesley A.H., Sutton R., Bahar A.Y., Giles J., Venn N.C., Pozza L.D., Baker D.L. // Blood. 2007, V.110, №2, P.632-639</mixed-citation></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>[30] Mullighan C.G., Zhang J., Kasper L.H., Lerach S., Payne-Turner D., Phillips L.A., Heatley S.L., Holmfeldt L., Collins-Underwood J.R., Ma J. // Nature 2011, V.471, №7337, P.235-239</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>[31] Gawad C., Pepin F., Carlton V.E., Klinger M., Logan A.C., Miklos D.B., Faham M., Dahl G., Lacayo N. // Blood. 2012, V.120, №22, P.4407-4417</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>[32] Li A., Zhou J., Zuckerman D., Rue M., Dalton V., Lyons C., Silverman L.B., Sallan S.E., Gribben J.G. // Blood. 2003, V.102, №13, P.4520-4526</mixed-citation></ref><ref id="B33"><label>33.</label><mixed-citation>[33] de Haas V., Verhagen O.J., von dem Borne A.E., Kroes W., van den Berg H., van der Schoot C.E. // Leukemia. 2001, V.15, №1, P.134-140</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
